Аннотации статей. Том 58, 2022 г., № 12
ОСОБЕННОСТИ СТРУКТУРЫ ГЕНОФОНДА И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИСТОРИЯ САХА (ЯКУТОВ)
1 Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова, Якутск, 677013 Россия; e-mail: sardaanafedorova@mail.ru
2 Якутский научный центр комплексных медицинских проблем, Якутск, 677000 Россия
3 Институт биохимии и генетики Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук, Уфа, 450054 Россия
В обзоре суммированы результаты молекулярно-генетических исследований структуры генофонда и генетической истории народа саха (якутов) в контексте данных по антропологии, лингвистике, истории и археологии. Описаны характерные особенности генетической структуры якутской популяции по линиям Y-хромосомы, митохондриальной ДНК и данным полногеномного анализа аутосомных локусов. Рассмотрены состав и соотношение компонентов генофонда различного происхождения и генетические взаимоотношения саха с народами Якутии и соседних регионов. Реконструкция генетической истории популяции позволила ответить на ряд вопросов, касающихся этногенеза якутов.
DOI: 10.31857/S0016675822120037
СОВРЕМЕННЫЕ ТЕНДЕНЦИИ И ПОДХОДЫ ПОИСКА ГЕНЕТИЧЕСКИХ ДЕТЕРМИНАНТ СТАРЕНИЯ И ДОЛГОЛЕТИЯ
1 Научно-технологический университет “Сириус”, Научный центр генетики и наук о жизни,
Краснодарский край, Сочи, 354340 Россия; e-mail: kunizheva@gmail.com
2 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, 119234 Россия
3 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия
4 Медицинская школа Чан Массачусетского университета, департамент психиатрии, Шрусбери, 01545 США
Старение является естественным процессом угасания организма и основным аспектом, определяющим продолжительность жизни для особей, доживших до пострепродуктивного периода. Процесс старения сопровождается определенными физиологическими, иммунными и метаболическими изменениями в организме, а также развитием возрастных заболеваний. Вклад генетических факторов в продолжительность жизни человека оценивается примерно в 25–30%. Несмотря на успехи в выявлении генов и метаболических путей, которые могут участвовать в процессе увеличения продолжительности жизни у модельных организмов, остается ключевым вопрос, насколько эти данные можно экстраполировать на человека, например из-за сложности его биологических и социокультурных систем, а также из-за возможных видовых различий в продолжительности жизни и причин смертности. Новые молекулярно-генетические методы значительно расширили возможности для поиска генетических факторов продолжительности жизни человека и выявления метаболических путей старения, взаимодействия генов и факторов транскрипции, регуляции экспрессии генов на уровне транскрипции и эпигенетических модификаций. В обзоре представлены последние исследования и современные стратегии для изучения генетической основы старения человека и долголетия: изучение отдельных генов-кандидатов в генетических популяционных исследованиях, вариации, выявленные методом поиска ассоциаций GWAS, иммуногенетические отличия при старении, а также геномные исследования для выявления факторов “здоровой старости”. Понимание механизмов взаимодействия факторов, влияющих на продолжительность жизни, и возможность их регуляции могут стать основой для разработки комплексных мер по достижению здорового долголетия.
