Лаборатория генетики микроорганизмов

 

 

Рабочие совещания в области международного сотрудничества:

 

 

1. Рабочее совещание с представителями  компании Санофи-Авентис (Франция).

11 февраля 2014г  в ИОГен РАН, в комн.106 лаборатории генетики микроорганизмов состоялось рабочее совещание с французскими представителями компании Санофи-Авентис (Франция), посвященная вопросам (Приложение 1) возможного совместного  сотрудничества. В рабочем совещании приняли участие с российской стороны: д.б.н., проф. Даниленко В. Н., д.б.н., проф. С.Л. Киселев, д.б.н., член-корреспондент РАН, директор ИОГен РАН Янковский Н.К., д.б.н., профессор, зам.директора ИОГен РАН Абилев Серикбай Каримович. Со стороны Санофи-Авенсис (Франция) приняли участие: Кристиан Фассотт – Вице-президент по Медицинским вопросам и Научным исследованиям, регион Интерконтиненталь, Бернард Джоб – Старший Директор по Стратегическим инициативам и инновациям, регион Интерконтиненталь.

 

 

2. Лекция Пола Фармера в ИОГен РАН.

31 марта 2014 в конференц-зале ИОГен РАН при содействии  Российского Представительства благотворительной организации “Партнеры во имя здоровья” (США), Международного консорциума «TBResist: An International Consortium for Whole Genome Sequencing of Drug Resistant Strains of TB», прошла лекция известного ученого,  профессора Пола Фармера (Paul Farmer), MD, PhD (Kolokotrones University Professor, the Chair of the Department of Global Health and Social Medicine at Harvard Medical School, Chief of the Division of Global Health Equity at Brigham and Women’s Hospital,Boston).Тема лекции: «New frontiers in tuberculosis care and control: lessons from ‘the delivery decade’».

Онлайн трансляция лекции доступна по данной ссылке www.youtube.com/watch.

 

 

3. Рабочее совещание консорциума TBResist.

01 апреля 2014  в Институте Общей Генетики РАН в комн.106 лаборатории генетики микроорганизмов прошло рабочее совещание, направленное на вступление российской группы в международный консорциум “TBResist: Международный консорциум по полногеномному секвенированию штаммов туберкулеза, устойчивого к лекарственным препаратам”.
В рабочем совещании приняли участие представители ИОГен РАН, ЦНИИТ РАМН, ЦНИИЭ Роспотребнадзора, УНИИФ Минздрава России, НИИ ФХМ ФМБА, СПбНИИФ Минздравсоцразвития России и Гарвардского Университета (США).
Были обсуждены задачи и перспективы формирования  российского консорциума и его дальнейшего вхождения в состав международного.

 

 

4. Визит профессора Чжана в ИОГен РАН.

14 мая  2014г. в ИОГен РАН в комн. 106 лаборатории генетики мироорганизмов было проведено рабочее совещание в рамках проекта международной коллаборации РФФИ-NIH “Токсины-антитоксины и RpsA в лекарственной устойчивости и персистенции микобактерий туберкулеза. В ходе совещания профессор Чжан (Prof. Ying Zhang, MD, PhD, Bloomberg School of Public Health, Johns Hopkins University) зачитал лекцию о персистенции микобактерий туберкулеза и механизмам устойчивости к пиразинамиду. Также обсуждались вопросы совместного выполнения проекта. Профессор Чжан является одним из мировых лидеров в области изучения механизмов устойчивости микобактерий к пиразинамиду, антибиотику, способному поражать персистирующие формы микобактерий туберкулеза. (Программа совещания в Приложении 2)

 

Приолжение 1.

