К списку номеров

 

Аннотации статей. Том 57, 2021 г., № 1

 

ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ ПОДХОДЫ К ФОРМИРОВАНИЮ ПАНЕЛЕЙ ДНК-МАРКЕРОВ ДЛЯ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЭТНОГЕОГРАФИЧЕСКОГО ПРОИСХОЖДЕНИЯ ИНДИВИДА В СУДЕБНОЙ ЭКСПЕРТНОЙ ДЕЯТЕЛЬНОСТИ

М.С. Парфенчик1,*, С.А. Котова2

1 Центральный аппарат Государственного комитета судебных экспертиз Республики Беларусь, Минск, 220030 Республика Беларусь; e-mail: maria.parfenchyk@gmail.com
2 Научно-практический центр Государственного комитета судебных экспертиз Республики Беларусь, Минск, 220114 Республика Беларусь

 

Установление этногеографического происхождения неизвестного индивида при криминалистических исследованиях может нести важную информацию для следствия. Данная информация может быть извлечена из биологических следов посредством использования технологий массового параллельного секвенирования ДНК и специально разработанных панелей маркеров. Формирование панелей маркеров, применяемых при установлении этногеографического происхождения индивида, происходит в два этапа: 1) получение данных о полиморфизме ДНК индивидов из различных популяций; 2) отбор и проверка отобранных маркеров аутосомной, Y-, X-хромосомной ДНК. В случае, если эти маркеры ассоциированы с генетическими заболеваниями, их использование может быть ограничено в связи с необходимостью соблюдения медицинской тайны. В настоящей статье анализируются опубликованные в научно-практической литературе подходы к отбору маркеров, используемых при дифференцировке популяций с целью формирования панели маркеров и ее применения в судебной экспертизе в Республике Беларусь при установлении этногеографического происхождения неизвестного индивида.

DOI: 10.31857/S0016675821010100

 

 

СИМБИОТИЧЕСКИЕ МОДЕЛИ ДЛЯ РЕКОНСТРУКЦИИ ОРГАНЕЛЛОГЕНЕЗА

Н.А. Проворов*

Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, 196602 Россия; e-mail: provorovnik@yandex.ru

 

Различные группы протеобактерий и цианобактерий, а также одноклеточных водорослей, образующих эндосимбиозы с растениями и животными, представлены в качестве моделей для реконструкции органеллогенеза (преобразования симбиотических микроорганизмов в клеточные органеллы) как наиболее яркого проявления симбиогенной эволюции, основанной на формировании партнерами объединенных систем наследственности. Органеллогенез включает следующие преобразования: факультативные ненаследуемые внутриклеточные симбионты → облигатные наследуемые эндоцитобионты → геном-содержащие органеллы → безгеномные органеллы. Эти преобразования сопровождаются утратой микроорганизмами генетической индивидуальности – способности к самостоятельному поддержанию и экспрессии геномов, вплоть до их полной элиминации. Сравнительный анализ различных групп симбиотических бактерий показал, что важным условием их трансформации в органеллы (первичного органеллогенеза) является высокая геномная пластичность, которая проявляется при факультативной и облигатной зависимости от хозяев. Для этих бактерий характерны направленные изменения геномной организации (переход от унитарного типа генома к многокомпонентному и редуцированному типам), а также способность симбиотически специализированных генов сохранять активность при переносе в неродственные организмы. Эти свойства характерны для α-протеобактерий и цианобактерий – предков митохондрий и пластид, но не выявлены у β- и γ-протеобактерий, Bacteroidetes и Firmicutes, для которых, несмотря на наличие многочисленных эндосимбиотических форм, преобразований в органеллы не зарегистрировано. Удобной моделью для изучения вторичного органеллогенеза, осуществляемого эукариотическими микроорганизмами, являются динофлагелляты Symbiodinium (Alveolata), которые: 1) содержат хлоропласты, возникшие из красных водорослей; 2) образуют с беспозвоночными животными внутриклеточные симбиозы, в которых выполняют функции пластид. Изучение органеллогенеза позволяет приступить к реконструкции ранних этапов становления жизни, включая анализ эволюционных соотношений метаболизма и наследственности, а также ДНК- и РНК-геномов.

