Лаборатория анализа генома
зав. лаб. - Николай Казимирович Янковский
профессор, доктор биологических наук,
член-корреспондент РАН
Лаборатория анализа генома была создана в 1991 г.
Сотрудники:
- Боринская Светлана Александровна, к.б.н., в.н.с. Публикации
- Игнатов Константин Борисович, к.бн., с.н.с.
- Кимм Анна Александровна, м.н.с.
- Крамаров Владимир Матвеевич, к.б.н., с.н.с.
- Попов Василий Николаевич, ст. лаб
- Савина Лариса Грачиевна, вед. сп.
- Санина Екатерина Дмитриевна, н.с.
Основные направления научных исследований:
- Характеристика популяций и населения мегаполисов РФ по аллелям локусов, используемых для ДНК-идентификации в судебно-медицинской экспертизе;
- Популяционно-генетическое разнообразие по полиморфным ДНК-маркерам в населении России и сопредельных стран и природные и антропогенные факторы его формирования;
- Факторы формирования генофондов популяций: сравнительный анализ финно-угорских и восточно-славянских групп;
- Исследование носительства генотипа СС по полиморфизму C/T-13910 в регуляторном участке гена лактазы LCT как фактора риска развития остеопороза в российских популяциях
Важнейшие результаты:
- Впервые дана характеристика 16 популяций Российской Федерации по панели 15 STR маркеров, применяемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе. Выявлены значительные отличия российских популяций от референтной базы США, в настоящее время используемой в практике судебной экспертизы РФ. Создана база данных по частотам аллелей этих микросателлитных локусов, используемых в ДНК-идентификации и судебной медицине, которая может являться референтной для проведения судебно-медицинских экспертиз в России.
- База данных частот аллелей STR-маркеров "ДНК-идентификация RusDNAid"
- Определено географическое распределение частот протективных в отношении алкоголизма аллелей генов алкогольдегидрогеназы ADH1B и альдегиддегидрогеназы ALDH2 в популяциях России и других группах Евразии. Показано, что по частотам аллелей этих генов, а следовательно и по определяемому ими особенностям метаболизма алокголя, русские не отличаются от других европейских популяций.
- Установлен характер географического распределения аллелей полиморфизму C/T-13910 в регуляторном участке гена лактазы LCT. Показано, что частоты генотипа С/С по полиморфизму С/Т -13910 гена LCT в популяциях европейской части России совпадают с частотами клинически диагностированной гиполактазии в тех же группах, то есть, что генотип С/С по полиморфизму С/Т -13910 регуляторного участка гена LCT является основным, а возможно, и единственным генетическим детерминантом первичной гиполактазии в популяциях европейской части России.
- Установлен характер географического распределения частот аллелей гена аполипопротеина Е АРОЕ.
Частоты аллелей в популяциях России и мира
Сотрудничество (совместные публикции, заявки на гранты):
в ИОГен – лаб. Е.И.Рогаева, О.В.Жуковой, А.В. Рубановича, группа О.П.Балановского
В РФ –Е.К.Хуснутдинова (ИБГ УНЦ РАН, Уфа), В.П.Пузырев (ИМГ СО РАМН, Томск), А.Н.Петрин (МГМСУ, Москва), В.А.Кошечкин (РУДН)
Международное – К.Кидд (Йельский университет, США), Д.Леон (Лондонская школа гигиены и тропической медицины, Англия)
Публикации лаборатории анализа генома 2006- 2010 гг.
2011
Боринская С.А., Кожекбаева Ж.М., Залесов А.В. , Ользеева Е.В., Максимов А.Р., Куцев С. И., Гараев М.М., Рубанович А.В., Янковский Н.К. Снижение риска инфицирования ВИЧ и летальности у гетерозигот по делеционному аллелю гена хемокинового рецептора CCR5delta32: исследование случая фокусной нозокомиальной ВИЧ-инфекции и мета-анализ // Aсta Naturae, 2012, Т. 4 № 1 (12). С. 36-46.
Боринская С.А., Ким А.А., Кальина Н.Р., Ширманов В.И., Кошечкин В.А., Янковский Н.К. Геногеографическое распределение частот аллелей генов метаболизма алкоголя и возможные факторы его формирования // Экологическая генетика, 2011 том IX, вып. 3 С. 47- 56
Козлов А.И., Боринская С.А., Санина Е.Д. «Экономный генотип» ε4/ε4 по гену APOE и риск метаболических нарушений в популяциях уральских народов// Экологическая генетика, том IX № 2 2011, 17-23.
