Аннотации статей. Том 54, 2018 г., № 7
ГЕНОМНЫЕ ОСТРОВА ШТАММА Sinorhizobium meliloti Rm1021 – АЗОТФИКСИРУЮЩЕГО СИМБИОНТА ЛЮЦЕРНЫ
Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург, Пушкин 196608; e-mail: mroumiantseva@yandex.ru
Проведен анализ in silico открытых рамок считывания геномных островов штамма Sinorhizobium meliloti Rm1021, типичного представителя почвенных бактерий, формирующих азотфиксирующий симбиоз с бобовыми растениями-хозяевами из группы перекрестной инокуляции люцерны. Показано, что геномные острова имеют мозаичную структуру, в которой чередуются блоки функционально-значащих генов, IS-элементов и генов некодирующих РНК. Также в них имеются элементы систем T4SS и T4CP и отсутствуют системы конъюгативной мобилизации. Сделано заключение, что два из трех островов могут являться вариантами редуцированных интегративных конъюгативных элементов, а третий – редуцированным интегрированным конъюгативным транспозоном. Сайтспецифический характер встраивания островов происходит по последовательности длиной 15-31 пн (в зависимости от острова), локализованной на 3'-конце гена тРНК, которая при этом смещается вправо, а оставшаяся часть гена тРНК достраивается аналогичной последовательностью, которая имеется в составе острова. Выдвинуто предположение о существовании видоспецифичных “горячих” точек инсерции для геномных островов клубеньковых бактерий.
DOI: 10.1134/S0016675818070135
СУПРЕССОРНЫЕ И ГИПЕРМЕТИЛИРУЕМЫЕ микроРНК В ПАТОГЕНЕЗЕ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ
1 Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии, Москва 125315
2 Медико-генетический научный центр, Москва 115478
3 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва 119991
4 Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук, Москва 119334; e-mail: * burdennyy@gmail.com, ** eleonora10_45@mail.ru
МикроРНК (миРНК) участвуют в онкогенезе посредством подавления протоонкогенов либо генов-супрессоров опухолевого роста. В настоящем обзоре представлены данные о роли супрессорных миРНК в механизмах возникновения и развития злокачественных опухолей на примере рака молочной железы (РМЖ) – самой распространенной онкопатологии у женщин. Рассмотрены мишени и функции супрессорных и антиметастатических миРНК, а также супрессорных миРНК с онкогенным потенциалом (как miR-200a, miR-200c), возникающим, по-видимому, благодаря способности миРНК взаимодействовать с разнообразными мишенями в зависимости от клеточного контекста. На основании как литературных, так и собственных данных авторов обзора охарактеризована роль гиперметилирования промоторных областей в подавлении экспрессии и регуляторной функции генов миРНК при РМЖ. В заключение авторы коснулись перспектив клинического применения супрессорных миРНК в диагностике и лечении РМЖ.
DOI: 10.1134/S0016675818070081
ГЕНЕТИКА ДИСПЛАЗИЙ СОЕДИНИТЕЛЬНОЙ ТКАНИ
1 Научно-исследовательский институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Д.О. Отта Российской академии наук, Санкт-Петербург 199034; e-mail: baranov@vb2475.spb.edu
2 Военно-медицинская академия им. С.М. Кирова, Санкт-Петербург 194044
3 Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра генетики и биотехнологии, Санкт-Петербург 199034
Обзор собственных и литературных данных по проблемам генетики и эпигенетики наследственных нарушений соединительной ткани (ННСТ) – наиболее частой и сложной для дифференциальной диагностики и лечения патологии. В зависимости от типа наследования и клинических проявлений многочисленные формы ННСТ разделяют на моногенные и мультифакторные дисплазии соединительной ткани (ДСТ). Рассмотрены современное состояние, достижения и сложности молекулярно-генетической диагностики ННСТ, связанные с внедрением полногеномного секвенирования (NGS). Приведены панели генов, ассоциированных с ДСТ, которые уже используются для экзомного (клинического) секвенирования причинных генов ННСТ, а также результаты молекулярно-генетических исследований по поиску генов-кандидатов, ассоциированных с хроническими мультифакторными заболеваниями (МФЗ) и развивающихся на фоне ДСТ. Суммированы сведения по эпигенетике ДСТ и некоторым уже разработанным и перспективным биологическим моделям для их изучения. Обсуждаются преимущества и ограничения NGS-технологии, связанные с необходимостью оценки риска новых мутаций и вариаций первичной структуры ДНК в исследовании ДСТ.