DOI: 10.31857/S0016675821010112

 

 

БЕРЕМЕННОСТЬ КАК ФАКТОР АДАПТИВНОЙ ЭВОЛЮЦИИ ЧЕЛОВЕКА. РОЛЬ ЕСТЕСТВЕННОГО ОТБОРА В ВОЗНИКНОВЕНИИ ПРЕЭКЛАМПСИИ

В.Н. Сереброва*, Е.А. Трифонова, В.А. Степанов

Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, 634050 Россия; e-mail: vika.serebrova@medgenetics.ru

 

В обзоре рассмотрены данные о значимой роли беременности в адаптивной эволюции современного человека. В аспекте эволюционной медицины основное внимание уделяется тяжелой гипертензивной патологии беременности – преэклампсии (ПЭ). Обобщены имеющиеся на сегодняшний день эволюционные гипотезы о возникновении, причинах расовой и этнической вариабельности частоты развития данной патологии в популяциях человека. Приведены исследования, предполагающие вклад адаптивной эволюции в формирование наследственной предрасположенности к развитию ПЭ. Продемонстрированы собственные результаты, впервые выявившие значимую роль очищающего отбора в формировании генетической архитектуры ПЭ по системе регуляторных однонуклеотидных полиморфных вариантов новых генов-кандидатов данной патологии.

DOI: 10.31857/S0016675821010148

 

 

ИНГИБИТОР АМИЛАЗ SbAI ВИДОВ КАРТОФЕЛЯ: ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ СТРУКТУРЫ И ПРОФИЛЯ ЭКСПРЕССИИ

Е.А. Дьяченко1,*, А.В. Кулакова1, А.А. Мелешин2, А.В. Щенникова1, Е.З. Кочиева1

1 Институт биоинженерии, Федеральный исследовательский центр “Фундаментальные основы биотехнологии” Российской академии наук, Москва, 119071 Россия; e-mail: dyachenko-el@yandex.ru
2 Всероссийский научно-исследовательский институт картофельного хозяйства им. А.Г. Лорха, Московская область, Люберецкий район, п. Красково, 140051 Россия

 

Деградация крахмала в растениях опосредуется амилазами, активность которых посттрансляционно регулируется ингибиторами. Предполагается, что работа гена ингибитора амилаз SbAI связана с устойчивостью картофеля к холодовому стрессу. Изучение возможных корреляций вариабельности гена SbAI с холодостойкостью видов картофеля позволит повысить степень понимания регуляции метаболизма крахмала в процессе развития растения и его реакции на стресс. В настоящем исследовании идентифицированы полногеномные последовательности гомологов гена SbAI у 12 видов картофеля секции Petota. Выявлено 36 аллельных вариантов гена и 31 вариант белка. Сопоставление с данными по сортам Solanum tuberosum показало, что сортовой полиморфизм в 1.4–1.7 раза превышает межвидовой, однако видам соответствует большее число аллельных вариантов. Филогенетический анализ показал, что аллельные варианты SbAI видов S. demissum, S. acaule и S. stoloniferum разнесены по разным кладам. Профиль экспрессии гена SbAI определен в различных органах видов S. tuberosum (сорт Надежда), S. rybinii, S. chacoense и S. kurtzianum. В листе S. chacoense уровень экспрессии гена в 13, 50 и 250 раз выше, чем у S. tuberosum, S. kurtzianum и S. rybinii соответственно. Различный уровень экспрессии SbAI в листьях видов может быть следствием разного исходного содержания в листьях как синтезируемого крахмала, так и редуцирующих сахаров. В клубне S. tuberosum уровень выше в 5.2, 8.6 и 430 раз, чем у S. kurtzianum, S. chacoense и S. rybinii. В корне S. rybinii уровень SbAI в 2.4 раза выше, чем у S. chacoense, и в 42.3 раза выше, чем у S. kurtzianum и S. tuberosum. Показано отсутствие корреляции уровня экспрессии SbAI с холодостойкостью видов. Полученные данные профиля экспрессии позволяют предположить, что разные виды и сорта картофеля могут по-разному регулировать содержание крахмала в клубнях.

