Научная биография

Даниленко Валерий Николаевич

доктор биологических наук, профессор,

Заведующий лабораторией генетики микроорганизмов,

Заведующий отделом генетических основ биотехнологии ИОГен РАН,

Ученый секретарь Совета при Президиуме РАН по координации научных исследований по направлению «Медицинские техника, технологии и фармацевтика» РАН,

Член НТС Минпромторга РФ секция "Фармацевтическая промышленность,

Сопредседатель НТС "Трансляционная медицина" Технологической платформы «Медицина будущего»,

Координатор российской группы консорциума «TBResist: Международный консорциум по полногеномному секвенированию штаммов туберкулеза, устойчивого к лекарственным препаратам»,

Профессор кафедры биоинформатики Факультета медицинской и биологической физики,  МФТИ  (http://mipt.ru/education/chairs/bioinformatics/)

Член редколлегии журналов «Вавиловский журнал генетики и селекции» г. Новосибирск, "Вестник РГМУ" г. Москва

 

Даниленко Валерий Николаевич родился 8 мая 1947г. в Могилевской области (Республика Беларусь).

 

Служебные достижения

В 1971г. окончил кафедру генетики биологического факультета Московского госуниверситета  им. Ломоносова, а в 1975 году – окончил аспирантуру того же факультета. В 1977г. защитил кандидатскую диссертацию по специальности «Генетика», а в 1991 г. – докторскую по специальности «Генетика», с 1994г. – профессор по специальности «Генетика». С 1975 по 2006г. Даниленко В.Н. работал в научно-исследовательских институтах непосредственно участвовавших в создании штаммов, и фармпрепаратов для микробиологической и фармацевтической промышленности страны: ГосНИИгенетика, ВНИИантибиотиков, ГосНИИсинтезбелок. В 1983г. Даниленко В.Н. возглавил вновь организованную лабораторию генетической биотехнологии продуцентов антибиотиков ВНИИантибиотиков Минмедпрома СССР. C 1991г. по 2006г. возглавлял аналогичные лаборатории в ГосНИИгенетика и ГосНИИсинтезбелок. Им было создано в России направление научных исследований – генная инженерия и генетическая биотехнология продуцентов антибиотиков. В период с 1988 по 2002г. он участвовал в создании научно-технологической базы проекта по строительству завода субстанции антибиотиков в г. Орле. С 2002г. по 2006г. В.Н.Даниленко возглавлял ФГУП «ГосНИИсинтезбелок». С 2006г. по  настоящее время – заведующий  лабораторией генетики микроорганизмов, заведующий отделом генетических основ биотехнологии Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (http://vigg.ru/institute/podrazdelenija/otdel-geneticheskikh-osnov-biotekhnologii/laboratorija-genetiki-mikroorganizmov/). Первое направление лаборатории – разработка фармакологических биомишеней, тест-систем и  создание на их основе инновационных противоинфекционных лекарств. Второе направление лаборатории – микробиом (микробиота) человека: коммуникация с организмом хозяина, источник создания фармобиотиков нового поколения.

C 1984г. по 2001г. член редколлегии журнала «Антибиотики и химиотерапия». 2016-2017гг. член редколлегии журналов «Вавиловский журнал генетики и селекции», "Вестник РГМУ" (Научный медицинский журнал РНИМУ им. Н.И.Пирогова). 2016-2017гг. -участие в рецензирование статей ведущих научных изданий Anaerobe, Infection and Drug Resistance, Emerging Microbes and Infections (EMI), Journal of Tropical Medicine

 

Научные достижения

Сегодня Даниленко В.Н. крупнейший ученый России в области биомедицинской науки, является признанным научным лидером и менеджером высокой категории в этой области у нас в стране и за рубежом. В этом направлении достигнуты значительные успехи: выявлены новые эпидемиологически опасные линии возбудителя туберкулеза и разработаны диагностики для их идентификации. Исследования руководимого Даниленко В.Н. научного коллектива направлены на  создание с использованием методов геномики, протеомики, генной инженерии принципиально новой методологии в создании инновационных  биомишень-направленных противоинфекционных лекарств. Крупный вклад исследования В.Н. Даниленко внесли в решение проблемы лекарственной устойчивости бактерий. Им открыт новый механизм устойчивости к антибиотикам у грамположительных бактерий, обусловленный ферментом аминогликозидфосфотрансферазой нового типа.

