"Генетика", 2026 г., № 7

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МАРКЕРЫ В ИССЛЕДОВАНИЯХ ХВОЙНЫХ ВИДОВ

Н.В. Орешкова^1,2,3, К.В. Крутовский^3,4,5,6,*

¹ Федеральный исследовательский центр «Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук», Красноярск, 660036 Российская Федерация
² Институт леса им. В.Н. Сукачева – обособленное подразделение Федерального исследовательского центра «Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук», Красноярск, 660036 Российская Федерация
³ Сибирский федеральный университет, Красноярск, 660041 Российская Федерация; e-mail: kkrutovsky@gmail.com
⁴ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Российская Федерация
⁵ Воронежский государственный лесотехнический университет им. Г.Ф. Морозова, Воронеж, 394087 Российская Федерация
⁶ Гёттингенский университет им. Георга-Августа, Гёттинген, 37077 Германия

Молекулярно-генетические маркеры (МГМ) представляют собой мощные инструменты, позво-ляющие исследователям изучать структуру популяций, оценивать уровень генетической изменчи-вости, отслеживать миграционные процессы внутри вида. В обзоре рассматриваются различные аспекты и эффективность применения различных МГМ для изучения генетического разнообразия разных видов хвойных. Приведен анализ истории создания МГМ, их детальная классификация, характеристики и примеры маркеров, наиболее часто используемых при изучении хвойных видов. Особое внимание уделено современным ДНК-маркерам, разработанным с применением технологий секвенирования «нового поколения» (Next Generation Sequencing – NGS). Полноге-номный ассоциативный анализ (GWAS) важных адаптивных и селекционно ценных признаков по большому числу генов хвойных стал возможен только благодаря таким современным ДНК-марке-рам. По сравнению с традиционными маркерами они предоставляют более полную информацию о генетической изменчивости видов хвойных и позволяют выявлять связи генетической измен-чивости с изменчивостью таких важных признаков, как устойчивость к болезням, засухоустой-чивость, скорость роста, качество древесины и т.д., а также с изменчивостью средовых факторов и биоклиматических параметров. Необходимо отметить, что в целом тема МГМ огромна и охва-тывает тысячи публикаций. Поэтому главный фокус данного обзора – это разработка и исполь-зование МГМ в исследованиях хвойных видов, одной из важнейших групп растений. Основное внимание при этом будет уделено публикациям по хвойным, произрастающим на территории Российской Федерации, которые, на наш взгляд, все еще недостаточно генетически изучены. По-этому авторы заранее приносят извинения всем тем исследователям, чьи достойные публикации не были упомянуты в данном обзоре из-за ограниченности его допустимого объема.

DOI: 10.7868/S3034510326070010

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Oreshkova, N.V., Krutovsky, K.V.
Molecular Genetic Markers in the Studies of Conifer Species.
DOI: 10.1134/S1022795426700262

ДИАГОНАЛЬНАЯ ИНТЕГРАЦИЯ МУЛЬТИОМИКСНЫХ БИОЛОГИЧЕСКИХ ДАННЫХ: МЕТОДЫ, ИНСТРУМЕНТЫ И ПЕРСПЕКТИВЫ

М.С. Арбатский*, Д.Е. Баландин, А.В. Чуров

Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова Министерства здравоохранения Российской Федерации, Российский геронтологический научно-клинический центр, Москва, 117997 Российская Федерация; e-mail: algenubi81@mail.ru

Обзор посвящен диагональной интеграции мультиомиксных данных – подходу, позволяющему объединять данные различных молекулярных модальностей, полученные в независимых ис-следованиях без попарных измерений. Проанализировано 22 метода диагональной интеграции, классифицированных по математической основе. Представлен сравнительный анализ между-народных и российских платформ. Обоснована концепция биоцентрического подхода на основе сопряженных лапласианов и методов ядерного отображения в воспроизводящие гильбертовы пространства.