DOI: 10.31857/S0016675821010045

 

 

ИЗМЕНЧИВОСТЬ ХЛОРОПЛАСТНОЙ ДНК И ФИЛОГЕОГРАФИЯ ДУБА ЧЕРЕШЧАТОГО Quercus robur L. В ВОСТОЧНОЙ ЧАСТИ АРЕАЛА

С.А. Семерикова1,*, И.Ю. Исаков2, В.Л. Семериков1

1 Институт экологии растений и животных Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург, 620144 Россия; e-mail: s.a.semerikova@ipae.uran.ru
2 Воронежский государственный лесотехнический университет им. Г.Ф. Морозова, кафедра лесных культур, селекции и лесомелиорации, Воронеж, 394087 Россия

 

Изменчивость хлоропластной ДНК была исследована в 42 популяциях дуба черешчатого Q. robur L. в европейской части России, Беларуси, Польше, Украине, на Урале и на Кавказе. В качестве генетических маркеров были использованы рестриктный анализ и секвенирование, а также микросателлитные локусы хлоропластной ДНК (cpSSR). Для успешной амплификации и секвенирования были разработаны новые праймеры, специфичные для дуба. Впервые получены нуклеотидные последовательности трех фрагментов (psaA-trnS, psbC-trnD и trnT-trnF) для Q. robur, с определением филогенетических взаимоотношений 13 выявленных гаплотипов. В восточной части ареала присутствуют несколько дивергентных линий хлоропластной ДНК. Группы гаплотипов имеют неслучайное географическое распространение, вероятно отражающее историю заселения дубом данных районов. Обнаружена резкая дифференциация популяций по составу гаплотипов и уровню изменчивости: в восточной части Русской равнины и на Урале распространены два гаплотипа, исчезающих на западе – в Северо-Западной России, в Беларуси, Польше и на Западной Украине, где найдено девять гаплотипов, которые отсутствуют на востоке. Географическая структура изменчивости хлоропластной ДНК дуба черешчатого в Восточной Европе имеет сходные черты с таковой у липы мелколистной (Семерикова и др., 2020) – другого представителя европейских умеренных лесов, у которой, как и у дуба в этой части ареала, наблюдаются резкие различия между западными и восточными популяциями. По-видимому, это обусловлено послеледниковой колонизацией у обоих видов из разных, длительное время изолированных, источников, часть которых располагалась на востоке исследуемой территории. На Урале выявляется параллельная дифференциация дуба и липы между южной частью (бассейны рек Урала и Белой) и более северными районами (бассейн р. Уфы и Средний Урал), что может быть объяснено разными историями заселения этих областей широколиственной растительностью.

DOI: 10.31857/S0016675821010136

 

 

МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ХАРАКТЕРИСТИКИ ВИДОВ РОДА Jordanita Verity, 1946 (Lepidoptera: Zygaenidae, Procridinae): ДНК-ШТРИХКОДЫ И СООТВЕТСТВУЮЩИЕ ИМ АМИНОКИСЛОТНЫЕ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ

К.А. Ефетов1,*, З.С. Лазарева1, Е.В. Паршкова1, Г.М. Тарманн2

1 Крымский федеральный университет им. В.И. Вернадского, Симферополь, 295051 Россия; е-mail: efetov@ma.cfuv.ru
2 Тирольские государственные музеи Фердинанда, отдел естествознания, Халль, 6060 Австрия

 