DOI: 10.31857/S0016675822120062
КЛИМАТИЧЕСКИЕ ФАКТОРЫ И ВСТРЕЧАЕМОСТЬ АЛЛЕЛЕЙ ЛОКУСОВ Amy 1 И Amy 2 В КУЛЬТУРЕ ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ НА ТЕРРИТОРИИ БЫВШЕГО СССР
1 Белгородский федеральный аграрный научный центр Российской академии наук, Белгород, 308001 Россия; e-mail: v.netsvetaev@yandex.ru
2 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: pomortsev@vigg.ru
Изоферменты альфа-амилазы у ячменя контролируются локусами Amy 1 и Amy 2, расположенными в хромосомах 6 и 1 (=6H и 7H) соответственно. Анализ сортов ярового ячменя, возделывавшихся на территории бывшего СССР до 1993 г., показал распространение среди них 11 аллелей по локусу Amy 1 и четыре аллеля по Amy 2. Встречаемость их носила не случайный характер. Наибольшее распространение имели аллели Amy 1.1 и Amy 2.1. Сочетание данных аллелей у сортов составило 44.6 ± 2.9%. Следующие по величинам встречаемости были сочетания Amy 1.5 с Amy 2.1, составившие 10.9 ± 2.2% и Amy 1.4 с Amy 2.1 – 10.4 ± 2.1%. Исследовалось распространение аллелей локусов Amy 1 и Amy 2 у сортов, районированных по 25 провинциям СССР, отличающихся климатическими характеристиками. Установлено, что аллели Amy 1.1 и Amy 1.3 показали положительную связь с повышенными температурами, но отрицательную с влагообеспеченностью. Напротив, аллели Amy 1.4 и Amy 1.6 продемонстрировали отрицательную реакцию на высокую температуру, но положительную на вла-гообеспеченность. Анализ распространения аллелей локуса Amy 2 показал, что с аридными условиями внешней среды связан аллель Amy 2.2. Аллель Amy 2.1, наоборот, приурочен к регионам с хорошей влагообеспеченностью и без экстремальных высоких температур. Континентальность не играла значительной роли в распространении аллелей данных локусов. В результате, в направлении с севера на юг встречаемость аллеля Amy 1.1 увеличивалась. Так, если в северных широтах европейской части она составляла 27–31%, то в степных южных районах частота аллеля Amy 1.1 увеличивалась до 78–85%. В направлении с запада на восток такой четкой динамики не прослеживалось. Во встречаемости аллеля Amy 1.2 обнаружена аналогичная картина. Распространение аллеля Amy 2.1 уменьшалось с севера на юг. Наоборот, частота другого аллеля – Amy 2.2 в этом направлении среди районированных сортов ярового ячменя увеличивалась с 7–12 до 15–38%. Характерно, что аллель Amy 1.1 обусловливает устойчивость к повышенным температурным значениям и недостатку влаги, а аллель Amy 2.1 – способствует положительному ответу на хорошую влагообеспеченность при отсутствии экстремальных высоких температур. Сочетание данных генетических факторов обусловливает наибольшее распространение по территории возделывания ярового ячменя.
DOI: 10.31857/S0016675822120098
АНАЛИЗ ГЕНОВ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИХ КОМПАКТНУЮ ФОРМУ РАСТЕНИЙ АРБУЗА Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai, У ОБРАЗЦОВ ИЗ КОЛЛЕКЦИИ ВИР
Федеральный исследовательский центр Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова, Санкт-Петербург, 190000 Россия; e-mail: k.strygina@vir.nw.ru
Компактная форма растений арбуза, определяемая признаками кустовости и короткоплетистости, имеет важное экономическое значение, определяя рациональное использование посевных площадей за счeт высокой плотности посадки и возможность механизированной обработки и уборки. В связи с этим изучение генов, определяющих малый габитус растений арбуза, является важной задачей для ускорения селекции этой культуры. Цель данной работы – изучение известных и поиск новых генов компактности растений арбуза Citrullus lanatus (Thunb.) Matsum. & Nakai на основе анализа уникальной коллекции бахчевых культур ВИР им. Н.И. Вавилова и селекционных форм селекции Кубанской опытной станции ВИР. В результате у всех кустовых и ультракустовых генотипов, кроме двух образцов из Азербайджана, выявлена известная мутация гена dw-1 (кодирует ABC-транспортeр). Компактная форма этих двух образцов, как удалось установить, не связана и с другими известными генами, dsh (кодирует гиббереллин-20-оксидазу) и df (кодирует гиббереллин-3β-гидроксилазу), или их копиями, df2 и dsh2, выявленными в настоящем исследовании. Таким образом, в коллекции бахчевых культур ВИР содержатся источники потенциально новых генов, определяющих кустовую форму арбуза.
DOI: 10.31857/S001667582212013X
ГОМОЛОГИ ГЕНОВ УСТОЙЧИВОСТИ К ФИТОФТОРОЗУ У ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ КЛУБНЕОБРАЗУЮЩИХ ВИДОВ РОДА Solanum L.