DOI: 10.7868/S3034510326070028

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Arbatsky, M.S., Balandin, D.E., Churov, A.V.
Diagonal Integration of Multi-Omics Biological Data: Methods, Tools, and Prospects.
DOI: 10.1134/S1022795426700274

РОЛЬ ГЕНА XIAP В ПАТОЛОГИИ ЧЕЛОВЕКА

В.Е. Шаврак*, Н.А. Скрябин

Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, 634050 Российская Федерация; e-mail: laminatria21@gmail.com

Ген XIAP (также называемый BIRC4) кодирует белок XIAP, относящийся к семейству белков – ингибиторов апоптоза (IAP) и обладающий выраженными антиапоптотическими свойствами. XIAP также участвует в различных внутриклеточных сигнальных событиях, включая путь NF-κB, путь c-Jun-N-терминальной киназы и путь TGF-β. Нарушения экспрессии и функции XIAP ассоциированы с развитием Х-сцепленного лимфопролиферативного синдрома 2-го типа, болезни Крона, нарушением нейродегенеративных процессов, а также с патогенезом онкологических заболеваний. Роль XIAP в патологических процессах остается предметом интенсивного изучения. Настоящий обзор систематизирует современные представления о патологических процессах, опосредованных XIAP, а также представит данные о возможностях использования таргетной терапии.

DOI: 10.7868/S3034510326070036

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Shavrak, V.E., Skryabin, N.A.
The Role of the XIAP Gene in Human Pathology.
DOI: 10.1134/S1022795426700286

ДИАГРАММА Ф. КРИКА В СВЕТЕ ЭПИГЕНЕТИКИ И ЭВОЛЮЦИИ

А.П. Козлов^1,2,*

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 117971 Российская Федерация
² Биомедицинский центр, Санкт-Петербург, 194044 Российская Федерация; e-mail: contact@biomed.spb.ru

В данной работе мы показали, что происхождение генетической и эпигенетической информации связано с происхождением организмов. Диаграмма Крика, описывающая Гипотезу после-довательностей и Центральную догму молекулярной биологии, модифицирована для описания происхождения генов и регуляции; эпигенетических взаимодействий и дифференциальной экс-прессии генов; а также эволюции геномов, транскриптомов и протеомов. Мы также сформулиро-вали три соответствующих утверждения об эволюции потоков биологической информации после происхождения организмов. Появление новой генетической и эпигенетической информации свя-зано с «замороженными случаями», сопровождающими каждый этап прогрессивной эволюции.

DOI: 10.7868/S3034510326070044

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Kozlov, A.P.
Crick Diagram in the Light of Epigenetics and Evolution.
DOI: 10.1134/S1022795426700298

ВОЗДЕЛЫВАНИЕ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ В РОССИИ – ОТ РАННЕГО СРЕДНЕВЕКОВЬЯ ДО ПОСЛЕДНИХ ЛЕТ РОССИЙСКОЙ ИМПЕРИИ

Е.Д. Бадаева^1,2,*, Е.А. Салина²

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Российская Федерация; e-mail: katerinabadaeva@gmail.com
² Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск, 630090 Российская Федерация

Мягкая пшеница Triticum aestivum L. (2n = 6x = 42, BBAADD) – важнейшая сельскохозяйственная культура, сопровождавшая человека с момента появления первых человеческих цивилизаций. Она появилась приблизительно 10 тыс. лет назад в результате гибридизации тетраплоидной пшеницы (2n = 4x = 28, BBAA) и Ae. tauschii (2n = 2x = 14, DD) предположительно в северо-западной части Ирана и постепенно распространилась вместе с человеком в страны Европы, Азии и Африки, позже – Америки и Австралии. Пути и время миграций мягкой пшеницы являлись предметом многочисленных исследований с использованием как археологических и исторических, так и современных молекулярно-генетических методов. В то же время эти работы практически слабо охватывают историю появления и распространения мягкой пшеницы в России. Это связано с тем, что большинство российских работ опубликовано в местных изданиях, непереводимых и недоступных для мировой научной общественности. В связи с этим мы пытались обобщить полученные к настоящему времени данные по истории возделывания пшеницы на территории России с момента зарождения здесь земледелия и до появления научной селекции (начало ХХ века).

DOI: 10.7868/S3034510326070051

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Badaeva, E.D., Salina, E.A.
Cultivation of Bread Wheat in Russia—From the Early Middle Ages to the Last Years of the Russian Empire (Review).
DOI: 10.1134/S1022795426700304

РАЗНООБРАЗИЕ ПЛАСТОМОВ Oryza sativa НА СЕВЕРНОЙ ГРАНИЦЕ ОБЛАСТИ ВОЗДЕЛЫВАНИЯ

С.В. Горюнова^1,2,3,*, А.Б. Сиволапова^{1, 2}, О.Б. Поливанова², Е.А. Сотникова⁴, Н.Г. Туманян¹, Л.В. Есаулова¹, Т.Л. Коротенко¹, Е.Г. Савенко¹, Н.И. Вахрушева¹, Ж.М. Мухина¹, Д.В. Горюнов^2,5