Проанализированы качественный и количественный состав нуклеотидных последовательностей 5'-региона гена первой субъединицы митохондриальной цитохромоксидазы – COI (расшифрованных нами в рамках международного проекта по ДНК-штрихкодированию) и вариабельность соответствующих аминокислотных последовательностей у представителей рода Jordanita Verity, 1946. В участке СОI длиной 219 аминокислотных остатков количество вариабельных позиций составило 14.2%, что значительно превышает имеющиеся в литературе данные для Lepidoptera. Выявлена 31 точка вариабельности аминокислот, при этом две из них локализованы на близком расстоянии к активному центру фермента.

DOI: 10.31857/S001667582012005X

 

 

МНОЖЕСТВЕННЫЙ ХРОМОСОМНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ, ХРОМОСОМНОЙ РАСЫ “ЭВОРОН” ЭВОРОНСКОЙ ПОЛЕВКИ (Rodentia, Arvicolinae)

И.В. Картавцева*, И.Н. Шереметьева, М.В. Павленко

Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток, 690022 Россия; e-mail: Kartavtseva@biosoil.ru

 

На основании анализа собственных и литературных данных полевок берегов о. Эворон (n = 8) и р. Амгунь (n = 8), в Эворон-Чукчагирской низменности, а также особей лабораторного разведения, приведены новые данные о кариотипической изменчивости (2n = 38–41, NF = 54–59), хромосомных преобразованиях и их сочетаниях в кариотипе. Нумерация хромосом в кариотипе эворонской полевки с использованием методов дифференциального (GTG–) окрашивания позволила обозначить пары хромосом, вовлеченные в различные хромосомные перестройки, а для пар, образованных в результате слияния хромосом, дать номера парам их образовавшим. Тандемные слияния теломера-теломера (TTel) двуплечих хромосом образуют крупный субметацентрик Mev1/4М; слияние теломера-центромера (TCen) в результате инактивации центромеры одной из пар акроцентриков образуют либо акроцентрик (Mev17/18A), либо метацентрик (Mev17/18M), а робертсоновское слияние этих же пар – образует метацентрик средних размеров (Mev17/18M). Также показана изменчивость положения центромеры в двух парах аутосом (Mev8 и Mev14). Выявленные перестройки позволили описать двенадцать вариантов кариотипа: два с 2n = 41, шесть с 2n = 40, три с 2n = 39 и один с 2n = 38. Предложено отнести полевок Эворон-Чукчагирской низменности, имеющих слияние двуплечих хромосом Mev1 и Mev4, к хромосомной расе “эворон”, остальных – к расе “арги”. Получение плодовитого потомства от особей, имеющих в кариотипе слияние TTel и высокий процент этой перестройки у особей из природных выборок, свидетельствует об отсутствии ее вредного влияния на жизнеспособность полевок.

DOI: 10.31857/S0016675821010082

 

 

ЧАСТОТА МУТАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С РАЗВИТИЕМ НАСЛЕДСТВЕННОГО ГЕМОХРОМАТОЗА I ТИПА, БОЛЕЗНИ ВИЛЬСОНА–КОНОВАЛОВА И СЕМЕЙНОЙ СРЕДИЗЕМНОМОРСКОЙ ЛИХОРАДКИ, И ОСОБЕННОСТИ ИХ РАСПРЕДЕЛЕНИЯ В РУССКОЙ ПОПУЛЯЦИИ

Д.Д. Абрамов1, В.В. Кадочникова2, Е.Г. Якимова2, М.В. Белоусова1, А.В. Маерле1, И.В. Сергеев2, И.Б. Козлов2,*, А.Е. Донников3, И.А. Кофиади2,**, Д.Ю. Трофимов4

1 ООО “ДНК-Технология”, Москва, 117587 Россия
2 Государственный научный центр Институт иммунологии, Москва, 115522 Россия;e-mail: * kozlov.nrcii@gmail.com, ** kofiadi@mail.ru
3 Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова, Москва, 117997 Россия
4 Институт репродуктивной генетики Научного центра акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова, Москва, 117997 Россия

