Аннотации статей. Том 59, 2023 г., № 11
ГЕНЫ РЕЦЕПТОРОВ ГОРМОНОВ, ВЛИЯЮЩИХ НА ЯИЧНУЮ ПРОДУКТИВНОСТЬ И ВОСПРОИЗВОДИТЕЛЬНЫЕ КАЧЕСТВА КУР
Федеральный научный центр “Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства” Российской академии наук, Московская область, Сергиев Посад, 141311 Россия; e-mail: kulikovegor33@yandex.ru
Яичная продуктивность кур носит сложный полигенный тип наследования, контролируется многими генами, и является результатом сложного процесса, регулируемого гипоталамо-гипофизарно-гонадальной системой. В обзоре обобщена информация о влиянии полиморфизмов генов рецепторов гормонов: фолликулостимулирующего (FSHR), лютеинизирующего (LHCGR), прогестерона (PR) и пролактина (PRLR) на яичную продуктивность и воспроизводительные качества кур. Представленные данные показывают, что полиморфизмы этих генов являются перспективными для использования в селекционных программах с целью улучшения яичной продуктивности и воспроизводительных качеств кур.
DOI: 10.31857/S0016675823110073
EDN: NJHKEA
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Kulikov, E.I., Korshunova, L.G., Karapetyan, R.V. et al.
Genes of Hormone Receptors Affecting Egg Productivity and Reproductive Qualities of Chickens.
DOI: 10.1134/S1022795423110078
ИЗМЕНЕНИЕ ПРОДОЛЖИТЕЛЬНОСТИ ЖИЗНИ КАК ИНТЕГРАЛЬНЫЙ ОТВЕТ НА ИММУННЫЙ СТАТУС ОРГАНИЗМА И АКТИВНОСТЬ МОБИЛЬНЫХ ЭЛЕМЕНТОВ
1 Национальный исследовательский центр “Курчатовский институт”, Москва, 123182 Россия; e-mail: mikhail.trostnikov@gmail.com
2 Сколковский институт науки и технологий, Московская область, Сколково, 121205 Россия
Одной из ключевых задач при изучении молекулярно-генетических основ многих патологий является поиск триггеров, влияние на которые могло бы положительно сказаться на частоте возникновения зависимых от возраста заболеваний и в целом темпах старения. Возможной причиной зависимой от возраста деградации функций организма, индуцирующей старение, является иммуносенесцентность. Известно, что наблюдаемое с возрастом повышение активности мобильных элементов может не только влиять на уровень стабильности генома, но и играть ключевую роль в формировании иммунного ответа. В то же время давно доказана ключевая роль нервной системы в контроле продолжительности жизни, а недавно показано, что компоненты аппарата, регулирующего активность мобильных элементов, функционируют в нервной системе, и их работа влияет на развитие нейродегенеративных заболеваний. В мини-обзоре представлены факты, указывающие на комплексную регуляцию старения со стороны нервной и иммунной систем при участии систем контроля активности мобильных элементов и предложена гипотетическая схема их совместного влияния на продолжительность жизни.
DOI: 10.31857/S0016675823110140
EDN: NDJCID
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Trostnikov, M.V., Malyshev, D.R. & Pasyukova, E.G.
Changes in Life Span as an Integral Response to the Immune Status of the Organism and the Activity of Mobile Elements.