1 Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова, Санкт-Петербург, 190000 Россия; e-mail: a.gurina@vir.nw.ru
2 Всероссийский научно-исследовательский институт защиты растений, Санкт-Петербург, Пушкин, 196608 Россия
Возбудитель фитофтороза, оомицет Phytophthora infestans Mont de Bary, обладает высокой степенью изменчивости, в результате чего новые расы патогена способны преодолеть устойчивость длительное время возделываемых сортов картофеля. Примитивные культурные виды картофеля относятся к первичному генофонду, представители которого легко скрещиваются с Solanum tuberosum L., и их использование для селекции перспективно. Цель исследования – идентификация генотипов диких и примитивных культурных видов картофеля ВИР, несущих Rpi-гены. Впервые образцы примитивных культурных и диких видов картофеля (105 генотипов из коллекции ВИР) проанализированы на устойчивость к фитофторозу и наличие у них SCAR-маркеров Rpi-генов (RB/blb1, Rpi-blb2, R2-like, Rpi-vnt1.3). У культурного вида S. stenotomum subsp. stenotomum обнаружена высокая (0.71) частота одного из двух маркерных фрагментов гена RB/blb1 (Rpi-sto1), исходно охарактеризованного у дикого североамериканского вида S. bulbocastanum, который относится к третичному генофонду видов картофеля. У видов S. phureja и S. stenotomum subsp. goniocalyx обнаружена высокая (0.71–0.88) частота маркера гена Rpi-vnt1.3, исходно охарактеризованного у дикого южноамериканского вида S. venturii. Впервые у примитивных видов картофеля охарактеризованы последовательности фрагментов – предполагаемых гомологов генов Rpi-vnt1 и RB/blb1. У представителей S. ajanhuiri, S. stenotomum и S. phureja обнаружены три варианта нуклеотидных последовательностей, гомологичных Rpi-vnt1.3. Сделано предположение о возможной роли обнаруженного полиморфизма маркерных фрагментов Rpi-vnt1.3 в обеспечении устойчивости примитивных культурных видов к фитофторозу.
DOI: 10.31857/S0016675822120049
STR-ТИПИРОВАНИЕ ЕВРОПЕЙСКОГО ЛОСЯ И ЕВРОПЕЙСКОЙ КОСУЛИ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ НОВЫХ КРИМИНАЛИСТИЧЕСКИХ НАБОРОВ ВЫЯВИЛО РАЗЛИЧНЫЕ ПАТТЕРНЫ ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ ДВУХ ВИДОВ ОЛЕНЕВЫХ В БЕЛАРУСИ
1 Кафедра судебной медицины Гданьского медицинского университета, Гданьск, 80-210 Польша
2 Научно-практический центр Государственного комитета судебных экспертиз, Минск, 220073 Беларусь; e-mail: Nedzvedskayadiana@gmail.com
3 Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук, Москва, 119071 Россия
4 Республиканское унитарное предприятие “БелЮрОбеспечение”, Минск, 220069 Беларусь
Для судебно-экспертной идентификации биологических образцов лосей (Alces alces) и косуль (Capreolus capreolus) разработаны тест-системы для генотипирования, включающие 16 и 12 микросателлитов (STR-локусов) соответственно. Информативность тест-систем проверена генотипированием биологических образцов 386 лосей и 360 косуль из всех шести административных регионов Беларуси. Анализ молекулярной дисперсии выявил генетическую однородность популяции лосей практически по всей территории страны и значительную региональную генетическую дифференциацию популяции косуль. Причиной наблюдаемой популяционно-генетической структуры лосей в Беларуси является “бутылочное горлышко” – задокументированное массовое сокращение популяции в 1920-х гг. с последующим быстрым расширением популяции на основе однородного генетического субстрата, унаследованного от небольшой предковой популяции. Наблюдаемая географическая подразделенность европейской косули, вероятно, является результатом многочисленных генетических дрейфов и/или локального межвидового потока генов между двумя видами косули, обусловленного искусственным расселением сибирской косули (C. pygargus) в Восточной Европе в XX в. Вероятность различения генотипов двух неродственных особей с использованием общебелорусской базы генотипов лосей составляет выше 0.99999999999. В случае использования региональных баз данных генотипов косуль вероятность различения генотипов двух неродственных особей превышает 0.999999999. Это первое исследование, в котором представлены тест-системы для генетической ДНК-идентификации биологических образцов лосей и косуль, статистические параметры которых охарактеризованы исследованием генетической структуры популяций в масштабе всей страны, и с панелью STR-маркеров, достаточной для достижения доказательств уровня чрезвычайно убедительных в судебной экспертизе объектов дикой природы. Судебно-экспертные методики ДНК-идентификации биологических образцов животных вида лось (A. alces) и косуля (C. capreolus) имплементированы в национальную правовую систему Республики Беларусь.
