ГЕТЕРОЛОГИЧНАЯ ЭКСПРЕССИЯ КАПСИДНОГО БЕЛКА VP3 ДЕНСОВИРУСА РЫЖЕГО ТАРАКАНА В КЛЕТКАХ ДРОЖЖЕЙ Saccharomyces cerevisiae: АНАЛИЗ ВНУТРИКЛЕТОЧНОЙ ЛОКАЛИЗАЦИИ

Е.У. Мартынова¹, М.И. Зотова¹, М.В. Тростников^1,2, Д. В. Муха^1,*

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: dmitryVmukha@gmail.com
² Институт молекулярной генетики Российской академии наук, Москва, 123182 Россия

 

Исследованы закономерности экспрессии капсидного белка VP3 денсовируса рыжего таракана Blattella germanica в клетках дрожжей Saccharomyces cerevisiae. Показано, что экспрессируемый капсидный белок, слитый с желтым флуоресцентным белком (YFP), формирует внутриклеточные скопления (агрегаты). Описано влияние сигнала ядерной локализации белка VP3 на характер распределения агрегатов внутри клетки. Предполагается, что дрожжи, экспрессирующие капсидный белок VP3, могут являться удобной экспериментальной моделью для изучения молекулярных механизмов внутриклеточного транспорта белков в процессе формирования белковых агрегатов и, возможно, формирования вирусных капсидов.

DOI: 10.1134/S0016675818130131

 

 

СБЛИЖЕНИЕ ПРИОННЫХ ДОМЕНОВ СПОСОБСТВУЕТ ИНИЦИАЦИИ ПРИОНИЗАЦИИ БЕЛКА

Ю.В. Сопова^1,2,*, С.П. Задорский^1,2, М.Е. Велижанина², А.В. Чиринскайте², А.П. Галкин^1,2, С.Г. Инге-Вечтомов^1,2

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Санкт-Петербургский филиал, Санкт-Петербург, 199034 Россия; е-mail: sopova@hotmail.com
² Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра генетики и биотехнологии, Санкт-Петербург, 199034 Россия

 

Прионы – инфекционные белковые агрегаты, вызывающие неизлечимые социально значимые заболевания человека и млекопитающих и наследуемые изменения признаков у микроорганизмов. Известно, что наличие прионной формы одного белка может способствовать прионизации другого белка. Вместе с тем конкретные механизмы взаимодействия прионных белков охарактеризованы недостаточно. В данной работе в дрожжевой модельной системе мы показали, что сближение прионизующих доменов способствует инициации прионизации белка.

DOI: 10.1134/S0016675818130180

 

 

ТЕСТ-СИСТЕМА Escherichia coli/aphVIII/gsk3β ДЛЯ СЕЛЕКТИВНОГО СКРИНИНГА ИНГИБИТОРОВ СЕРИН-ТРЕОНИНОВОЙ ПРОТЕИНКИНАЗЫ GSK3β

М.Г. Алексеева*, Д.А. Мавлетова, В.Н. Даниленко

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: Alekseevamg@mail.ru

 

Бактериальная тест-система E. coli/aphVIII/gsk3β, сконструированная авторами, включает гены каталитического домена протеинкиназы GSK3β и субстрата для фосфорилирования – аминогликозидфосфотрансферазы AphVIII, клонированные в одном экспрессионном векторе. Для оптимизации конструкции тест-системы в соответствии с каноническим сайтом фосфорилирования протеинкиназы GSK3β получены две модификации окружения потенциального сайта фосфорилирования: Ser-146 AphVIII. Установлено, что в совместной конструкции E. coli/aphVIII-1/gsk3β происходит посттрансляционная модификация AphVIII-1, связанная с фосфорилированием белка AphVIII протеинкиназой GSK3β. Тест-система валидирована с использованием селективных ингибиторов протеинкиназы GSK3β и может быть использована для первичного отбора низкомолекулярных ингибиторов протеинкиназы GSK3β.