 

Stem Cells:

Undifferentiated embryonic stem cells could be used as models to test embryotoxicity of new drug candidates

After differentiation Induced Pluripotent Stem Cells (IPS cells of embryonic origin) could be used to produce:

I.      Cellular models for testing new drug candidates in some degenerative disorders including:

1.      Parkinson Disease (dopaminergic neurons)

2.      Huntington Disease (GABAergic neurons)

 

II.      Cardiomyocytes to test cardiac toxicity of drugs

III.      Haematopoietic cells (project already under process with Skolkovo)

 

Opened to possible collaborations on academic research projects such as multilineage differentiation (production of IPS cells from different sources, e.g. endothelial cells, keratinocytes, fibroblasts, …) or epigenetic memory (how the somatic cells influence IPS cells)

On all the above topics, non-confidential packages including description and concrete proposal for collaboration are expected

 

Microbiology:

Fundamental research on:

I      Tuberculosis: ongoing projects intended to better address drug-resistant TB and better understand latency

II.      Novel functional biomarkers for early diagnostic of various diseases (used for selection of strains)

Library of 920 chemical molecules screened for anti-TB or anti-bacterial potency

Low-molecular weight protein kinase inhibitors in pre-clinical phase (tox studies done):

I.      2 anti-TB compounds

II.      4 oncological compounds

New probiotics for:

I.      Ulcer colitis as complement of drugs

II.      MAD (mixed anxiety and depression disorder): bacteria strengthening neurotransmitters

 

Bioinformatics:

Huge capabilities (next generation sequencing, chipsets, algorithms developed, academic collaboration network) that may set the stage for potential collaborations (e.g. in personalized medicine)

Two concrete projects of potential interest for Sanofi (respectively Genzyme and LGCR):

I.      Multiple Sclerosis:

1.      genomic profiling including regulatory sequences (8% of gene variants are located in regulatory sequences) (phase completed)

2.      association study ongoing in 400 patients to assess proteins corresponding to predictive gene variants  (underway) and identify subset of patients more likely to respond to some specific drugs

II.      Assessment of interactions between metal anions and proteins that may lead to design of new molecules for  Alzheimer disease, in light of "Metal Hypothesis" which stipulates that the neuropathogenic effects of Abeta in Alzheimer's disease are promoted by (and possibly even dependent on) Abeta-metal interactions.

 

 

Приложение 2.

 

Vavilov Institute of General Genetics, laboratory of microorganisms’ genetics, room 106.

Topic: “Toxin-antitoxins and RpsA in TB drug resistance and persistence.”

Schedule project

May 14th
10:00	Departure from the hotel, transfer to the Vavilov Institute of General Genetics, Gubkina str. 3.
11:00-13:15	Meeting at the Vavilov Institute of General Genetics, laboratory of microorganisms’ genetics, room 106. Topic: “Toxin-antitoxins and RpsA in TB drug resistance and persistence.” Participants: Dr. Ying Zhang, Department of Molecular Microbiology and Immunology, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health; Dr. Nikolay Yankovsky, director of Vavilov Institute of General Genetics; Dr. Serikbay Abilev, deputy director of Vavilov Institute of General Genetics; Dr. Valery Danilenko, head of the department of genetic basis of biotechnology, Vavilov Institute of General Genetics; Dr. Alexandr Shtil, laboratory of microorganisms’ genetics, Vavilov Institute of General Genetics; Dr. Larisa Chernousova, head of microbiology department, Central Research Institute of Tuberculosis; Dr. Olga Bekker, laboratory of microorganisms’ genetics, Vavilov Institute of General Genetics; Dmitry Maslov, laboratory of microorganisms’ genetics, Vavilov Institute of General Genetics; Kirill Shur, laboratory of microorganisms’ genetics, Vavilov Institute of General Genetics; Dr. Marina Zajchikova, laboratory of microorganisms’ genetics, Vavilov Institute of General Genetics; Dr. Tatyana Smirnova, microbiology department, Central Research Institute of Tuberculosis; Dr. Elena Larionova, microbiology department, Central Research Institute of Tuberculosis.
13:30-14:30	Lunch. Participants: Ying Zhang, Valery Danilenko, AlexandrShtil, Larisa Chernousova, Dmitry Maslov
15:30-17:00	Visit to the department of microbiology at the Central Research Institute of Tuberculosis, meeting with Dr. Vladislav Erokhin, director of the Institute.