DOI: 10.31857/S0016675822120104
ГЕНЫ TMEM136 И PPP1R12C, ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНО ЭКСПРЕССИРУЮЩИЕСЯ В ПЛАЦЕНТЕ, АССОЦИИРОВАНЫ С РИСКОМ РАЗВИТИЯ ПРЕЭКЛАМПСИИ
1 Белгородский государственный национальный исследовательский университет, Белгород, 308015 Россия; e-mail: reshetnikov@bsu.edu.ru
2 Научно-исследовательский институт медицинской генетики Томского национального исследовательского медицинского центра Российской академии наук, Томск, 634009 Россия
Изучены ассоциации генов, дифференциально экспрессирующихся в плаценте, с риском развития преэклампсии (ПЭ) у женщин Центральной России. Исследование проведено на выборке из 366 беременных с преэклампсией и 631 женщин контрольной группы. Всем беременным проводилось типирование специально отобранных девяти SNP генов, дифференциально экспрессирующихся в плаценте. Ассоциации SNP генов-кандидатов c преэклампсией оценивали при помощи логистической регрессии. Для полиморфных вариантов, показавших ассоциации с ПЭ, оценивали in silico их функциональные эффекты. Установлено, что аллель G rs36011588 TMEM136 оказывает протективный эффект (ОШ = 0.65), а гаплотип CA гаплоблока rs2532058–rs66707428 PPP1R12C является фактором риска (ОШ = 1.21) развития преэклампсии. Ассоциации данных SNP с формированием преэклампсии могут быть обусловлены их важным эпигенетическим значением: расположены в сайтах для модифицированных гистонов в областях промоторов и энхансеров, в ДНКаза-гиперчувствительных сайтах, сайтах связывания с регуляторными белками, в доменах связывания с факторами транскрипции. Также данные локусы связаны с уровнем транскрипции и альтернативного сплайсинга в тканях, патогенетически значимых для развития преэклампсии.
DOI: 10.31857/S0016675822120116
ПОЛИМОРФНЫЙ ЛОКУС rs167479 ГЕНА RGL3 АССОЦИИРОВАН С РИСКОМ РАЗВИТИЯ ПРЕЭКЛАМПСИИ ТЯЖЕЛОГО ТЕЧЕНИЯ
Белгородский государственный национальный исследовательский университет, Белгород, 308015 Россия; e-mail: abramova_myu@bsu.edu.ru
В настоящей работе были изучены ассоциации полиморфизма генов-кандидатов артериальной гипертензии с развитием преэклампсии (ПЭ) тяжелого течения у населения Центрального Черноземья России. Проведено генотипирование пяти полиморфных вариантов (rs1799945 гена HFE, rs8068318 гена TBX2, rs1173771 гена AC025459.1, rs932764 гена PLCE1, rs167479 гена RGL3) у 217 женщин с ПЭ тяжелого течения и 235 беременных с ПЭ умеренного течения. Выявлено, что аллель G и генотип GG полиморфного локуса rs167479 гена RGL3 ассоциирован с риском развития ПЭ тяжелого течения согласно аллельной (OR = 1.35, рperm = 0.02), аддитивной (OR = 1.36, рperm = 0.02) и рецессивной ( OR = 1.61, рperm = 0.04) генетическим моделям. Установлено, что данный полиморфный локус локализуется в функционально активном регионе генома, выполняющем функции энхансеров и промоторов в различных органах и тканях, является областью гиперчувствительности к ДНКазе-1, местом связывания с девятью факторами-регуляторами транскрипции и ассоциирован с уровнем экспрессии гена CTC-510F12.3 в гипофизе. Кроме того, rs167479 определяет миссенс-мутацию, приводящую к замене Pro162His в белке RalGDS-like3 и имеющую предикторный потенциал “PROBABLY DAMAGING”.