DOI: 10.1134/S0016675818130039

 

 

ИДЕНТИФИКАЦИЯ МУТАЦИИ kar1-1, ПРИВОДЯЩЕЙ К ПОВЫШЕНИЮ ЧАСТОТЫ ЦИТОДУКЦИИ И СНИЖЕНИЮ ЧАСТОТЫ ГИБРИДИЗАЦИИ У ДРОЖЖЕЙ Saccharomyces cerevisiae

А.С. Жук^1,2, С.П. Задорский^1,2, А.А. Ширяева^2,3,4, О.В. Коченова⁵, С.Г. Инге-Вечтомов^1,2, Е.И. Степченкова^1,2,*

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Санкт-Петербургский филиал, Санкт-Петербург, 199034 Россия; e-mail: stepchenkova@gmail.com
² Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра генетики и биотехнологии, Санкт-Петербург, 199034 Россия
³ Центр науки о жизни, Сколковский институт науки и технологий, Москва, 121205 Россия
⁴ Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Научно-исследовательский комплекс “Нанобиотехнологии”, Санкт-Петербург, 195251 Россия
⁵ Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA

 

Показано, что мутация kar1-1, широко используемая в генетических исследованиях для повышения эффективности цитодукции у дрожжей Saccharomyces cerevisiae, представляет собой транзицию 448 С → Т, приводящую к замене пролина на серин в 150-м положении белка Kar1. Получена интегративная плазмида pFL34-kar1-1, позволяющая вносить мутацию kar1-1 в дрожжевой геном методом двушагового замещения. Показано, что мутация kar1-1 снижает эффективность “законной” и “незаконной” гибридизации и повышает эффективность “законной” и “незаконной” цитодукции. Выявлен новый класс полиплоидных цитодуктантов, возникающих с частотой 8% в системе “незаконной” цитодукции, включающей штаммы с мутацией kar1-1.

DOI: 10.1134/S0016675818130246

 

 

ДОЗОВАЯ ЗАВИСИМОСТЬ ГИПЕРМЕТИЛИРОВАНИЯ ПРОМОТОРОВ ГЕНОВ В ЛЕЙКОЦИТАХ КРОВИ ЛИЦ, ПОДВЕРГШИХСЯ СОЧЕТАННОМУ ВОЗДЕЙСТВИЮ ГАММА- И АЛЬФА-ИЗЛУЧЕНИЙ

Н.С. Кузьмина^1,*, Н.Ш. Лаптева¹, Г.Г. Русинова², Т.В. Азизова², Н.С. Вязовская², А.В. Рубанович¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: nin-kuzmin@yandex.ru
² Южно-Уральский институт биофизики Федерального медико-биологического агентства России, Озерск, Челябинская область, 456780 Россия

 

С помощью метода метилчувствительной ПЦР проведено изучение гиперметилирования CpG-островков промоторов генов клеточного цикла (RASSF1A, p16/INK4A, p14/ARF, р53, АТМ), детоксикации ксенобиотиков (GSTP1), антиоксидантной защиты (SOD3), эстрогенового рецептора (ESR1) в лейкоцитах крови сотрудников радиохимического производства ПО “Маяк” (61 чел., от 52 до 84 лет), подвергшихся пролонгированному сочетанному внешнему воздействию γ-радиации (от 142 до 1741 мГр на ККМ) и внутреннему облучению от инкорпорированного плутония ²³⁹Pu (α-частицы, от 0.6 до 68 мГр на ККМ), и у 50 лиц одновозрастной контрольной группы. Промежуток времени между окончанием работы в условиях радиационного воздействия и взятием крови составлял в среднем 15.4 ± 1.87 лет. В группе работников ПО “Маяк” доля лиц с гиперметилированием СpG-островков промоторов генов p16/INK4A, GSTP1, p53 и SOD3 статистически значимо превышала аналогичные показатели в контрольной группе (p = 0.03, OR = 3.84; p = 0 . 0 01, OR = 7.12 ; р = 0.03, OR = 3.84 и р = 0.003, OR = 3.62 соответственно). Выявлена статистически значимая сопряженность накопленной дозы облучения и числа метилированных промоторов (r = 0.415 , р = 5.9 × 10^–6 и r = 0.362, р = 9.4 × 10^–5 для воздействия γ- и α-излучений соответственно). Таким образом, показано дозозависимое гиперметилирование CpG-островков промоторов ряда генов, которое выявляется в лейкоцитах крови в отдаленный период после перенесенного сочетанного внешнего (γ-лучи)/внутреннего (α-частицы) облучения.