Последние годы основные научные интересы связаны с поиском новых мишеней и лекарственных препаратов для лечения бактериальных инфекций, в первую очередь туберкулеза, а также ряда заболеваний человека. Идентифицированы и охарактеризованы новые перспективные биомишени у патогенных бактерий: F0F1 АТФазы системы токсин – антитоксин второго  типа, серин-треониновые протеинкиназы и др.. На их основе сконструированы новые тест-системы для скрининга. Эти исследования позволили перейти к созданию инновационных биомишень направленных лекарств. Под его руководством  реализовалось несколько проектов по доклиническим исследованиям в рамках ГП «Фарма 2020»: «Доклинические исследования  противолейкозного  лекарственного средства  -  ингибитора протеинкиназы Pim-1», «Доклинические исследования полусинтетического противоопухолевого антибиотика группы макролактанов», «Доклинические исследования противотуберкулезного лекарственного средства, ингибитора микобактериальных протеинкиназ», «Доклинические исследования  противотуберкулезного лекарственного средства на основе полусинтетических производных усниновой кислоты». На базе ИОГен РАН и отдела генетических основ биотехнологии ИОГен РАН фактически создан центр интегрированных исследований по разработке, поиску противотуберкулезных и других лекарств.

В последние годы В.Н. Даниленко создал и возглавил новое направление научных исследований в России: изучение микробиом (микробиоты) населения России. Основа этого направления была заложена при реализации комплексного проекта Минобрнауки РФ «Разработка технологий универсального быстропереориентируемого производства заквасок прямого внесения для биотехнологической промышленности». С 2008-2010 г. разработаны новые подходы поиска  фарм препаратов на основе бифидобактерий и лактобацилл, свойственных этно-региональным популяциям населения России. В.Н. Даниленко сформировал новую концепцию метагеномного анализа микробиом человека, основанную на анализе функциональных биомаркеров, включая группы генов контролирующих синтез нейротрансмиттеров, антиоксидантов, иммуномодуляторов и др. Под руководством профессора В.Н. Даниленко отобраны кандидаты в лекарства,  перспективные для лечения инфекционных заболеваний, в первую очередь туберкулеза, а также иммунологических и онкологических заболеваний. Сконструирована панель бактериальных высокопроизводительных тест-систем для скрининга ингибиторов серин-треониновых протеинкиназ – основа мишень-направленного поиска химических соединений, потенциальных лекарственных препаратов. Создана и охарактеризована коллекция пробиотических  штаммов лактобацилл и бифидобактерий для создания на их основе фармпрепаратов, включая иммуномодуляторы, антиоксиданты, противовоспалительные препараты и адъюванты для вакцин различных классов.

Впервые идентифицированы и охарактеризованы системы токсин-антитоксин II типа у бифидобактерий и лактобацилл и на их основе созданы диагностикумы для штаммовой идентификации геномов и метагеномов ЖКТ человека.  Установлена специфичность иммуномодулирующей активности ряда штаммов лактобацилл и бифидобактерий.

Секвенированы и аннотированы геномы 13 штаммов лактобацилл, 5  бифидобактерий, 2 стрептомицетов и  14 штаммов M.tuberculosis. Разработана система генотипирования M.tuberculosis, основанная на полиморфизме генов систем токсин-антитоксин II типа и вирулентности. Установлена кристаллическая структура (3Д) аминогликозид фосфотрансферазы aph VIII ( PDB 4Н05).

Осуществлены доклинические исследования противовоспалительной фармацевтической композиции для лечения язвенного колита, основанной на пробиотических штаммах лактобацилл, бифидобактерий и энтерококков. На базе лаборатории генетики микроорганизмов ИОГен РАН создан биобанк образцов микробиоты человека. Также развивается новое направление по исследованию микробной эндокринологии, в частности изучаются связи между микробиотой человека и мозгом и участие в этом процессе нейротрансмиттеров.

Он автор и создатель высокопроизводительных штаммов  и технологий получения антибиотиков и фармабиотиков, диагностикумов различного назначения (разработки защищены двадцатью патентами РФ), соавтор экспериментальных и обзорных статей в ведущих отечественных и зарубежных журналах. Большое внимание Даниленко В.Н. уделяет подготовке научных кадров. Под его руководством защищено 19 кандидатских диссертаций, из них 5 за последние 2 года (2016 -2017). С 2013г. - является профессором кафедры Биоинформатики «Факультета медицинской и биологической физики» МФТИ. Читает курс лекций " Введение в метагеномику»

(http://мфти.рф/education/chairs/bioinformatics/education/courses/bachelor_courses/introduction_to_metagenomics.html)

В настоящее время в лаборатории генетики микроорганизмов под руководством Даниленко Валерия Николаевича выполняется 5 дипломных работ студентами МФТИ, в том числе 4 бакалавра и 1 магистр. Работают студенты из разных вузов: МГУ (кафедра генетики и кафедра микробиологии), МИТХТ, РГАУ-МСХА.

Научно-организационная деятельность

В 1988г. по инициативе Даниленко В.Н. на базе ВНИИА была создана Международная лаборатория генной инженерии продуцентов антибиотиков стран-участниц СЭВ.

С 1990г. по 1999г. - Даниленко В.Н. по совместительству директор Ассоциации биотехнологии антибиотиков Министерства науки и технологий РФ. В 1999 году - основал Научно-исследовательский центр "БИОАН" являющийся преемником Ассоциации "БИОАН".  В настоящее время является Директором программ и проектов НИЦ «БИОАН» www.bioan.ru .