DOI: 10.31857/S0016675822120025
ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ТЕХНОЛОГИИ KASP ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ АССОЦИАЦИЙ ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ВАРИАНТОВ В ГЕНАХ GPAD4, CCL3, DGKG, PPARGC1A, STAT1, TLR4 С МОЛОЧНОЙ ПРОДУКТИВНОСТЬЮ КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА
1 Уральский федеральный аграрный научно-исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург, 620142 Россия; e-mail: mmodorov@gmail.com
2 Институт экологии растений и животных Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург, 620144 Россия
С использованием метода KASP-генотипирования определены частоты аллелей шести однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в выборке племенного голштинизированного черно-пестрого скота Свердловской области. SNP8: g.107062990G>A гена TLR4 (rs8193048) не проявил изменчивости в анализируемой выборке крупного рогатого скота, остальные SNP были изменчивы. Проведен ассоциативный тест между генотипами коров и удоем за 305 дней первой лактации, процентным содержанием и количеством жира и белка молока. Для SNP CCL3 rs109686238, DGKG rs41608610, PPARGC1A rs133669403 и STAT1 rs43705173 – ассоциации не выявлены. При проведении маркер-ориентированной селекции, направленной на увеличение молочной продуктивности голштинизированного черно-пестрого скота Свердловской обл., использовать эти локусы не рекомендуется. Для SNP27: g.36531442T>C гена GPAD4 (rs109913786) показана ассоциация с процентным содержанием жира в молоке. Дана рекомендация по использованию этого SNP в программах маркер-ориентированной селекции уральской популяции голштинизированного черно-пестрого скота.
DOI: 10.31857/S0016675822120086
Статьи, опубликованные только в Russian J. of Genetics, № 12 – 2022 г.
Genetic Diversity and Population Structure of Traditional Chinese Herb Radix bupleuri Resources Using Genome-Wide SNPs through Genotyping-by-Sequencing
1 School of Pharmacy, Heilongjiang University of Chinese Medicine, Harbin, Heilongjiang, 150000 China
2 Department of Science and Technology, Qiqihar Medical University, Qiqihar, Heilongjiang, 161006 China
3 School of Forestry, Northeast Forestry University,Harbin, Heilongjiang, 150000 China
Correspondence to W. Ma
Radix bupleuri, is an important traditional Chinese medicine resource. The lack of genetic molecular markers of Radix bupleuri turned to be an obstacle for genetic analysis and accessions identification. In this study, SNP loci were detected based on genotyping-by-sequencing (GBS) and the genetic diversity of 39 Bupleurum varieties were examined. A total of 25.1 Gb of data was obtained by sequencing, with an average of 0.64 Gb per sample. After screening, 83 898 high-quality SNPs were obtained. The 39 accessions could be divided into three major groups based on population structure analysis, Neighbor-joining clustering and principal component analysis. The average observed heterozygosity and expected heterozygosity of Bupleurum populations were 0.24 and 0.17, respectively, indicating that Bupleurum populations from five different provinces had a low level of genetic diversity. Population nucleotide diversity analysis and analysis of molecular variance showed that the percentage of intrapopulation variation was 92.13%, while the percentage of interpopulation variation was only 7.87%. There was relative aggregation of Bupleurum samples with the same geographical origin, but the division of population structure was not completely correlated with sample origin. The results showed that the genetic diversity of the materials was narrow. This provides a good basis for the genetic breeding and protection of species diversity of Bupleurum.