DOI: 10.1134/S0016675818130118

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ПАСПОРТИЗАЦИЯ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ В РОССИИ СОРТОВ ЯРОВОГО ЯЧМЕНЯ ПО АЛЛЕЛЯМ ГОРДЕИН-КОДИРУЮЩИХ ЛОКУСОВ

Е.В. Лялина*, С.В. Болдырев, А.А. Поморцев**

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: * lialina7@yandex.ru , ** pomortsev@vigg.ru

 

С помощью метода электрофореза в крахмальном геле впервые изучен аллельный состав гордеин-кодирующих локусов Hrd A, Hrd В и Hrd F и установлены генетические формулы у 50 новых сортов ярового ячменя. Идентифицировано четыре новых аллеля – один для локуса Hrd A и три – для локуса Hrd В. Для локуса Hrd F новых аллелей не найдено. В целом у культивируемых на территории Российской Федерации сортов ярового ячменя по локусам Hrd A, Hrd В и Hrd F идентифицировано 22, 34 и 4 аллелея соответственно. В то же время, несмотря на увеличение числа аллелей гордеин-кодирующих локусов, наблюдали увеличение числа групп сортов с идентичными спектрами, а также числа сортов с идентичными спектрами в пределах некоторых выделенных групп, что, с одной стороны, говорит о необходимости привлечения дополнительных маркеров, с другой стороны, свидетельствует о тенденции снижения генетического разнообразия культуры.

DOI: 10.1134/S001667581813012X

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ СОРТОВ ЯРОВОЙ МЯГКОЙ ПШЕНИЦЫ ЕВРОПЕЙСКОЙ ЧАСТИ РОССИИ ПО ГЕНАМ VRN И PPD, ОПРЕДЕЛЯЮЩИМ СРОКИ КОЛОШЕНИЯ

А.А. Янковская^1,*, А.В. Фисенко², А.Ю. Драгович¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: ceroplastes@yandex.ru
² Главный ботанический сад им. Н.В. Цицина Российской академии наук, Москва, 127276 Россия

 

Определен аллельный состав генов VRN-1 и PPD-1, контролирующих сроки колошения, у 47 сортов яровой мягкой пшеницы, возделываемых на территории европейской части России. Аллель Ppd-D1b, определяющий фоточувствительность растений, несут 95.7% сортов, аллель Vrn-A1a, отвечающий за полную нечувствительность растений к пониженным температурам, – 91.5% сортов, ген VRN-В1 (аллели Vrn-В1c и Vrn-В1a) – 85.1% сортов. Все изученные сорта (кроме одного) обладали рецессивным геном vrn-D1. Проанализировано распределение частот аллелей по природно-сельскохозяйственным зонам, выявившее, что для возделывания яровой мягкой пшеницы на европейской части России предпочтительны фоточувствительные сорта, имеющие аллель Ppd-D1b в сочетании с доминантными аллелями Vrn-A1a и Vrn-В1c/Vrn-В1a.