С 1998г. по 2001г. – директор центра по исследованиям и развитию ЗАО «Орловская фармкомпания».

С 1985г. по 1989г. – внештатный эксперт ЮНЕСКО от России по вопросам биотехнологии.

C 1984г. по 2001г. член редколлегии журнала «Антибиотики и химиотерапия».

С 2001г. по 2011г. - член Экспертного совета по биотехнологии Государственной Думы РФ.

С 2002 г. по настоящее время – член Комитета торгово-промышленной палаты РФ по развитию биологической и медицинской промышленности.

С 2009г. по настоящее время член Научно-технического совета Минпромторга по реализации мероприятий в области  развития химической, медицинской и фармацевтической промышленности, а также биотехнологического комплекса России; секретарь Совета при Президиуме Российской академии наук по координации научных исследований по направлению «Медицинская техника, технологии и фармацевтика» (medtechpharm-ras.ru).

С 2011г. – соруководитель  Научно – технического совета секции «Трансляционная медицина» Технологической платформы «Медицина будущего»

В1990г Даниленко В.Н. награжден Медалью «Ветеран труда», 1998 награжден Медалью «850 лет Москвы», 2003 г.  присвоено звание «Почетный химик», 2004 г. награжден почетной грамотой Министерства промышленности, науки и технологий Российской Федерации за большой личный вклад в развитие отечественной биотехнологической промышленности, 2006 г. отмечен благодарностью Федерального Агентства «Роспром» РФ, отмечен  Министерством обороны РФ дипломом международного военно-технического форума «Армия 2015» за лучший доклад на мероприятиях научно-деловой программы форума.

 

Международное сотрудничество

В.Н. Даниленко имеет большой опыт сотрудничества с крупными фармкомпаниями в России и за рубежом. Участвуя в Межгосударственных научно – исследовательских программах и проектах имеет опыт работы в области биомедицинских исследований в первую очередь проблем туберкулеза и микробиоты человека со специалистами Франции, США, Китая, Южной Кореи, ЮАР, Германии, Болгарии и др. Имеет опыт организационной работы по проведению научных мероприятий: в 1989 – 2016 гг. был вице-президентом и президентом организационных комитетов ряда Международных симпозиумов и конгрессов, проводимых в странах Европы и России в том числе Российско – Американских и стран БРИКС.

В рамках программы Евросоюза FP6 был руководителем группы Российских лабораторий по теме "Protein kinases – Novel Drug Targets of Post Genomic Era". В 2011 г. В.Н. Даниленко стал одним из инициаторов и организаторов Российско - Американского сотрудничества в области биомедицинских исследований. 16-18 ноябре 2011г. был проведен Российско – Американский  научный форум по  биомедицинским исследованиям.  А в 2012г. два рабочих совещания: первое совещание 28-29 июня  «Туберкулёз у больных ВИЧ-инфекцией: новые парадигмы, диагностика и создание лекарств» и  17-18 сентября «Микробиом человека: метагеномика, новые биомаркеры заболевания, трансляционные исследования в персонализированной медицине». В 2013-2014 годах В.Н. Даниленко был со-руководителем в проекте «Токсины-антитоксины и RpsA в лекарственной устойчивости и персистенции микобактерий туберкулеза», выполнявшимся совместно проф. Йинг Джангом (Ying Zhang) из Университета Джонса Хопкинса.

В 2013 году при активном участии В.Н. Даниленко Россия вступила  в Международный консорциум «TBResist: Международный консорциум по полногеномному секвенированию в составе нескольких российских институтов. Где В.Н. Даниленко стал Координатором российской группы консорциума ««TBResist: Международный консорциум по полногеномному секвенированию штаммов туберкулеза, устойчивого к лекарственным препаратам». В рамках данного консорциума принято решение о проведении в мае-июне 2014г в Москве российско-американского рабочего совещания  "Вирулентность и множественная лекарственная устойчивость Mycobacterium tuberculosis: полногеномное секвенирование, эпидемиологические и биоинформатические аспекты. На сегодняшний день база данных консорциума включает более 800 полногеномных последовательностей полностью охарактеризованных клинических изолятов M. tuberculosis, в том числе российских.

В 2015 году В.Н. Даниленко выступил содокладчиком доклада «Mycobacterium tuberculosis ‘Hybrid Warfare’: Virulence, Pathogenicity, Persistence and Drug Resistance» на конференции «Science Diplomacy 2015: Scientific Drivers for Diplomacy» в Вашингтоне, Округ Колумбия.

На сегодняшний день ведутся исследования проблем лекарственной устойчивости, вирулентности и филогенетики M. tuberculosis совместно с исследовательскими группами из США, ЮАР и КНР и Евросоюза. Подготовлен проект совместных исследований по направлению «Микробиом, ось кишечник мозг – участие в формировании нейродепрессивных и дегенеративных заболеваний.