DOI: 10.1134/S0016675818070020
ЛОКАЛИЗАЦИЯ ХРОМОСОМНЫХ РЕГИОНОВ, ОПРЕДЕЛЯЮЩИХ ЭФФЕКТИВНОСТЬ ФОТОСИНТЕЗА У РОССИЙСКИХ СОРТОВ РИСА
Всероссийский научно-исследовательский институт риса, Краснодар 350921; е-mail: serggontchar@mail.ru
Селекционная практика показала, что основными путями повышения урожайности культур являются изменение морфотипа, использование гетерозиса и повышение эффективности фотосинтеза. Нами проведено выделение доноров и источников эффективной работы генетических систем, определяющих фотосинтетический потенциал; выявление полиморфных локусов, определяющих эффективность фотосинтеза у отечественных сортов риса. В качестве материала использовали 32 отечественных сорта риса. Определено общее и относительное содержание пигментов, удельная поверхностная плотность листа. Содержание хлорофилла a и b, каротиноидов измеряли в фазах начало кущения, выметывания и стадии цветения спектрофотометром Genesys 8, относительное содержание пигментов – N-тестером. Для измерения использовали 20 растений каждого сорта в двухкратной повторности, при молекулярном маркировании использовали SSR-маркеры. ДНК экстрагировали STAB-методом. Полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и визуализацию продуктов амплификации проводили по методикам Международного исследовательского института риса (IRRI). Были выделены источники высокого содержания каждого пигмента. Высокий уровень полиморфизма локусов, связанных с эффективностью фотосинтеза у российских сортов риса, позволяет создать новые сорта с улучшенными характеристиками путем гибридизации. Шесть маркеров достоверно разделяли группы сортов с различной эффективностью фотосинтеза, три из них (RM154, RM600, RM5508) были связаны с содержанием каротиноидов, два (RM347, RM240) – с контролем удельной поверхностной плотности листа и два других (RM154, RM509) – с содержанием хлорофилла a.
DOI: 10.1134/S0016675818070032
СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ ПОПУЛЯЦИЙ ЭНДЕМИЧНЫХ ВИДОВ Oxytropis БАЙКАЛЬСКОЙ СИБИРИ И ИХ ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ СВЯЗИ ПО ДАННЫМ СЕКВЕНИРОВАНИЯ МАРКЕРОВ ХЛОРОПЛАСТНОЙ ДНК
1 Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток 690022; e-mail: kholina@biosoil.ru
2 Институт общей и экспериментальной биологии Сибирского отделения Российской академии наук, Улан-Удэ 670047
Впервые изучены генетическое разнообразие и популяционная структура эндемичных видов Байкальской Сибири Oxytropis triphylla, O. bargusinensis и O. interposita по данным анализа нуклеотидного полиморфизма межгенных спейсеров psbA–trnH, trnL–trnF и trnS–trnG хлоропластной ДНК. Все популяции видов характеризовались высоким гаплотипическим (0.762–0.924) и относительно низким нуклеотидным (0.0011–0.0022) разнообразием. Анализ распределения изменчивости у O. triphylla и O. bargusinensis показал, что достоверная генетическая дифференциация между популяциями каждого вида отсутствует, генный поток составил 4.43 и 8.91 соответственно. Высокий уровень генетического разнообразия в изученных популяциях указывает на относительно стабильное их состояние. Исследование филогенетических отношений близкородственных видов подтверждает представление о происхождении O. bargusinensis и O. tompudae в результате межсекционной гибридизации видов секций Orobia и Verticillares.
DOI: 10.1134/S0016675818070056
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ И ГЕНОТИПИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ Nelumbo komarovii Grossh.