DOI: 10.1134/S0016675818130209

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ОТЕЧЕСТВЕННЫХ И ЗАРУБЕЖНЫХ ГИБРИДОВ САХАРНОЙ СВЕКЛЫ (Beta vulgaris L.) ПО ДАННЫМ AFLP-АНАЛИЗА

Е.В. Коваль, А.А. Трифонова, Л.В. Дедова, К.В. Борис*, А.М. Кудрявцев

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: docboris@mail.ru

 

Методом AFLP-анализа проведено изучение 43 современных отечественных и зарубежных гибридов сахарной свеклы, допущенных к использованию на территории РФ. Был получен 201 полиморфный фрагмент, а уровень полиморфизма изученной выборки составил 91% (75.8% для отечественных и 87.6% для зарубежных гибридов), при этом каждый образец характеризовался уникальным набором AFLP-фрагментов. Анализ полученных результатов методом главных координат позволил выявить четкое разделение между отечественными и зарубежными гибридами сахарной свеклы, что свидетельствует о различиях генетического материала, используемого при их создании. При этом для зарубежных гибридов восьми различных производителей не было выявлено четкого разделения на группы.

DOI: 10.1134/S001667581813009X

 

 

СОЗДАНИЕ ВЕКТОРНЫХ КОНСТРУКЦИЙ И ТРАНСГЕННЫХ РАСТЕНИЙ ТАБАКА С ГЕНАМИ АМП

Т.В. Коростылева^1,*, Е.А. Истомина¹, А.А. Конопкин^1,2, Н.В. Хадеева¹, Е.Ю. Яковлева¹, Т.И. Одинцова¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; е-mail: tatkor@vigg.ru
² Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии – МБА им. К.И. Скрябина, Москва, 109472 Россия

 

Исследование посвящено созданию векторных конструкций с генами антимикробных пептидов двух разных структурных классов – дефензина Sm-AMP-D1 из растения мокрицы Stellaria media и 10-цистеинового гевеиноподобного пептида WAMP-1 из пшеницы Triticum kiharae, и получению на их основе модельных трансгенных растений Nicotiana tabacum L. Была получена векторная конструкция с геном sm-amp-D1 и варианты векторных конструкций с геном wamp-1, отличающиеся наличием сигнального и С-концевого продомена в пептиде WAMP-1. Методом полуколичественной ОТ-ПЦР подтверждена экспрессия генов АМП в трансгенных растениях табака. Полученные модельные растения могут использоваться для изучения влияния экспрессии генов АМП на устойчивость растений к фитопатогенам и исследования роли С-концевого продомена этих пептидов в реализации такой устойчивости.

DOI: 10.1134/S0016675818130088

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИВЕРГЕНЦИЯ КУМЖИ Salmo trutta КАСПИЙСКОГО И БЕЛОГО МОРЕЙ ПО МИКРОСАТЕЛЛИТНЫМ ЛОКУСАМ

Л.А. Животовский^1,*, Г.А. Рубцова¹, З.Ш. Абдуразакова², А.В. Семенова³, Т.А. Ракицкая¹, К.И. Афанасьев¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: levazh@gmail.com
² Дагестанский государственный университет, кафедра информатики и информационных технологий, Махачкала, 367025 Россия
³ Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, кафедра ихтиологии, Москва, 119234 Россия

 

Апробирован набор из 13 микросателлитных маркеров для изучения генетической дифференциации кумжи Salmo trutta. Исследованы выборки этого вида из Каспийского и Белого морей. Анализ генетических различий показал, что популяции кумжи этих морских бассейнов сильно дивергировали друг от друга – на уровне большем, чем подвидовые различия.

