Центр коллективного пользования «Генетический полиморфизм» ОБН РАН

Центр коллективного пользования «Генетический полиморфизм» ОБН РАН

Заказ услуг  и их детальное описание  ЗДЕСЬ <http://oligi.ru/>

Заведующий ЦКП - доктор биологических наук Ребриков Денис Владимирович

 

тел: (499) 724-8522

e-mail: rebrikov(at)vigg.ru

 

Лекция Д.В.Ребрикова "Обыкновенное чудо генетики" 19.06.2013 www.polit.ru/article/2013/05/19/anons_rebrikov/

 

Состав ЦКП:

  • Коростин Дмитрий Олегович, м.н.с.
  • Ильинский Валерий Владимирович, аспирант

 

Центр коллективного пользования «Генетический полиморфизм» ОБН РАН создан при Институте общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН в 2009 году.

 

Основной задачей ЦКП является технологическая поддержка научно-исследовательских проектов сотрудников институтов РАН в области генетики и молекулярной биологии, требующих использования дорогостоящего высокотехнологичного оборудования.

 

В настоящее время ЦКП предлагает следующие услуги:

  • Высокопроизводительное секвенирование (SOLiD 5500xl, Ion PGM Torrent)
  • Капиллярное секвенирование (Applied Biosystems 3130)
  • Фрагментный анализ (Applied Biosystems 3130)
  • Генотипирование (Real-Time PCR)
  • Синтез олигонуклеотидов
  • ПЦР «в реальном времени»

Более подробная информация, а также учредительная документация и формы для заказа услуг находятся на сайте ЦКП http://oligi.ru/

 

Помимо технологической поддержки НИР заказчиков услуг ЦКП, сотрудники принимают участие в следующих научно-исследовательских разработках и проектах:

  1. Разработка и совершенствование методов и алгоритмов анализа ДНК
  2. Исследование взаимосвязи вариантов генов BRCA1 и BRCA2 человека с развитием опухолей разных типов
  3. Поиск взаимосвязи генотипа человека с развитием заболеваний пародонта
  4. Исследование микробных биоценозов полости рта человека
  5. Исследование внеклеточных нуклеиновых кислот плазмы крови человека
  6. Исследование взаимосвязи длины CGG повтора в гене FMR1 с нарушениями развития интеллекта
  7. Исследование взаимосвязи генотипических и средовых факторов с качественным и количественным составом латентных вирусных инфекций человека

 

О ходе выполнения проекта по Соглашению о предоставлении субсидии от 3 октября 2016 года №14.607.21.0152 (Идентификатор соглашения RFMEFI60716X0125) с Минобрнауки России в рамках федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014-2020 годы»
Тема Соглашения: «Создание системы поиска и анализа драйверных мутаций в опухолях методом высокопроизводительного секвенирования для корректировки терапии онкологических заболеваний"
Идентификатор соглашения: RFMEFI60716X0125
Руководитель работ: Ребриков Д.В.

 

Практические разработки

Совместно с ИБХ РАН и ЗАО «НПФ ДНК-Технология» разработан практикум для студентов старших курсов, специализирующихся в области молекулярной биологии, генетики, вирусологии и смежных специальностей: «Применение современных молекулярно-биологических методов для поиска и клонирования полноразмерных нуклеотидных последовательностей кДНК». С 2009 года практикум на регулярной основе проводится сотрудниками ЦКП «Генетический полиморфизм» для студентов 3-го курса кафедры генетики биологического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова (в рамках работы УНЦ ИОГен РАН с кафедрой генетики биологического факультета МГУ), студентам 4-5 курсов биологических факультетов различных ВУЗов США (в рамках сотрудничества с Университетом Джорджа Вашингтона, США).

 

Дипломные и диссертационные работы

С 2009 года в рамках ЦКП «Генетический полиморфизм» защищена одна докторская диссертация. ЦКП постоянно принимает у себя практикантов, стажеров и дипломников из МФТИ, МГУ, МИФИ.

 

Основные публикации за период 2009-2012 гг.