Федеральный научный центр биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток 690022; e-mail: markelova@biosoil.ru
С использованием метода аллозимного анализа исследовали генетическую и генотипическую изменчивость редкого реликтового водного растения Nelumbo komarovii Grossh. в шести популяциях Приморского края России. Для популяций Раздольное и Океанская выявлены наибольшие показатели генетической и генотипической изменчивости, что определяется участием перекрестного опыления в формировании семян при поддержании численности популяции (Раздольное) и подсеиванием семян из разных мест обитания (Океанская). На популяционном уровне низкие показатели полиморфизма (P = 8.97, HО = 0.055, HЕ = 0.039) определены историей существования вида с третичного периода, а также влиянием дрейфа генов. В большинстве популяций клональное возобновление играет решающую роль в размножении особей N. komarovii.
DOI: 10.1134/S0016675818070111
О ГЕНОФОНДЕ КОСУЛЬ (Capreolus) ВОСТОЧНОЙ ЕВРОПЫ: АНАЛИЗ ВАРИАБЕЛЬНОСТИ НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ГЕНА cytb
1 Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук, Москва 119071; e-mail: nadezda.kashinina@yandex.ru
2 Московское областное общество охотников и рыболовов, Москва 119311
Проведен анализ нуклеотидных последовательностей гена цитохрома b мтДНК (974 пн) 139 образцов косуль из разных районов европейской части России и Украины. Исследования показали, что в настоящее время здесь обитает и европейская, и сибирская косуля, причем преобладает последняя: около 60% особей несут разнообразные “сибирские” гаплотипы, большая часть которых сходна с таковыми в популяциях Capreolus pygargus Урала, Сибири и Дальнего Востока. Большое разнообразие гаплотипов мтДНК сибирской косули в Восточной Европе, несомненно, вызвано разнородностью особей-основателей (переселенцев), которых завозили из разных районов Азии. Обсуждены некоторые проблемы совместного обитания близкородственных видов.
DOI: 10.1134/S0016675818070044
ВЫСОКИЙ УРОВЕНЬ МЕЖВИДОВОЙ ДИВЕРГЕНЦИИ УГЛОЗУБОВ РОДА Salamandrella ПО ДАННЫМ ОБ ИЗМЕНЧИВОСТИ ГЕНА RAG2
Институт биологических проблем Севера Дальневосточного отделения Российской академии наук, Магадан 685000; e-mail: malyarchuk@ibpn.ru
В проведенных ранее исследованиях изменчивости нуклеотидных последовательностей трех генов ядерного генома (BDNF, POMC и RAG1) был обнаружен очень низкий уровень межвидовой дивергенции углозубов рода Salamandrella – сибирского углозуба (S. keyserlingii) и углозуба Шренка (S. schrenckii). Фиксированные межвидовые различия были выявлены только в одной нуклеотидной позиции гена RAG1 и соответственно уровень межвидовой дивергенции по этому гену составил всего 0.07%. В настоящей работе нами представлены результаты исследования изменчивости ядерных генов ENC1, MGAT4C и RAG2. Уровень межвидовой дивергенции для гена MGAT4C составил 0.14%, а для гена RAG2 – 0.8%. Результаты филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей гена RAG2 у представителей семейства Hynobiidae свидетельствуют о выделении базальной по отношению к родам Batrachuperus, Liua, Hynobius и Pseudohynobius ветви Salamandrella примерно 55 млн лет назад. Время дивергенции между видами рода Salamandrella составляет примерно 21 млн лет.
