В ИОГен РАН появилась новая лаборатория «Сравнительной и функциональной геномики регуляторных систем»
В ИОГен РАН появилась новая лаборатория «Сравнительной и функциональной геномики регуляторных систем», решение об этом было единогласно принято на Ученом совете 8 октября. С докладом «Переключение образа жизни бактерий на уровне транскрипции» выступила ее руководитель к.б.н. Мария Николаевна Тутукина, она рассказала о направлениях работы лаборатории и решаемых в ней задачах.
В лаборатории работают молекулярные биологи и биоинформатики, что позволяет проводить полный цикл исследований. Основные направления — функциональная и сравнительная геномика бактерий, структура хроматина эукариот, метагеномный анализ природных образцов, эволюция метаболических путей. Из всех проведенных исследований Мария Тутукина остановилась на нескольких историях. В первой истории выясняли, как у кишечной палочки регулируется метаболизм гексуроновых кислот, что необходимо для эффективной колонизации организма хозяина. Эта работа будет продолжена на приборе, имитирующем ускоренную эволюцию. Вторая история касалась антисмысловых РНК и их роли в регуляции экспрессии генов. Оказалось, что некодирующие РНК напрямую вовлечены в регуляцию процесса перехода кишечной палочки от свободной жизни к образованию биопленки - состояния, в частности, защищающего ее от воздействия антибиотиков.
Кроме того, лаборатория занимается метагеномикой. Например, сотрудники исследовали, как изменяется микробиом тли в зависимости от того, на каких растениях она обитает; какое действие оказывает загрязнение ракетным топливом на почвы космодрома Байконур; что представляют собой бактериальные сообщества вечной мерзлоты и «замерзших вулканов».
В числе прочих задач, ставших предметом исследования лаборатории: анализ бактериального сообщества, поселившегося на мясе в процессе его хранения; метагеномы древесины разных видов деревьев на разной стадии разложения; а также особенности функционирования коронавируса SARS-CoV-2. Так было показано, что некоторые люди, переболевшие ковидом в легкой степени, не приобретают антител к N белку.