 

Данная статья является продолжением цикла работ, посвященных определению частоты носительства мутаций, ассоциированных с развитием распространенных моногенных заболеваний, среди представителей русской популяции. Установлены частоты распространения мутаций в генах HFE, ATP7B и MEFV у доноров первичной кроводачи, идентифицирующих себя как русские и постоянно проживающих на территории Российской Федерации. Для проведения SNP-генотипирования использован метод примыкающих проб. При генотипировании были обнаружены 57 носителей мутации C282Y гена HFE, наиболее значимой в развитии гемохроматоза I типа (частота в выборке 911 доноров 6.3%, или 1 : 16), и 18 носителей мутации H1069Q в гене ATP7B, связанной с развитием болезни Вильсона–Коновалова (частота в выборке 1032 доноров 1.7%, или 1 : 57). Также установлена высокая частота носительства (частота в выборке 1212 д оно р о в 7. 3% , и ли 1 : 14) м утации K6 95 R в гене MEFV, ассоциированной с развитием семейной средиземноморской лихорадки, характеризующейся легким фенотипом и неполной пенетрантностью.

DOI: 10.31857/S0016675821010021

 

 

РАЗРАБОТКА СИСТЕМЫ ПРАЙМЕРОВ ДЛЯ СЕКВЕНИРОВАНИЯ МИТОХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА СЕВЕРНОГО ОЛЕНЯ Rangifer tarandus

И.В. Артюшин1,2, Е.А. Коноров1,3,*, К.А. Курбаков1,3, Ю.А. Столповский1

1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: casqy@yandex.ru
2 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, 119234 Россия
3 Федеральный научный центр пищевых систем им. В.М. Горбатова Российской академии наук, Москва, 109316 Россия

 

Разработана система праймеров и оптимизированы условия ПЦР для амплификации митохондриального генома северного оленя Rangifer tarandus. Получены последовательности полного митохондриального генома домашнего и дикого оленя из Ненецкого автономного округа. Сравнение двух данных геномов с уже известными двумя митохондрионами домашних оленей из Китая и Японии выявило всего 160 полиморфных сайтов во всех этих выборках. Обнаружены уникальные аллели как для диких, так и домашних оленей Ненецкого автономного округа. Таким образом, разработанная методика позволяет получить новую информацию для филогеографии и изучения генетического разнообразия пород северного оленя, охватывая изменчивость по неизученным для северного оленя митохондриальным маркерам, таким как ND1–ND6 и ATP6, ATP8.

DOI: 10.31857/S0016675821010033

 

 

ТЕСТ-СИСТЕМА ДЛЯ in vitro СКРИНИНГА КАНДИДАТОВ В АНТИМИКОБАКТЕРИАЛЬНЫЕ ПРЕПАРАТЫ НА УСТОЙЧИВОСТЬ, ОПОСРЕДОВАННУЮ MMPS5-MMPL5-ТРАНСПОРТЕРАМИ

К.В. Шур1, С.Г. Фролова1,2, Н.И. Акимова1, В.Н. Даниленко1, Д.А. Маслов1,*

1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119333 Россия; e-mail: maslov_da@vigg.ru
2 Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), Московская обл., Долгопрудный, 141701 Россия

 