DOI: 10.1134/S0016675818070093
ДИНАМИКА ВИДОВОГО СОСТАВА МАЛЯРИЙНЫХ КОМАРОВ В СИБИРСКИХ ПОПУЛЯЦИЯХ, ВЫЯВЛЯЕМАЯ С ПОМОЩЬЮ РЕСТРИКЦИОННОГО АНАЛИЗА
Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск 630090; e-mail: Oleg.v.vaulin@mail.ru
Изучены особенности динамики пропорций видов малярийных комаров в природных популяциях. В окрестностях г. Новосибирска (Россия) была взята 21 выборка из пяти личиночных местообитаний малярийных комаров комплекса maculipennis. Выявлено, что доминирующими видами в собранных выборках являются Anopheles messeae и An. daciae. Также были обнаружены три особи An. beklemishevi. Изучены динамика пропорций видов в пределах сезонов размножения в течение ряда лет, а также различия между локальностями по видовому составу. Выявлено, что доля An. daciae максимальна в июле и падает в августе. Пропорции видов могут резко меняться от года к году. Например, в локальностях на левом берегу Новосибирского водохранилища вид An. messeae преобладал в течение 2013 и 2014 гг. с частотой 54–68%, а в 2016 г. на этой территории стал преобладать An. daciaeс частотой 73–85%. Полученные нами данные по пропорциям видов в разных водоемах были сравнены с данными других авторов для сборов малярийных комаров комплекса Anopheles maculipennisв России (Томская область) и Германии. Показано высокое соответствие приведенных этими авторами моделей для изученной нами территории. Таким образом, экологические особенности видов An. messeaeи An. daciae оказываются в высокой степени стабильными даже в географически и климатически далеких локальностях. Увеличение доли относительно антропофильного An. daciae в середине лета может служить фактором риска в отношении переноса малярии в этот период времени.
DOI: 10.1134/S0016675818070159
РАЗНООБРАЗИЕ И РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ НАСЛЕДСТВЕННЫХ БОЛЕЗНЕЙ У НОГАЙЦЕВ КАРАЧАЕВО-ЧЕРКЕССКОЙ РЕСПУБЛИКИ
1 Медико-генетический научный центр, Москва 115522; e-mail: renazinchenko@mail.ru
2 Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова, Москва 117997
3 Хабезская центральная районная больница, Хабез 369400
4 Центральный научно-исследовательский институт травматологии и ортопедии им. Н.Н. Приорова, Москва 127299
5 Межотраслевой научно-технический комплекс “Микрохирургия глаза” им. акад. С.Н. Федорова, Москва 127486
6 Московский физико-технический институт (государственный университет), г. Долгопрудный Московской обл. 125993
Описано разнообразие и распространенность наследственных болезней (НБ) у ногайцев Карачаево-Черкесской Республики (КЧР). Численность обследованного населения КЧР – 387231 человек, из которых ногайцы составляют 14741 чел. (3.81%). Выявлено 36 нозологических форм НБ (110 больных из 81 семьи): 22 с АД наследованием, 10 с АР и 4 с Х-сц. Распространенность НБ у ногайцев составила 1 : 134. Определены особенности разнообразия НБ у ногайцев по сравнению с ранее обследованными популяциями России, выявлено накопление: АД синдрома Элерса–Данло (1 : 388), АД несовершенного амелогенеза (1 : 3685), АД болезни Дарье (1 : 4914), АР несиндромальной олигофрении (1 : 1340), АР синдрома Жильбера (1 : 4914) и Х-сц. наследуемого дефицита глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы (1 : 1774 мужчин). Проведен анализ гетерозиготного носительства “мажорных” мутаций для РФ в генах четырех АР-заболеваний у 118 неродственных клинически здоровых ногайцев (236 проанализированных хромосом): муковисцидоза (13 мутаций в гене CFTR: CFTR- dele2,3 (21 kb), F508del, Idel507, 1677delTA, 2184insA, 2143delT, 2183AA>G, 2184delA, 394delTT, 3821delT, L138ins, E92K, W1282X); фенилкетонурии (6 частых для КЧР мутаций в гене РАН: R261X, R408W, R413P, F331S, P211T, P211L); несиндромальной нейросенсорной тугоухости (мутация 35delG в гене GJB2); синдрома Жильбера (увеличение числа TA-повторов в гене UGT1A1). У ногайцев выявлена аллельная специфичность по всем изученным генам.