DOI: 10.1134/S1022795423110145
ЛОКАЛИЗАЦИЯ ХРОМОСОМНЫХ РЕГИОНОВ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИХ СОДЕРЖАНИЕ МАГНИЯ И КАЛЬЦИЯ У ОБРАЗЦОВ РИСА
1 Федеральный научный центр риса, Краснодарский край, пос. Белозерный, 350921 Россия; e-mail: yuliya_goncharova_20@mail.ru
2 Кубанский государственный аграрный университет им. И.Т. Трубилина, Краснодар, 350044 Россия
3 ООО “Аратай”, участник инновационного центра Сколково, Москва, 143026 Россия
Отмечено широкое варьирование по признаку “содержание микро- и макроэлементов” как между подвидами, так и внутри видов и сортов риса. Магний как кофактор участвует более чем в 300 ферментативных реакциях и нужен для роста и развития как растений, так и человека. Он влияет на обмен углеводов и белковых веществ. От его концентрации зависят производство аденозинтрифосфа-та (АТФ), синтез нуклеотидов и глюкозы, регуляция окисления липидов. Кальций также необходим для формирования структуры клеточных стенок и их деления. Высокие концентрации кальция изменяют состав и состояние мембран эритроцитов, морфологические характеристики клетки. В то же время вариабельность по признакам отечественных сортов риса до сих пор не изучалась. Также не было исследований о локализации хромосомных регионов, ответственных за формирование признаков “содержание магния и кальция” у российских образцов риса. Установлено широкое варьирование содержания кальция (0.07–2.33%) и магния (2–14%) у отечественных образцов риса. Данные по фенотипированию отечественных сортов риса по признакам качества использовали для выделения контрастных по этим признакам групп сортов и источников. Проведен поиск хромосомных регионов, определяющих качество отечественных образцов, с использованием 58 распределенных по геному риса молекулярных маркеров (SSR) как сцепленных с признаком, так и нейтральных. Выделены пять локусов, определяющих содержание магния и кальция у отечественных сортов риса. Локусы, определяющие содержание магния, расположены на хромосомах 5, 6, 7, 8. Связанных с содержанием кальция было выделено четыре локуса: один на второй хромосоме (при уровне значимости 0.05) и по одному на второй, восьмой и пятой (при уровне значимости 0.09). На пятой хромосоме он расположен (RM 13; 28.6 cM) в непосредственной близости к региону расположения маркера RM 405 (28 cM), который связан с содержанием магния. Ключевые слова: генетика, рис, вариабельность, локусы количественны
DOI: 10.31857/S001667582311005X
EDN: NIVOKY
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Goncharova, J.K., Simonova, V.V., Goncharov, S.V. et al.
Localization of Chromosomal Regions Determining Magnesium and Calcium Content in Rice Varieties.
DOI: 10.1134/S1022795423110054
РАСПРОСТРАНЕНИЕ И СИЛА АЛЛЕЛЕЙ ГЕНОВ ГИБРИДНОГО НЕКРОЗА В ГЕНОТИПАХ КАНАДСКИХ СОРТОВ ЯРОВОЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ (Triticum aestivum L.)
1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: pukhalsk@vigg.ru
2 Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К.А. Тимирязева, Москва, 127434 Россия
Исследовано генетическое разнообразие 30 канадских сортов яровой мягкой пшеницы (Triticum aestivum L.). Показано наличие двух типов сортов яровой мягкой пшеницы Канады, различающихся по некрозным генотипам. Одни сорта имели генотип ne1ne1Ne2Ne2, а вторые – генотип ne1ne1ne2ne2. Генотип Ne1Ne1ne2ne2 отсутствует. Гены Ne2 представлены аллелями средней силы – ms и сильными – s. По родословным определены сорта-доноры гена Ne2.
DOI: 10.31857/S0016675823110115
EDN: NNKKRK
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Pukhalskiy, V.A., Rubets, V.S., Bilinskaya, E.N. et al.
Distribution and Allele Strength of Hybrid Necrosis Genes in the Genotypes of Canadian Cultivars of Spring Bread Wheat (Triticum aestivum L.).
DOI: 10.1134/S102279542311011X
ПРИЧИНЫ МОРФОЛОГИЧЕСКОЙ И ГЕНЕТИЧЕСКОЙ НЕОДНОРОДНОСТИ СИГОВ Coregonus lavaretus sensu lato АРКТИЧЕСКОЙ ЧАСТИ БАССЕЙНА р. ЛЕНЫ
1 Институт систематики и экологии животных Сибирского отделения
Российской академии наук, Новосибирск, 630091 Россия; e-mail: nikson_1960@mail.ru
2 Государственный научно-исследовательский институт озерного и речного рыбного хозяйства,
Санкт-Петербург, 199053 Россия
3 Северо-Восточный федеральный университет, Якутск, 677980 Россия
4 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия
Представлены результаты морфологического и генетического анализа популяций/форм/видов пыжьяновидных сигов из среднего и нижнего течения р. Лены и сопредельных рек. Есть основания полагать, что несмотря на значительную неоднородность сига в Сибири в водоемах сибирского Заполярья обитает небольшое число устойчивых форм/видов. Это восточносибирский (C. lavaretus pidschian n. brachymystax), ледниково-равнинный (C. lavaretus pidschian n. glacialis) и юкагирский сиг (C. lavaretus pidschian n. jucagiricus), а также их гибридные популяции. Ледниково-равнинный сиг и его производные отличаются от восточносибирского сига по пластическим признакам, но по меристическим они идентичны. Молекулярно-генетические исследования показали, что в большинстве ледниково-равнинный сиг формирует обширные слабосвязанные сети гаплотипов, что соответствует длительному существованию популяций в благоприятных условиях. Гаплотипы восточносибирского сига тесно связаны с гаплотипами форм/видов сигов из водоемов Южной Сибири и имеющих радиальную структуру медианной сети. Подобная структура сетей свидетельствует о недавнем сокращении численности восточносибирского сига с последующей экспансией, что напрямую связанно с событиями четвертичных оледенений.