  1. Ребриков Д.В., Коростин Д.О., Ушаков В.Л., Барсова Е.В., Лукьянов С.А. Применение современных молекулярно-биологических методов для поиска и клонирования полноразмерных нуклеотидных последовательностей кДНК. Учебное пособие. М.: НИЯУ МИФИ, 2011 - 88 с. ISBN 978-5-7262-1481-8
  2. Батенева Е.И., Мещеряков А.А., Любченко Л.Н., Кадочникова В.В., Панищева Л.A., Трофимов Д.Ю., Ребриков Д.В. Частота одиннадцати мутаций генов BRCA1 и BRCA2 в неотобранной выборке больных раком молочной железы россиянок. // Уральский медицинский журнал. – 2011. – №3 (81). – С.69-73.
  3. Зорина О.А., Грудянов А.И., Ребриков Д.В. Микробиоценоз пародонтального кармана и воспалительные заболевания пародонта. // Уральский медицинский журнал. - 2011.- №3 (81). - С.9-13.
  4. Зорина О.А., Донников А.Е., Кулаков А.А., Борискина О.А., Ребриков Д.В. Взаимосвязь полиморфизма генов COL1A1, COL2A1 и COL3A1 с развитием хронического генерализованного пародонтита у населения России. // Уральский медицинский журнал. - 2011. - №3 (81). - С.5‑8.
  5. Зорина О.А., Кулаков А.А., Ребриков Д.В. Количественная оценка соотношения патогенных представителей микробиоценоза полости рта в норме и при пародонтите. // Стоматология. - 2011. - №3. - С.40-42.
  6. Зорина О.А., Кулаков А.А., Борискина О.А., Ребриков Д.В. Метод ПЦР «в реальном времени» для анализа количественного и качественного соотношений микробиоценоза пародонтального кармана. // Стоматология. - 2011. - №3. - С.31-33.
  7. N.E.Soroka, S.A.Morozova, V.V.Ilinsky, D.Y.Trofimov, D.V.Rebrikov. Association between alleles of cytokine genes with rheumatoid arthritis in Russian population. J Clin Cell Immunol. 2011. 1:102.
  8. Грудянов А.И., Зорина О.А., Кулаков А.А., Борискина О.А., Ребриков Д.В. Количественная оценка микробиоценозов полости рта при заболеваниях пародонта. // Пародонтология. - 2011. - №2. - С.18-21.
  9. Зорина О.А., Кулаков А.А., Борискина О.А., Ребриков Д.В Соотношение патогенных представителей микробиоценоза пародонтальных карманов при разной степени тяжести пародонтита. // Acture Nature. - 2011. - №2. - С.101-104.
  10. М.А.Турчанинова, А.A.Мещеряков, З.П.Рахманкулова, Д.В.Ребриков. Внеклеточные РНК плазмы крови как диагностический маркер опухолей молочной железы. Биоорганическая химия. – 2011 – 37(2).
  11. Зорина О.А., Борискина О.А., Ильинский В.В., Ребриков Д.В. Взаимосвязь аллелей генов некоторых цитокинов со скоростью прогрессии и тяжестью пародонтита. // Стоматология для всех. - 2011. - №2. - С. 26-31.
  12. Зорина О.А., Кулаков А.А., Борискина О.А., Ребриков Д.В. Взаимосвязь полиморфизмов генов ММП2 и ММП9 с развитием заболеваний пародонта. // Паллиативная медицина и реабилитация. - 2011. -№2. - С.49-52.
  13. Зорина О.А., Кулаков А.А., Тумбинская Л.В., Ребриков Д.В. Нормировка данных при количественном исследовании пародонтопатогенной микрофлоры методом ПЦР «в реальном времени». // Стоматология для всех. - 2011. - №1. - С.46-48.
  14. А.В. Сафонова, С.Д. Арутюнов, А.Н. Петрин, Л.В. Акуленко, Зорина О.А., Д.В. Ребриков, А.В. Рубанович, Боринская С.А., Янковский Н.К. Ассоциация аллелей генов цитокинов с заболеваниями пародонта у человека. Acta Naturae. – 2011 – Т. 3, #1, С. 18–22
  15. М.А.Турчанинова, Д.В.Ребриков. Использование внеклеточных РНК плазмы крови в качестве онкомаркеров. Вопросы гематологии, онкологии и иммунопатологии в педиатрии. 2010; 9 (4): 25-38.
  16. И.В. Звягин, В.Ю. Дородных, И.З. Мамедов, Д.Б. Староверов, А.Г. Бочкова, Д.В. Ребриков, Ю.Б. Лебедев. Ассоциация аллельного варианта гена аминопептидазы ERAP1 с риском развития анкилозирующего спондилита. Acta Naturae . – 2010 – Т. 2, № 3 (6), С. 86–92.
  17. Zvyagin IV, Mamedov IZ, Britanova OV, Staroverov DB, Nasonov EL, Bochkova AG, Chkalina AV, Kotlobay AA, Korostin DO, Rebrikov DV, Lukyanov S, Lebedev YB, Chudakov DM.Contribution of functional KIR3DL1 to ankylosing spondylitis. Cell Mol Immunol. 2010 Sep 6.
  18. Екимова Е.В., Алексеева М.Л., Колодько В.Г., Иванец Т.Ю., Пустотина О.А., Ребриков Д.В. Альфа-фетопротеин и β2-микроглобулин как прогностические маркеры состояния новорожденного. Проблемы репродукции – 2010 - №2 – С. 97-101.
  19. Екимова Е.В., Алексеева М.Л., Колодько В.Г., Иванец Т.Ю., Пустотина О.А., Ребриков Д.В. О диагностической значимости определения β2-микроглобулина (обзор литературы). Проблемы репродукции – 2010 – №1- С. 7-11.
  20. Vasilyev E.V., Trofimov D.Y., Tonevitsky A.G., Ilinsky V.V., Korostin D.O., Rebrikov D.V. Torque Teno Virus (TTV) distribution in healthy Russian population. Virol J. 2009 Sep 7;6:134.
  21. ПЦР «в реальном времени» / Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю., и др.; под ред. д.б.н. Д.В.Ребрикова; предисл. Л.А.Остермана и акад. РАН и РАСХН Е.Д.Свердлова. – М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009. – 215 с.: ил. ISBN 978-5-94774-927-4
  22. Турчанинова М.А., Ребриков Д.В. Профиль РНК цитокинов в плазме крови при нормальном физиологическом состоянии организма. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2009 – Т. 24, #2, С. 68–71