Курс «Секвенирование и анализ растительного генома»
Дорогие коллеги! В период с 24 ноября по 6 декабря 2025 года на базе Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН (г. Москва, ул. Губкина д. 3) будет проводиться курс «Секвенирование и анализ растительного генома».
Курс проводится в рамках проекта «ПАНАГРО: от пангеномов сельскохозяйственных растений к маркер-ориентированной селекции и геномному редактированию», поддержанного Министерством науки и высшего образования РФ (проект № 075-15-2025-476 от 29.05.2025), а также при поддержке компании Skygen (https://www.skygen.com/).
Занятия будут проходить ежедневно, с 11 до 19 часов (с перерывом на обед), кроме воскресенья. Дистанционного формата участия не предполагается.
Курс будет включать в себя как теоретические, так и практические занятия по получению и обработке данных высокопроизводительного секвенирования. Особое внимание будет уделено темам сборки геномов, их аннотации и сравнению с геномами других видов и линий. Помимо этого, в демонстрационном режиме будет проведена подготовка материала и секвенирование генома растения, с использованием платформы Оxford Nanopore. Так же слушатели получат возможность самостоятельно провести подготовку библиотеки полноразмерной кДНК для секвенирования на платформе Оxford Nanopore. Курс будет предваряться занятиями, посвященными работе в командной строке Linux. Отсутствие опыта работы в командной строке не является препятствием для прохождения курса.
Занятия будут проводить сотрудники группы геномики растений ИОГен РАН и Сколтеха (Пенин А.А., Логачёва М.Д., Касьянова А.М., Клепикова А.В. и другие).
Занятия проводятся на бесплатной основе. Со слушателями будет заключен договор, а по окончании всем успешно прошедшим курс будет выдано удостоверение о повышении квалификации государственного образца. Проезд, проживание и питание не оплачиваются и не обеспечиваются.
Участие в курсе возможно только при наличии диплома бакалавра или более высокой ступени образования. Для занятий необходимо иметь свой ноутбук с операционной системой Windows версии 8 или более поздней (MacOS и Linux – недопустимы) обладать знаниями по молекулярной биологии и генетике в объеме следующих курсов https://stepik.org/course/70/promo и https://stepik.org/course/9180/promo. Если вы сомневаетесь в своих знаниях, рекомендуем пройти эти курсы до начала занятий. Так же необходим опыт базовых молекулярно-биологических процедур (постановка ПЦР, выделение ДНК и т.д.).
Для участия в курсе необходимо заполнить анкету (https://forms.gle/83Jf3Fv2aGE6Qeq7A) до 15 октября (включительно). В случае если число заявок превысит максимальное число мест (24) будет проведен конкурс на основании поданной информации и мотивационных писем. В том числе в приоритетном порядке будут выбраны слушатели, уже работающие с геномами растений, имеющие собственные задачи в этой области. Обращаем внимание, что по требованию Министерства слушатели программы должны представлять не менее трёх федеральных округов (по месту основной работы), при этом к одному округу не может относиться более 50% слушателей. Слушателям, зачисленным для прохождения курса, будет необходимо предоставить справку с места основной работы. О зачислении на курс будет сообщено по указанному в анкете электронному адресу не позднее 21 октября.