DOI: 10.1134/S0016675818130234

 

 

О СИСТЕМАТИЧЕСКОМ ПОЛОЖЕНИИ АЛТАЙСКОГО СОКОЛА

А.В. Нечаева^1,*, М.М. Белоконь¹, Ю.С. Белоконь¹, Е.И. Сарычев², И.Р. Бёме³

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: nechaeva-a@mail.ru
² Питомник редких видов птиц Витасфера, д. Слободино, Раменский р-н, Московская обл., 140170 Россия
³ Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, 119991 Россия

 

Систематическое положение алтайского сокола всегда вызывало множество вопросов, и в разное время его выделяли как отдельный вид и как подвиды то кречета (Falco cherrug), то балобана (F. rusticolus). Сравнение генетического разнообразия по восьми полиморфным ядерным микросателлитным локусам и девяти морфометрическим параметрам балобана, кречета и алтайского сокола не выявило дифференцировки последнего. По морфометрическим параметрам алтайский сокол не отличается от балобана, генетические маркеры не дают разделения между тремя группами. По результатам исследования алтайский сокол представляется фенотипом балобана.

DOI: 10.1134/S0016675818130155

 

 

СООТНОШЕНИЕ ПОЛОВ У ПТЕНЦОВ КРАСАВОК (Anthropoides virgo Linneaus, 1758) ПРИКАСПИЙСКОЙ ГНЕЗДОВОЙ ГРУППИРОВКИ

Е.А. Мудрик^1,*, Е.И. Ильяшенко², Г.С. Джамирзоев^3,4, М.В. Корепов⁵, Д.В. Политов¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: mudrik@vigg.ru
² Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук, Москва, 119011 Россия
³ Институт экологии горных территорий им. А.К. Темботова Российской академии наук, Нальчик, 360051 Россия
⁴ Государственный природный заповедник “Дагестанский”, Махачкала, 367010 Россия
⁵ Ульяновский государственный педагогический университет им. И.H. Ульянова, Ульяновск, 432000 Россия

 

С использованием молекулярно-генетического маркера пола EE0.6 впервые проведен анализ соотношения полов у птенцов журавля красавки (Anthropoides virgo Linneaus, 1758) в природе. В выборке из 61 птенца в потомстве прикаспийской гнездовой группировки красавки в 2017 г. были определены 34 самки и 27 самцов. В семьях с двумя птенцами в выводке самки (25 особей) преобладали над самцами (15 особей), что отражает вторичное соотношение полов в популяции. В парах красавок с одним птенцом, где прошел отбор, в потомстве выявлено больше самцов (12), чем самок (9). Тенденция к преобладанию самок в выводках журавлей с двумя птенцами может указывать на стрессовое состояние ранее многочисленной прикаспийской гнездовой группировки красавки, в настоящее время сокращающейся в результате неблагоприятных антропогенных и климатических воздействий и, вероятно, компенсирующей эти последствия за счет увеличения доли рождаемости самок.

DOI: 10.1134/S0016675818130143

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ АРКТИЧЕСКОЙ КОЛЬЧАТОЙ НЕРПЫ (Pusa hispida hispida) РОССИЙСКИХ МОРЕЙ СЕВЕРНОГО ЛЕДОВИТОГО ОКЕАНА

М.В. Шитова^1,*, А.Н. Болтунов², М.В. Гаврило^3,4, В.Н. Светочев², В.С. Семенова⁵, Т.В. Малинина¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва, 119991 Россия; e-mail: shitova-m@rambler.ru
² Научно-экспедиционный центр по исследованию морских млекопитающих, Москва, 117997 Россия
³ Ассоциация “Морское наследие: исследуем и сохраним”, Санкт-Петербург, 199106 Россия
⁴ Национальный парк “Русская Арктика”, Архангельск, 163000 Россия
⁵ Мурманский морской биологический институт Карельского научного центра Российской академии наук, Мурманск, 183010 Россия

 

Проанализировано 25 образцов арктической кольчатой нерпы по 10 микросателлитным локусам и одному фрагменту мтДНК (D-петля). Для построения гаплотипической сети были привлечены последовательности из базы данных NCBI по балтийскому, ладожскому и сайменскому подвидам кольчатой нерпы, а также дополнительные образцы с архипелага Шпицберген, Аляски и Белого моря. Беломорская нерпа формирует отдельную группу гаплотипов на общей гаплотипической сети. Было выявл