Частоты генотипов и аллелей генов цитокинов (мужчины, Москва)

 

 

SNP

Генотипы

N

Частоты, %

Частоты аллелей, %

P*

Частоты** аллелей у европеоидов, %

IFN-γ (+874 Т>A) rs2430561
A/A
67
23.8
A– 46.4
T – 53.6
0.476

T/A
127
45.2
T/T
87
31.0
IL-1α (-889 C>T)  rs1800587 
C/C
140
49.1
C- 69,8
T -30,2
0,837
C – 70.8
T – 29.2
C/T
118
41.4
T/T
27
9.5
IL-1β (-511 G>A)    rs16944 
A/A
29
10.2
A– 31,7
G – 68,3
0,960
A – 25.8
G – 74.2
G/A
122
43.0
G/G
133
46.8
IL-4 (-590 C>T)   rs2243250 
C/C
171
60.4
C – 77,7
T – 22,3
0,995
C – 90.3
T –     9.7
C/T
98
34.6
T/T
14
4.9
IL-6 (-174 G>C)   rs1800795 
C/C
61
21.4
C – 45,8
G – 54,2
0,245
C – 50.0
G – 50.0
G/C
139
48.8
G/G
85
29.8
IL-10 (-592 C>A)   rs1800872 
A/A
23
8.1
A – 27,4
C – 72,6
0,893
A – 29.0
C – 71.0
C/A
110
38.6
C/C
152
53.3
IL-18 (-607 G>T)   rs1946518 
G/G
85
30.1
G – 55,0
T – 45,5
0,979
G – 61.7
T – 38.3
T/G
140
49.6
T/T
57
20.2
TNFα (-308 G>A)   rs1800629 

A/A

4

1.4

A – 13,4

G – 86,6

0,941

A – 16.1

G – 83.9

G/A

68

23.9

G/G

212

74.6

 

* Значимость отклонения от равновесия по Харди–Вайнбергу

** по db500Cancer (http://snp500cancer.nci.nih.gov/)

Источник: Сафонова А. В. , Петрин А. Н., Арутюнов С. Д., Царев В.Н., Акуленко Л. В.,  Зорина  О. А.,  Ребриков Д. В. , Рубанович А. В. , Боринская  С. А., Янковский  Н. К. Ассоциация аллелей генов цитокинов с воспалительными заболеваниями пародонта у человека // Acta Naturae, 2011. Т. 3, № 1 (8).  С. 133-139.