¹ Федеральный научный центр риса, Краснодар, 350921 Российская Федерация; e-mail: orang2@yandex.ru
² Федеральный исследовательский центр картофеля им. А.Г. Лорха, Московская область, Люберцы, д.п. Красково, 140051 Российская Федерация
³ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Российская Федерация
⁴ Национальный медицинский исследовательский центр терапии и профилактической медицины, Москва, 101990 Российская Федерация
⁵ Научно-исследовательский институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова, Москва, 119234 Российская Федерация

Рис является основным продуктом питания почти для половины населения мира. Так как рис – теплолюбивая культура, температурные условия являются важным фактором, ограничивающим ареал его возделывания. Юг европейской части России является одним из самых северных регионов рисоводства в мире. Поэтому изучение сортов, возделываемых в этом регионе, может сыграть важную роль в понимании механизмов адаптации к температурным условиям и другим абиотическим и биотическим факторам среды, совершенствовании селекционного процесса и расширении границ возделывания культуры. Однако до сих пор не проводилось систематического исследования генетического разнообразия российских сортов риса с использованием современных методов. В настоящей работе были проанализированы полные последовательности хлоропластных геномов 56 образцов риса различного происхождения из коллекции ФГБНУ «Федеральный научный центр риса». Было показано, что пластомы всех изученных образцов можно отнести только к трем из пяти ранее выделенных групп хлоропластных геномов культурного риса. Наиболее представленной из всех оказалась группа 1 (Or-wj-I). Значительная часть проанализированных образцов имела идентичные гаплотипы. Полученные данные позволяют сделать вывод о низком генетическом разнообразии изученной выборки. Это может быть объяснено ограниченным набором исходных форм, использованных для создания генотипов, адаптированных к условиям произрастания в северной части области возделывания культуры.

DOI: 10.7868/S3034510326070069

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Goryunova, S.V., Sivolapova, A.B., Polivanova, O.B. et al.
Diversity of Oryza sativa Plastomes on the European Northern Edge of Planting Area.
DOI: 10.1134/S1022795426700328

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ВЛИЯНИЯ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ БЕЛКОВ СИСТЕМ РЕПАРАЦИИ ДНК НА РИСК РАЗВИТИЯ БРОНХИАЛЬНОЙ АСТМЫ

Н.П. Бабушкина^1,*, Е.Ю. Брагина¹, Е.В. Немеров², А.Н. Кучер¹

¹ Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук, Томск, 634050 Российская Федерация; e-mail: nad.babushkina@medgenetics.ru
² Сибирский государственный медицинский университет, Томск, 634050 Российская Федерация

Бронхиальная астма (БА) представляет собой многофакторное гетерогенное хроническое заболевание дыхательных путей. В многочисленных полногеномных ассоциативных исследованиях (GWAS) выявлено большое количество ассоциированных генов, но они не могут считаться исчерпывающим спектром. Белки репарации участвуют в созревании B- и T-лимфоцитов, переключении классов иммуноглобулинов и соматической гипермутации, что напрямую связывает их с патогенезом инфекционно-аллергических заболеваний, включая БА. У взрослых пациентов БА нередко сочетается с сердечно-сосудистой патологией, прежде всего с гипертонической болезнью. В работе изучены ассоциации вариантов генов систем репарации ДНК с «изолированной» БА и с БА, сочетанной с гипертонической болезнью. Исследованы маркеры генов ATM (rs189037 и rs1801516), NBN (rs709816 и rs1805800), MRE11 (rs473297), TP53BP1 (rs560191), MLH1 (rs1799977), PMS2 (rs1805321). С «изолированной» формой бронхиальной астмы выявлены ассоциации для трех маркеров: rs560191 в гене TP53BP1, rs1799977 в гене MLH1 и rs189037 в гене ATM. С бронхиальной астмой в сочетании с гипертонической болезнью ассоциирован rs1801516 в гене ATM. Помимо этого, результаты исследования указывают на генетически обусловленную неоднородность сочетания бронхиальной астмы и гипертонической болезни в зависимости от первичности проявления одного или другого из изученных заболеваний.