DOI: 10.1134/S0016675818070160
ДИВЕРГЕНТНАЯ ЭВОЛЮЦИЯ СИМБИОТИЧЕСКИХ БАКТЕРИЙ: РИЗОБИИ РЕЛИКТОВОГО БОБОВОГО Vavilovia formosa ФОРМИРУЮТ ОБОСОБЛЕННУЮ ГРУППУ В ПРЕДЕЛАХ ВИДА Rhizobium leguminosarum bv. viciae
1 Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург 196608; e-mail: arriam2008@ya.ru
2 Горный ботанический сад Дагестанского научного центра Российской академии наук, Махачкала 367000
3 Почвенный институт им. В.В. Докучаева Российской академии наук, Москва 119017
4 Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра генетики и биотехнологии, Санкт-Петербург 199034
Сравнительный анализ последовательностей симбиотических генов (nodA, nodC, nodD, nifH), являющихся элементами акцессорной части генома ризобий, показал, что штаммы Rhizobium leguminosarum bv. viciae, выделенные из клубеньков реликтового бобового растения Vavilovia formosa – ближайшего родича гипотетического общего предка трибы Fabeae, – представляют собой группу, обособленную от штаммов R. leguminosarum bv. viciae, выделенных из других представителей этой трибы (Vicia, Lathyrus, Pisum, Lens). Подобного обособления не наблюдалось по генам, представляющим коровую часть генома ризобий (16S рДНК, ITS, glnII), а также по их хозяйской специфичности. Полученные данные позволяют предположить, что дивергенция первичных последовательностей симбиотических генов маркирует начальную стадию симпатрического видообразования, которая может быть классифицирована как обособление реликтового симбиотипа “vaviloviae” – возможного эволюционного предшественника биотипа “viciae”.Сравнительный анализ последовательностей симбиотических генов (nodA, nodC, nodD, nifH), являющихся элементами акцессорной части генома ризобий, показал, что штаммы Rhizobium leguminosarum bv. viciae, выделенные из клубеньков реликтового бобового растения Vavilovia formosa – ближайшего родича гипотетического общего предка трибы Fabeae, – представляют собой группу, обособленную от штаммов R. leguminosarum bv. viciae, выделенных из других представителей этой трибы (Vicia, Lathyrus, Pisum, Lens). Подобного обособления не наблюдалось по генам, представляющим коровую часть генома ризобий (16S рДНК, ITS, glnII), а также по их хозяйской специфичности. Полученные данные позволяют предположить, что дивергенция первичных последовательностей симбиотических генов маркирует начальную стадию симпатрического видообразования, которая может быть классифицирована как обособление реликтового симбиотипа “vaviloviae” – возможного эволюционного предшественника биотипа “viciae”.
DOI: 10.1134/S0016675818070068
ВЛИЯНИЕ ГОНАДОТРОПНЫХ ГОРМОНОВ НА СТРЕССОУСТОЙЧИВОСТЬ САМОК Drosophila melanogaster, ИНФИЦИРОВАННЫХ РАЗНЫМИ ГЕНОТИПАМИ Wolbachia pipientis
1 Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск 630090; e-mail: iraushen@bionet.nsc.ru
2 Новосибирский государственный университет, кафедра генетики, Новосибирск 630090
3 Институт живых систем, Балтийский федеральный университет, Калининград 236016
Впервые исследовано влияние гонадотропных гормонов, ювенильного (ЮГ) и 20-гидроксиэкдизона (20Э), на устойчивость к тепловому стрессу самок линии дикого типа D. melanogaster, инфицированных различными генотипами альфа-протеобактерии Wolbachia pipientis. Обнаружено, что экспериментальное повышение уровня ЮГ вызывает снижение устойчивости к тепловому стрессу, а повышение уровня 20Э – ее повышение у шестисуточных самок как неинфицированных Wolbachia, так и инфицированных различными штаммами бактерии: wMelCS, wMelPop и wMel. Однако интенсивность ответа различается: у самок, инфицированных патогенным штаммом wMelPop, снижение выживаемости при повышении уровня ЮГ и ее повышение при увеличении уровня 20Э более выражены, а у самок, инфицированных генотипом wMelCS, менее выражены, чем у неинфицированных самок и самок, инфицированных генотипом wMel. Полученные данные предполагают, что генотип wMelCS вызывает у самок дрозофилы снижение, а wMelPop – повышение уровня гормона стресса, дофамина, поскольку ранее мы показали, что повышение уровня ЮГ у половозрелых самок повышает уровень дофамина, повышение уровня 20Э снижает его, а повышение/снижение уровня дофамина, в свою очередь, приводит к снижению/повышению устойчивости самок дрозофилы к тепловому стрессу.