Степанов В.А., Балановский О. П., Мельников А.В., Лаш-Завада А.Ю., Харьков В.Н., Тяжелова Т.В., Ахметова В. Л., Жукова О. В., Шнейдер Ю. В., Шильникова И. Н., Боринская С. А., Марусин А. В., Спиридонова М. Г., Симонова К. В., Хитринская И. Ю., Раджабов М. О., Романов А. Г., Штыгашева О. В., Кошель С. М., Балановская Е. В., Рыбакова А. В., Хуснутдинова Э. К., Пузырев В. П., Янковский Н. К. Характеристика популяций Российской Федерации по панели пятнадцати локусов, используемых для ДНК-идентификации и в судебно-медицинской экспертизе // Acta Naturаe. 2011. Т. 3. № 2 (9). С. 59-71.
Царёв В.Н., Николаева Е.Н., Петрин А.Н. Боринская С.А., Янковский Н.К. и др. Аллельный профиль цитокинов у мужчин с гингивитом и здоровым пародонтом // Ж. Стоматолог/ №1,2011, 56-62.
Сафонова А. В. , Петрин А. Н., Арутюнов С. Д., Царев В.Н., Акуленко Л. В., Зорина О. А., Ребриков Д. В. , Рубанович А. В. , Боринская С. А., Янковский Н. К. Ассоциация аллелей генов цитокинов с воспалительными заболеваниями пародонта у человека // Acta Naturae, 2011. Т. 3, № 1 (8). С. 133-139.
2010
Stepanov VA, Melnikov AV, Lash-Zavada AY, Kharkov VN, Borinskaya SA, Tyazhelova TV, Zhukova OV, Schneider YV, Shil'nikova IN, Puzyrev VP, Rybakova AA, Yankovsky NK. Genetic variability of 15 autosomal STR loci in Russian populations //Leg Med (Tokyo). 2010 Sep;12(5):256-8.
Гейко А. В., Голенкина С.А., Кальина Н.Р., Тяжелова Т.В., Боринская С.А., Григоренко А.П., Рогаев Е.И. Тестирование новых маркеров пола в популяционных выборках человека. //Медицинская генетика (2010), Т. 9, 8. с. 45-47.
Петрин А,Н., Боринская С.А., Сафонова А.В., Акуленко Л.В., Тарлычева Л.В. Генетические факторы предрасположенности к остеопорозу // Российский медицинский журнал. 2010.-N 2.-С.53-56.
ЯнковскийН. К., Боринская С. А. Эволюция генофондов: популяционные и локус-специфические процессы // Дарвиновский сборник (Питер), 2010 222-231 // Чарльз Дарвин и современная биология. Труды международной научной конференции (21–23 сентября 2009 г., Санкт-Петербург) Отв.редактор-составитель Э. И. Колчинский, Редактор-составитель А. А. Федотова. Санкт-Петербург 2010
2009
Боринская С.А., Козлов А.И., Янковский Н.К. Гены и традиции питания. // Этнографическое обозрение. 2009. № 3, 117-137.
Li H., Borinskaya S., Yoshimura K., Kal'ina N., Marusin A., Stepanov V., Qin Zh., Khaliq Sh., Lee M.-Y., Yang Y., Mohyuddin A., Gurwitz D., Qasim Mehdi S., Rogaev E., Jin L., Yankovsky N., Kidd J., Kidd K. Refined Geographic Distribution of the Oriental ALDH2*504Lys (nee 487Lys) Variant// Ann Hum Genet 2009 73 (3): 335-345
Nikolskaya T, Nikolsky Y, Serebryiskaya T, Zvereva S, Sviridov E, Dezso Z, Rahkmatulin E, Brennan RJ, Yankovsky N, Bhattacharya SK, Agapova O, Hernandez MR, Shestopalov VI. Network analysis of human glaucomatous optic nerve head astrocytes. // BMC Med Genomics. 2009; 2:24.
Григоренко А.П., Боринская С.А., Янковский Н.К., Рогаев Е.И. Достижения и особенности в работе с древней ДНК и с ДНК из сложных криминалистических образцов. // Acta Naturae 2009, № 3, 56-68.