DOI: 10.7868/S3034510326070077

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Babushkina, N.P., Bragina, E.Y., Nemerov, E.V. et al.
Molecular Genetic Aspects of the Effect of Polymorphism in the Genes of DNA Repair System Proteins on the Risk of Developing Bronchial Asthma.
DOI: 10.1134/S102279542670033X

РОЛЬ КОНФОРМАЦИОННОГО СОСТОЯНИЯ ПРОМОТОРНО-ОПЕРАТОРНОЙ ОБЛАСТИ ГЕНА hlyII Bacillus cereus ВО ВЗАИМОДЕЙСТВИИ С РЕГУЛЯТОРОМ ТРАНСКРИПЦИИ HlyIIR

А.С. Нагель, И.С. Кульбаев, М.Г. Шляпников, А.В. Сиунов, Ж.И. Андреева-Ковалевская, А.С. Солонин*

Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина Российской академии наук – обособленное подразделение Федерального исследовательского центра «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук», Московская область, Пущино, 142290 Российская Федерация; е-mail: solonin.a.s@yandex.ru

HlyIIR – негативный транскрипционный регулятор гена гемолизина II Bacillus cereus связывается с необычно длинным инвертированным повтором ДНК (44 пн), расположенным перед геном hlyII. Показано, что димерная форма белка HlyIIR связывается с различными районами операторной области гена hlyII. HlyIIR способен связываться только с двухцепочечной ДНК в виде палиндрома, обладающего зеркальной симметрией. Один димер HlyIIR взаимодействует как с фланкирующими областями оператора, так и с его центральным районом. Эффективность образования комплекса между регулятором и фланкирующими последовательностями в экспериментах in vitro ниже, чем для полноразмерного оператора и его центральной части. Синтетический оператор размером 50 нуклеотидов, образующий шпильку за счет зеркальной симметрии олигонуклеотидов, не взаимодействует с HlyIIR. На основе полученных результатов экспериментальной работы можно предположить, что область взаимодействия имеет следующую структуру: TTTWAAANNNNNNTTTWAAA, где W – A или T.

DOI: 10.7868/S3034510326070085

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Nagel, A.S., Kulbaev, I.S., Shlyapnikov, M.G. et al.
Role of the Conformational State of the Promoter–Operator Region of the Bacillus cereus hlyII Gene in Interaction with HlyIIR Transcription Regulator.
DOI: 10.1134/S1022795426700353

ДИНАМИКА ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ МЕТАБОЛИЗМА КАРОТИНОИДОВ И КРАХМАЛА В ПРОЦЕССЕ СОЗРЕВАНИЯ ЗЕРЕН КУКУРУЗЫ СВЯЗАНА С ПЕРЕХОДОМ В СОСТОЯНИЕ ПОКОЯ

Д.Х. Архестова^1,2, О.К. Анисимова^1,*, А.В. Щенникова¹, Е.З. Кочиева¹

¹ Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук, Москва, 119071 Российская Федерация; e-mail: lelikanis@yandex.ru
² Институт сельского хозяйства – филиал Кабардино-Балкарского научного центра Российской академии наук, Нальчик, 360004 Российская Федерация

В зернах кукурузы на заключительных стадиях созревания (1–9) определен профиль экспрессии генов ключевых ферментов биосинтеза каротиноидов (ZmPSY1, ZmPSY2, ZmCrtRB1) и фосфорилирования крахмала (ZmGWD1) и измерено содержание каротиноидов. Установлено, что уровень экспрессии гена ZmPSY1 в зернах растет по мере созревания и согласуется с усилением интенсивности желтой окраски зерен. Для ZmPSY2 характерен стабильный профиль экспрессии с небольшими различиями между стадиями 1–4 и 6–9; для ZmCrtRB1 – стремительный рост экспрессии на стадиях 6–8 и резкое падение на стадии 9; для ZmGWD1 – увеличение экспрессии до стадии 6 с последующим снижением на стадиях 7–9. Показано, что на стадии 9 уровень транскриптов ZmPSY1 в зернах нижней части початка в ~45 раз превышает таковой в зернах верхней и средней частей, что положительно согласуется с окраской зерна и содержанием каротиноидов.

DOI: 10.7868/S3034510326070093

Translated version (Russ J Genet. Volume 62, issue 7, 2026):
Arkhestova, D.K., Anisimova, O.K., Shchennikova, A.V. et al.
Expression Dynamics of Carotenoid and Starch Metabolism Genes in the Process of Maturation of Maize Grains Is Associated with the Transition to a Dormant State.
DOI: 10.1134/S1022795426700341