Образовательный проект по геномике растений
В декабре завершился курс повышения квалификации по высокопроизводительным методам анализа геномов. Это совместный образовательный проект группы геномики растений Сколтеха и ИОГен РАН, который проводится при поддержке Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий (проект № 075-15-2021-1064). Он предназначен для исследователей, специализирующихся на работе с растительными геномами.
Каждую субботу с 7 сентября до 14 декабря слушатели с 11 утра до 7 вечера изучали основы анализа геномных данных. «Объем курса – 120 академических часов, проводимых в аудитории, соответствует нескольким обычным семестровым курсам и требует как от слушателей, так и от преподавателей больших усилий, – говорит руководитель программы старший преподаватель Сколтеха Мария Логачёва, – мы разбирали различные темы: на каких приборах и с использованием каких принципов получают геномные данные, как собрать и аннотировать геном и транскриптом, как проанализировать дифференциально экспрессирующиеся гены и многие другие. Акцент делался на примеры применения этих методов при изучении растений – объектов, которые отличаются сложностью организации генома, с большим количеством повторяющихся элементов, дупликаций».
В реализации курса активно участвовали сотрудники лаборатории геномики растений ИОГен РАН: лекции читали Анна Клепикова, Александра Касьянова, Денис Омельченко, многие другие сотрудники лаборатории и аспиранты Сколтеха помогали слушателям с освоением программ. «Когда с использованием методов геномики хорошо охарактеризована структура и функции генов, можно планировать целенаправленные изменения в геноме с помощью специальных инструментов, чтобы получить желаемый эффект, улучшить какие-то характеристики растения - говорит с.н.с. лаборатории геномики растений Денис Омельченко – поэтому в курс входила дополнительная часть по принципам и методам геномного редактирования».
В этом году программу дополнительного образования успешно закончили 36 человек – около 2/3 изначально записавшихся на курс. В основном они представляли академические институты и университеты, в которых есть специализация по генетике растений и селекции. Каждый год на курсах много слушателей из ВНИИ сельскохозяйственной биотехнологии, из Тимирязевской академии (Российский государственный аграрный университет), из Института физиологии растений и из некоторых более прикладных, селекционных институтов. На заключительном занятии слушатели подарили преподавателям торт с эмблемой группы геномики растений, который был съеден в рамках совместного чаепития, ознаменовавшего окончание программы.