DOI: 10.1134/S1022795422120055
Genome-wide selection signal analysis of Australian Boer goat by insertion/deletion variants
College of Animal Science and Technology, Southwest University, Chongqing, 400715 China
Correspondence to G. E
Selection in breeds for commercial goat is needed for production efficiency, growth trait alteration, and improved livestock quality. Boer goat is famous for its stable production performance, fast growth rate, and high meat production. Detecting selective signatures in its genome can elucidate selection mechanisms for its economic and adaptive traits. In this study, 1 122 858 InDels were identified based on the whole genomes of 46 Australian Boer goats and 81 indigenous goats. FST was used to identify the candidate selection signatures in 127 goats. A total of 11 229 InDels were obtained from the top 1% of all InDels, and 1239 candidate genes were annotated. A total of 1193 and 476 candidate genes were involved in 4726 GO terms and 299 KEGG pathways, respectively. Many genes were related to muscle development (MEF2C, MAPK14, TMOD1, etc.), reproduction (SRD5A1, FBXW11, DMRT1, etc.), immunity (CD200, SGK1, IL17RB, etc.) and metabolism (INSR, STXBP3, H6PD, etc.). The results provide novel and important insights into the genetic basis of selection in Boer goat and may be useful for goat molecular breeding.
DOI: 10.1134/S1022795422120158
Nuclear and Mitochondrial DNA Suggest that Nature Reserve Maintains Novel Haplotypes and Genetic Diversity of Honeybees (Apis cerana)
Guizhou Institute of Integrated Agriculture Development, Guizhou Academy of Agricultural Sciences, 1 Jinxin Community, Guiyang, 550006 People’s Republic of China
Correspondence to X. Wei
Declining wild honeybee (Apis) resources could cause the extinction of symbiotic relationships between plants and honeybees, reducing food production. Therefore, the protection of genetic resources and the diversity of wild honeybees are crucial. This study examined the honeybees in a plant nature reserve (Leigongshan) to better understand their genetic status in a purely natural state and explored the potential role of this plant nature reserve on pollinators. Nuclear (15 microsatellites) and mitochondrial markers (tRNAleu ~ COII and COI) were used to investigate the genetic resources and diversity of eastern honeybees (Apis cerana). Here, 31 new honeybee haplotypes were discovered from the inside and outside regions of the reserve. The honeybees showed a high genetic diversity level (He: 0.6564 ± 0.1594, Na: 3–18, PIC: 0.6191 ± 0.1718, Hd in tRNAleu ~ COII: 0.6797, Hd in COI: 0.8103), and no apparent genetic differentiation was observed between the two regions. Thus, we speculate that Leigongshan Nature Reserve protects honeybees from human disturbance and prevents a decline in their population size, preserving the honeybee genetic resources and high genetic diversity level. Furthermore, our results have revealed the practical function of the plant nature reserve on honeybee genetic resources, which explains the decreasing honeybee resources.
DOI: 10.1134/S1022795422120146
Genetic diversity among Takifugu rubripes and Takifugu obscurus in different regions of China based on mitochondrial DNA sequencing data
1 College of Fisheries and Life Science, Dalian Ocean University, Dalian, 116023 China
2 School of Bioengineering, Dalian University of Technology, Dalian, 116024 China
Correspondence to X. Qiu or X. Wang
The purpose of this study was to explore the genetic diversity, genetic structure, and phylogenetic relationships of different cultured populations of Takifugu rubripes and T. obscurus in China, and to find a DNA barcode that can effectively distinguish one species from the other. In total, 120 T. rubripes and 130 T. obscurus individuals were collected from four and three different regions, respectively. Based on the sequences of the mitochondrial genes COI, COII, COIIIIII, 16S rDNA, and Cytb, the genetic diversity and genetic evolution of the different populations of T. rubripes and T. obscurus were analyzed, and the genes with more polymorphic loci and high genetic diversity were selected for DNA barcoding for the identification of the two species. The results showed that Cytb had the highest genetic diversity, consistent with the genetic diversity of the other four genes. T. rubripes and T. obscurus have low haplotype and diversity indices, indicating that they may be subjected to variety of processes, such as inbreeding or domestication, that could lead to a continuous decline in diversity. From the perspective of differentiation and phylogeny, gene exchange may occur between some of the studied populations. Many populations of T. rubripes and T. obscurus showed limited variation, indicating that they reproduce according to the neutral evolution model, and that their diversity cannot be improved. In addition, the Cytb gene fragment used can effectively distinguish T. rubripes from T. obscurus, which can provide support for species identification and breeding in the future.
DOI: 10.1134/S1022795422120079