В ходе выполнения проекта по Соглашению о предоставлении субсидии от "17" июня 2019 г. № соглашения ЭБ 075-15-2019-1405, Внутренний номер соглашения № 14.613.21.0068. с Минобрнауки России в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы» на этапе №3 в период с 01.01.2019 по 31.12.2019 выполнялись следующие работы:

 

1. Исследование лекарственной чувствительности штаммов M.smegmatis mc2 155 и M. tuberculosis H37Ra несущих созданные генетические конструкции к противотуберкулезным препаратам первого и второго ряда, отбор мутаций в генах вирулентности, влияющих на лекарственную чувствительность микобактерий;
2. Разработка праймеров для создаваемого диагностического набора;
3. Валидация методики детекции штаммов, несущих мутации в генах вирулентности, влияющих на лекарственную чувствительность M. tuberculosis, характерных для России, подготовка методических рекомендаций по использованию набора;
4. Подготовка и подача заявки на патент.

 

При этом были получены следующие результаты:

 

- Исследована лекарственная чувствительность штаммов M. smegmatis mc2 155 и M. tuberculosis H37Ra несущих созданные генетические конструкции к противотуберкулезным препаратам первого и второго ряда, отобраны мутаций в генах вирулентности, влияющих на лекарственную чувствительность микобактерий.

 

- Разработаны праймеры для диагностического набора.

 

- Валидирована методика детекции штаммов, несущих мутации в генах вирулентности, влияющих на лекарственную чувствительность M. tuberculosis, характерных для России, подготовлены методические рекомендаций по использованию набора.

 

- Подана заявка на патент.

 

- Проведено материально-техническое обеспечение работ.

 

Таким образом, результаты проведенной работы соответствуют задачам, сформулированным в Техническом задании и Плану-Графику соглашения и соответствует цели проекта.

 

 

В ходе выполнения проекта по Соглашению о предоставлении субсидии от 3 октября 2016 года №14.607.21.0152 (Идентификатор соглашения RFMEFI60716X0125) с Минобрнауки России в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы» на этапе №1 в период с 03.10.2016 по 31.12.2016 выполнялись следующие работы:

 

1 Аналитический обзор современной научно-технической, нормативной, методической литературы, затрагивающей научно-техническую проблему, исследуемую в рамках ПНИЭР;

2 Патентные исследования.

3 Обоснование и выбор методов и средств, направления исследований и способов решения поставленных задач;

4 Сравнительная оценка вариантов возможных решений исследуемой проблемы с учетом результатов прогнозных исследований, проводившихся по аналогичной тематике;

5 Исследование рынка программного обеспечения для обработки геномных данных и идентификации мутаций в клетках опухолей;

6 Анализ баз данных мутаций, возникающих в ходе онкогенеза на основе открытых источников;

7 Материально-техническое обеспечение работ.

 

При этом были получены следующие результаты:

1 Выполнен аналитический обзор информационных источников, который подтвердил актуальность выбранного направления исследований, а также новизну предлагаемых подходов и методов решения поставленных задач.

2 Проведены патентные исследования. В ходе проведения патентного исследования был обработан информационный массив в объеме свыше 5400 единиц патентной документации. При анализе было отобрано 24 патентных документа, касающихся объекта исследования с разной степенью релевантности. В результате сопоставительного анализа отобранных патентных документов и разрабатываемого технического решения не установлено тождество признаков в сравниваемых объектах, т. е. разрабатываемое решение отличается от известных из уровня техники. Следовательно, разрабатываемое техническое решение соответствует критерию патентоспособности «новизна».

3 В результате сравнительной оценки вариантов возможных решений исследуемой проблемы с учетом результатов прогнозных исследований, проводившихся по аналогичной тематике в качестве метода анализа мутаций в образцах опухолей выбран и обоснован метод высокопроизводительного секвенирования ДНК с применением технологии Illumina с дальнейшей биоинформатической обработкой данных с использованием алгоритмов оценки вариаций числа копий фрагментов ДНК нормальных и опухолевых клонов клеток в пределах одного клинического образца;

4 Исследование рынка программного обеспечения для обработки геномных данных показало, что актуальность и перспективность рынка программного обеспечения для анализа генетических данных обусловлена развитием персонализированной медицины, генной терапии, а также стремительным формированием потребительской группы врачей-генетиков, использующих генетические данные в своей практике;

5 Проведен анализ основных баз данных мутаций солидных опухолей и определен полный перечень онкогенов для проведения дальнейших исследований;

6 Выполнено материально-техническое обеспечение работ.

Поставленные на 1 этапе выполнения ПНИЭР задачи решены в полном объеме, что позволило выбрать пути проведения исследований для перехода к разработке прикладного программного обеспечения для идентификации мутаций на основе анализа массивов данных, полученных методом высокопроизводительного секвенирования ДНК.

Таким образом, результаты проведенной работы соответствуют задачам, сформулированным в Техническом задании Соглашения, что обеспечивает возможность выполнения его последующих этапов.