Возникновение лекарственной устойчивости к противотуберкулезным препаратам является глобальным вызовом и требует разработки новых лекарств, активных в отношении устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis. Одной из задач, возникающей при разработке, является определение механизмов возникновения или осуществления такой устойчивости к кандидату в лекарство. Система эффлюкса MmpS5-MmpL5 способна обеспечивать лекарственную устойчивость микобактерий к широкому спектру антибиотиков, в том числе к бедаквилину, клофазимину, тиацетазонам, азолам и имидазо[1,2-b][1,2,4,5]тетразинам. Нами сконструирован рекомбинантный штамм M. smegmatis Δmmp5, делеционный по генам mmpS5-mmpL5 оперона и являющийся гиперчувствительным к имидазо[1,2-b][1,2,4,5]тетразинам. Сравнение чувствительности пары штаммов M. smegmatis mc2 155 и M. smegmatis Δmmp5 к кандидатам в антимикобактериальные соединения может быть использовано в качестве тест-системы для установления возможного участия системы эффлюкса MmpS5-MmpL5 в формировании устойчивости на ранних стадиях скрининга.

DOI: 10.31857/S001667582101015X

 

 

РУССКИЕ ПОВОЛЖЬЯ. ИНТЕНСИВНОСТЬ МЕТИСАЦИИ В КОНЦЕ ХХ ВЕКА

Г.И. Ельчинова1,*, Р.А. Зинченко1,2,**

1 Медико-генетический научный центр им. академика Н.П. Бочкова, Москва, 115522 Россия; e-mail: * elchinova@med-gen.ru, ** renazinchenko@mail.ru
2 Национальный научно-исследовательский институт общественного здоровья им. Н.А. Семашко, Москва, 105064 Россия

 

Исследование выполнено на архивных данных лаборатории генетической эпидемиологии ФГБНУ “МГНЦ”. Из 65747 брачных записей по Удмуртии, Чувашии, Марий Эл, Башкирии, Татарстану, относящихся к концу ХХ в., отобраны 15804 пар, в которых хотя бы один из супругов русский. Из 1.2 млн населения обследованных районов русские составляют почти 270 тыс. человек. Интенсивность метисации русского населения составила 52.5%. Этническая брачная ассортативность – 2.3. Приводятся данные по всем пяти республикам.

DOI: 10.31857/S0016675821010057

 

 

РЕЗУЛЬТАТЫ ДЛИТЕЛЬНОГО МОНИТОРИНГА И ЭКСПЕРИМЕНТА ПО ОБОГАЩЕНИЮ ГЕНОФОНДА ПОПУЛЯЦИЙ КУСТАРНИКОВОЙ УЛИТКИ Bradybaena fruticum (Müll.) НА УРБАНИЗИРОВАННЫХ ТЕРРИТОРИЯХ

В.М. Макеева1,*, И.Д. Алазнели1, А.В. Смуров1, Д.В. Политов2, Ю.С. Белоконь2, М.М. Белоконь2

1 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, 119991 Россия; e-mail: vmmakeeva@yandex.ru
2 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия

 

Результаты длительного мониторинга динамики фенетических признаков в десяти популяциях кустарниковой улитки из Подмосковья и парков г. Москвы зафиксировали постоянство частоты аллеля полосатости раковин в крупных природных популяциях и изменение частот в мелких городских изолятах. Одновременно в череде поколений выявлена стойкая тенденция увеличения частоты желтых раковин, что объясняется происходящим осветлением местообитаний и служит подтверждением адаптивности признака цвета раковин. Представлены результаты длительного эксперимента по поддержанию жизнеспособности четырех городских популяций кустарниковой улитки Bradybaena fruticum (Müll.), начатого с обогащения их генофонда в 2003 г. и проведения контроля в 2005 г., выявившего изменение частоты аллеля полосатости раковины. Повторный контроль состояния генофонда оздоровленных популяций (2017–2019 гг.) выявил сохранение частоты этого признака с 2005 г. на протяжении двух поколений моллюсков, в том числе в двух популяциях при p < 0.01, одной p < 0.05. Таким образом, контроль результатов эксперимента по обогащению популяций подтверждает, что способ поддержания жизнеспособности популяций на урбанизированных территориях (защищенный патентом на изобретение) эффективен для восстановления генетического разнообразия и жизнеспособности популяций животных.

 

 

 

 

 

 

Статьи, опубликованные только в Russian J. of Genetics, № 1 – 2021 г.