DOI: 10.31857/S0016675823110036
EDN: TNYIZN
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Bochkarev, N.A., Sendek, D.S., Zuykova, E.I. et al.The Causes of Morphological and Genetic Heterogeneity in the White Fish Coregonus lavaretus sensu lato from the Arctic Part of the Lena River Basin.
The Causes of Morphological and Genetic Heterogeneity in the White Fish Coregonus lavaretus Sensu Lato from the Arctic Part of the Lena River Basin.
DOI: 10.1134/S1022795423110030
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ОЦЕНКА ПРОГНОЗИРУЕМОГО ОСТАТОЧНОГО ПОТРЕБЛЕНИЯ КОРМА И ЭКСПРЕССИЯ ЗНАЧИМЫХ ГЕНОВ-КАНДИДАТОВ СВИНЕЙ ПОРОДЫ ДЮРОК И ТОВАРНЫХ ПОМЕСЕЙ ВТОРОГО ПОКОЛЕНИЯ
Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста, пос. Дубровицы, Московская обл., 142132 Россия; e-mail: belousa663@gmail.com
Остаточное потребление корма (RFI) – одна из основных и сложных кормовых характеристик, которая экономически важна для животноводства. Однако генетические и биологические механизмы, регулирующие данный признак, у свиней в значительной степени неизвестны. Таким образом, настоящее исследование было направлено на выявление полногеномных однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), генов-кандидатов, участвующих в регуляции RFI, их биологических путей и кластеризации, с использованием полногеномного анализа ассоциации (GWAS). Исследование проводилось на свиньях породы дюрок (n = 783) и их товарных гибридах второго поколения (n = 250), проходящих тестовый откорм на автоматических кормовых станциях индивидуального учета. В результате были получены значимые по онтологии биологических функций и по экспрессии в тканях и органах гены, имеющие связь с RFI. К таким генам-кандидатам отнесены гены, кодирующие адгезию–рецептор, связанный с белком G6 (ADGRG6), центромерный белок S (APITD1), карбоксипептидазу E (CPE), трансмембранный кальций-связывающий белок (SYTL2), молекулу клеточной адгезии 1 (CADM1), протоонкоген Fli-1, фактор транскрипции ETS (FLI1), трансмембранный белок 3 теневрина (TENM3), простагландин Е4 (PTGER4) и член 2 подсемейства D калиевых потенциал-зависимых каналов (KCND2). Также анализ полученных данных по кластеризации показал разделение на биологическую, функциональную и молекулярную библиотеки и данные, опубликованные в PubMed. Объединяя полученную информацию, можно сказать, что генетическая составляющая показателя прогнозируемого остаточного потребления корма важна, о чем было указано в предыдущих исследованиях. В связи с чем возникает необходимость создания молекулярных диагностик и разработки расчетов геномной оценки, в совокупности с конверсией корма, что позволит улучшить показатели продуктивности в племенных стадах свиней и улучшить качество производимой продукции.
DOI: 10.31857/S0016675823110024
EDN: NNVFQI
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Belous, A.A., Sermyagin, A.A. & Zinovieva, N.A.
Genetic Assessment of Projected Residual Feed Consumption and Expression of Significant Candidate Genes in Duroc Pigs and Second-Generation Commercial Blends.
DOI: 10.1134/S1022795423110029
ИЗУЧЕНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ И ПОПУЛЯЦИОННОЙ СТРУКТУРЫ ОСЕТИНСКОЙ ПОРОДЫ В СРАВНЕНИИ С ДРУГИМИ ПОРОДАМИ ГРУБОШЕРСТНЫХ ЖИРНОХВОСТЫХ ОВЕЦ НА ОСНОВЕ ДАННЫХ SNP-ГЕНОТИПИРОВАНИЯ
1 Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ им. академика Л.К. Эрнста,
городской округ Подольск, пос. Дубровицы, 142132 Россия; e-mail: * horarka@yandex.ru, ** n_zinovieva@mail.ru
2 Российский государственный аграрный университет – МСХА им. К.А. Тимирязева, Москва, 127434 Россия
Впервые проведен анализ генетического разнообразия осетинской породы овец с использованием полногеномных SNP-профилей в сравнительном аспекте с другими российскими грубошерстными породами. Установлено, что осетинская порода отличается высоким генетическим и аллельным разнообразием. Впервые рассчитаны современные и исторические эффективные размеры популяции осетинской породы. Показаны близкие генетические взаимосвязи между осетинской и карачаевской породами овец, что подтверждается низким значением дифференциации (Fst = 0.009) и формированием единого кластера в структуре генетической сети. Выявлена схожесть популяционной структуры осетинской и карачаевской пород.