Величковский Б.Б., Боринская С.А., Вартанов А.В., Гаврилова С.А., Прохорчук Е.Б., Рогаев Е.И., Рощина И.Ф., Величковский Б.М. Нейрокогнитивные особенности носителей аллеля ?4 гена аполипопротеина Е (APOE) // Теоретическая и экспериментальная психололгия. 2009, № 4 НЕ ВАКовский журнал
Петрин А,Н., Акуленко Л.В., Сафонова А.В., Арутюнов С.Д., Боринская С.А., Арутюнов С.Д. Генетические факторы предрасположенности к пародонтиту. Стоматолог, № 4, 2009, 32-38.
Боринская С.А. Популяционно-генетические исследования в реконструкции расселения человека и доместикации животных и растений. Стр 73-81. // В сб.: Проблемы математической истории под ред. Малинецкого Г.Г., Коротаева А.В. ИПМ РАН, М., Книжный дом Либроком. 2009 256 стр.
Янковский Н.К., Боринская С.А. Генетические исследования как основа интеграции наук о жизни и человеке // Вестник ВОГиС, 2009, Том 13, № 2 384-389
2008
Balanovsky O, Rootsi S, Pshenichnov A, Kivisild T, Churnosov M, Evseeva I, Pocheshkhova E, Boldyreva M, Yankovsky N, Balanovska E, Villems R. Two sources of the Russian patrilineal heritage in their Eurasian context. // Am J Hum Genet. 2008; 82(1):236-50.
Kozlov A. Borinskaya S., Vershubsky G., Vasilyev E., Popov V. , Sokolova M., Sanina E., Kaljina N., Rebrikov D., Lisitsyn D., Yankovsky N. Genes related to metabolism of nutrients in population of Kola Sami // Int J Circumpolar Health. 2008 67 (1): 56-66
Делягин В.М. , Каграманова К.Г., Шугурина Е.Г., Сичинава И.В., Соколова М.В., Боринская С.А., Янковский Н.К. Полиморфизм гена лактазы у детей с атопическими заболеваниями. // Педиатрия, 2008. - 87. - 4. - 15-17.
Козлов А.И., Лисицын Д.В., Козлова М.А., Богоявленский Д.Д., Боринская С.А., Варшавер Е.А., Вершубская Г.Г., Кальина Н.Р., Лапицкая Е.М., Санина Е.Д. Кольские саамы в меняющемся мире. – М.: Институт Наследия, ИЛ «АрктАн-С». 2008. 96 с.
Рогаев Е.И., Боринская С.А., Исламгулов Д.В., Григоренко А.П. МикроРНК человека в норме и патологии. // Молекулярная биология, 2008, том 42, № 5, с. 751-764.
2007
Боринская С.А., Кальина Н.Р. , Санина Е.Д. , Кожекбаева Ж.М. , Веселовский Е.М., Гупало Е.Ю., Гармаш И.В., Огурцов П.П., Паршукова О.Н., Бойко С.Г., Вершубская Г.Г., Козлов А.И. , Рогаев Е.И., Янковский Н.К. Полиморфизм гена аполипопротеина Е АРОЕ в популяциях России и сопредельных стран // Генетика, 2007, том 43, № 10, 1434-1440.
С.А.Боринская, А.В.Коротаев. Гены, народы и социокультурная эволюция. // В сб.:История и математика: Анализ и моделирование социально-исторических процессов. Под ред. Малков С.Ю., Гринин Л.Е., Коротаев А.В.2007. 360 с.
Соколова М.В., Васильев Е.В., Козлов А.И., Ребриков Д.В., Сенкеева С.С., Кожекбаева Ж.М., Люндуп Н.С., Свечникова Н.С., Огурцов П.П., Хуснутдинова Э.К., Янковский Н.К., Боринская С.А. Полиморфизм C/T-13910 регуляторного участка гена лактазы LCT и распростораненность гиполактазии в популяциях Евразии. // Экологическая генетика, 2007, том 5, № 3, стр. 26-35.
2006
Боринская С.А., Янковский Н.К. История человечества, записанная в генах. // В сб. Рабочие тетради по биоэтике. Вып. 3: Биоэтические проблемы генeтики и этногенетики. Под ред. Б.Г. Юдина. – М.: Изд. Моск. гуманит. ун-та, 2006. – 14-52.
Боринская С.А., Ребриков Д.В. , Нефёдова В.В., Кофиади И.А., Соколова М.В., Колчина Е.В., Куликова Е.А., Чернышов В.Н., Куцев С.И., Полоников А.В., Иванов В.П., Козлов А.И., Янковский Н.К. Молекулярная диагностика и распространенность первичной гиполактазии в популяциях России и сопредельных стран // Молекулярная биология, 2006, Том 40, № 6, стр. 1031-1036.