Epigenetic Discrimination of Lebanese Monozygotic Twins as a Promising Forensic Approach

P. Romanos*, J. Borjac

Department of Biological Sciences, Beirut Arab University, Debbieh, Lebanon
Correspondence to P. Romanos

 

Standard forensic genetics is foremost prominent by its power of discrimination. Yet, classical DNA profiling is ineffective when having monozygotic twins (MZs) as suspects in criminal casework. Arising from a single fertilized egg, monozygotic twins share the same genotype. This critical dilemma imposes an urgent challenge in forensics. The aim of this study is to distinguish between Lebanese MZs using DNA methylation as a promising epigenetic alternative. Twenty-eight unrelated pairs of Lebanese male and female MZs were recruited in this study. Participants signed an informed consent and filled a well-designed questionnaire. DNA was extracted using the PureLink Genomic DNA Mini kit, genotyped using the Identifiler Plus kit, and separated on 3500 Genetic Analyzer to confirm the monozygosity status. Extracted DNA was treated with bisulfite using the Epitect Bisulfite kit followed by a real time-polymerase chain reaction (RT-PCR) using the Epitect HRM PCR kit targeting 19 CpG residues distributed over Alu-Sp & Alu-E2F3 elements. High-Resolution Melting Curve (HRMC) analysis was performed at the endpoint of the amplification using the Rotor-Gene Q instrument. Discrimination between MZs is based on the expected different methylation patterns of Alu-Sp & Alu-E2F3 CpGs. Our results show significant differences among males (78.56%) and females (78.56%) MZs along the Alu-Sp element. The differences were 100% among males and 85.7% among female MZs targeting Alu-E2F3. Both Alu-Sp & Alu-E2F3 methylation patterns detected by HRMC were shown to be helpful with Alu-E2F3 being more discriminative. In conclusion, epigenetic discrimination of Lebanese MZs tends to offer a new powerful forensic perspective.

DOI: 10.1134/S1022795421010129

 

 

The Regulation Mechanism of AMPK/FOXO3 Signal Pathway in the Apoptosis and Differentiation of Duck Myoblasts

W. Gan1,2, N.N. Zhang2, L. Li2,*

1 Dazhou Academy of Agricultural Sciences, Da’ zhou, Sichuan, 635000 China
2 Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University, Chengdu, Sichuan, 611130 China
Correspondence to L. Li

 

The aim of this study was to investigate the effect of AMPK/FOXO3 signal pathway on duck myoblasts apoptosis and differentiation the possible mechanisms. Dorsomorphin 2HCl (DOR) and AICAR were used to inhibited and activated AMPK expression, respectively. And then, the myoblasts apoptosis and differentiation were established by dexamethasone (DEX) and 2% pregnant mare serum gonadotropin (PMSG) induction. In the present work, DEX succeed promoting the apoptosis of duck myoblasts and the expression of marker genes Caspase 3, LC3 and Caspase 7. Further, the mRNA expression of AMPKα1 and FOXO3 and the protein expression of p-AMPK and FOXO3 significantly increased in the 1000 ng/mL and 10000 ng/mL group but AMPKα2 only in 10000 ng/mL group. However, the positive effects of DEX on apoptosis of duck myoblasts could be inhibited by DOR. We found that the activator of AMPK/FOXO3 pathway could increase the expression of Caspase3, LC3 and Fas and promoted the G0/G1 phase arrest. On the other hand, the AMPK/FOXO3 signal pathway could also be activated by 2% PMSG. Similarity, the expression increased of MyHC was induced by 2% PMSG could also be inhibited by DOR. Corresponding, the activation of AMPK/FOXO3 signal pathway significantly increased the expression of MyHC. Therefore, our results indicated that the activation of AMPK/FOXO3 signal pathway could promote the duck myoblasts apoptosis and differentiation.

DOI: 10.1134/S1022795421010075