DOI: 10.1134/S0016675818070123
ОПРЕДЕЛЕНИЕ ВИДОВОЙ ПРИНАДЛЕЖНОСТИ МНОГОСОСКОВЫХ КРЫС РОДА Mastomys (Rodentia: Muridae) ВОСТОЧНОЙ АФРИКИ С ПОМОЩЬЮ ПЦР-ТИПИРОВАНИЯ ПО ФРАГМЕНТАМ ГЕНА ЦИТОХРОМА b
Институт проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова Российской академии наук, Москва 119071; e-mail: * aleksey.martynov@mail.ru, ** llavrenchenko@gmail.com
Многососковые крысы рода Mastomys распространены по всей Африке к югу от Сахары и являются основными вредителями сельского хозяйства и переносчиками многих опасных для человека инфекций. Простая и точная видовая идентификация имеет важнейшее значение в экологических и эпидемиологических исследованиях, но осложняется отсутствием выраженной морфологической дифференциации между видами многососковых крыс. Предлагаемый нами простой молекулярный тест, основанный на использовании ПЦР-типирования по фрагментам гена цитохрома b, позволяет проведение быстрого генотипирования большого количества образцов без секвенирования для определения видов Mastomys Восточной Африки.
DOI: 10.1134/S001667581807010X
Статьи, опубликованные только в Russian J. of Genetics, № 7 – 2018 г.
Molecular Analysis of Callipyge Gene Mutation (C.267A>G) in Kajli, Lohi and Thalli Sheep Breeds of Pakistan
1 School of Life Sciences and Chinese Academy of Sciences, Key Laboratory of Brain Function and Disease, University of Science and Technology, Hefei, China; e-mail: shahbiotech3@yahoo.com
2 National Institute for Genomics and Advanced Biotechnology, National Agricultural Research Centre, Islamabad, Pakistan
3 Centre for Biotechnology and Microbiology, University of Swat, Swat, KPK, Pakistan
4 Key State Laboratory of Cellular Stress Biology, School of Life Sciences, Xiamen University, Xiamen, China
The Callipyge (CLPG) mutation has been reported in postnatal muscular hypertrophy which specifically functions in the pelvic limbs and loin of ovine. In current study, for the first time we investigated CLPG mutation (C.267A>G) by using Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) and sequencing in three Pakistani sheep breeds, named as Thalli, Kajli and Lohi. The results showed that Thalli breed has mutant homozygous (GG, 0.02%), heterozygous (AG, 0.10%) and normal homozygous (AA, 0.88%) forms of CLPG. The sequence analysis of the purified PCR product of the Thalli sheep represents these three types of genotypes. However Kajli and Lohi breeds were found normal for this genetic variation of CLPG. On the basis of current findings and physical examination of these breeds, it was concluded that CLPG Thalli breed can be a good source of mutton and subsequent breeding of the Callipyge phenotype will greatly overcome the meat shortage in Pakistan.
DOI: 10.1134/S1022795418070141
Effect of UCP2 and UCP3 Genes Polymorphisms on Functional Traits in Dairy Cattle
1 Department of Genetics and Animal Breeding, Faculty of Biotechnology and Animal Breeding, West Pomeranian University of Technology, Szczecin, Poland; e-mail: inga.kowalewska-luczak@zut.edu.pl
2 Department of Ruminant Sciences, Faculty of Biotechnology and Animal Husbandry, West Pomeranian University of Technology in Szczecin, Szczecin, Poland
The aim of this study was to investigate associations between genotypes of UCP2 and UCP3 genes, milk, and reproduction traits in dairy cattle. The study included two herds: Jersey cows and Polish Holstein-Friesian (Red and White strain) cows. All cows were genotyped using the PCR-RFLP method and allele frequencies were determined. Statistical analysis showed a significant association between polymorphism in the UCP3 gene and the milk yield and fat content of milk (P ≤ 0.05, P ≤ 0.01) and between the UCP2 gene and the calving interval (P ≤ 0.05). Information contained in this study may be useful in further analysis to define the role of analysed genes in relation to functional traits in dairy cattle, nevertheless, the obtained results should be verified by conducting research on a larger group of animals and various cattle breeds.
DOI: 10.1134/S1022795418070074