DOI: 10.31857/S0016675823110048
EDN: NNRNBV
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Deniskova, T.E., Dotsev, A.V., Selionova, M.I. et al.
Study of Genetic Diversity and Population Structure of the Osetin Breed in Comparison with Other Coarse Wool Fat-Tailed Sheep Breeds Based on SNP Genotyping Data.
DOI: 10.1134/S1022795423110042
ОЦЕНКА АССОЦИАЦИИ СТЕПЕНИ МЕТИЛИРОВАНИЯ ДНК И ЧАСТОТЫ ХРОМОСОМНЫХ АБЕРРАЦИЙ ЛИМФОЦИТОВ ЧЕЛОВЕКА ПРИ ОДНОКРАТНОМ ОБЛУЧЕНИИ КРОВИ in vitro
1 Северский биофизический научный центр Федерального медико-биологического агентства,
Томская обл., Северск, 636013 Россия; e-mail: olga-tsymbal@mail.ru
2 Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова, Москва, 115478 Россия
3 Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, 634009 Россия
4 Сибирский государственный медицинский университет, Томск, 634050 Россия
Наиболее чувствительной к радиационному воздействию биомолекулой является ДНК, повреждения которой проявляются, в том числе, в виде хромосомных аберраций (ХА). Метилирование ДНК участвует в регуляции экспрессии генов, репликации, репарации ДНК и др. Изменение процессов метилирования ДНК подвержено воздействию γ-излучения. Цель исследования – оценить связь степени метилирования ДНК и частоты ХА после острого облучения in vitro лимфоцитов крови человека γ-излучением. В исследовании приняли участие десять условно здоровых работников Сибирского химического комбината, в лимфоцитах крови которых оценивали степень метилирования CpG-динуклеотидов (широкогеномное бисульфитное секвенирование, XmaI-Reduced representation bisulfite sequencing – XmaI-RRBS) и частоту ХА (цитогенетическое исследование) после острого облучения крови in vitro в дозе 1.5 Гр. Выявили, что острое облучение крови γ-излучением привело к увеличению в лимфоцитах частоты аберрантных клеток, дицентрических хромосом, хроматидных и хромосомных фрагментов. Корреляционный анализ статуса метилирования CpG-динуклеотидов и частоты ХА выявил изменения степени метилирования 97 генов, которые с высокой силой положительно (56 генов) или отрицательно (41 ген) связаны с повышенной частотой ХA. В ходе широкогеномного скрининга генов, метилирование которых коррелирует с повышенной частотой ХА, выявлены гены, перспективные в качестве потенциальных маркеров радиационного воздействия и изучения механизмов формирования радиочувствительности организма, а также радиорезистентности опухолей при лучевой терапии.
DOI: 10.31857/S0016675823110152
EDN: NGTOJL
Translated version (Russ J Genet. Volume 59, issue 11, 2023):
Tsymbal, O.S., Isubakova, D.S., Bronikovskaya, E.V. et al.
Assessing the Association of the Degree of DNA Methylation and the Frequency of Chromosomal Aberrations in Human Lymphocytes in a Single Irradiation of Blood In Vitro.
DOI: 10.1134/S1022795423110157
МОЛЕКУЛЯРНЫЙ ЛАНДШАФТ РАКА ПОЛОСТИ РТА У МОЛОДЫХ ПАЦИЕНТОВ
1 Научно-исследовательский институт онкологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр
Российской академии наук, Томск, 634009 Россия; е-mail: elenakolegova@oncology.tomsk.ru
2 Сибирский государственный медицинский университет, Томск, 634050 Россия
Рак полости рта (РПР) – наиболее распространенный тип злокачественных новообразований головы и шеи. При этом рак языка (РЯ) представляет собой наиболее часто встречающуюся форму РПР и характеризуется более агрессивным течением и высокой вероятностью прогрессирования. РПР и РЯ считаются заболеваниями пожилых л