Аннотации статей. Том 50, 2014 г., № 12
СТРУКТУРНО-ФУНКЦИОНАЛЬНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ЦЕНТРОМЕР ХРОМОСОМ РАСТЕНИЙ
Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск 630090; e-mail: silkova@bionet.nsc.ru
Центромера является специфическим локусом хромосомы, который формирует белковый комплекс, кинетохор, сохраняет когезию сестринских хроматид, регулирует прикрепление хромосомы к веретену деления и координирует движение хромосомы во время митоза и мейоза. Дефектная сборка центромеры или нарушение ее функции вызывает арест клеточного цикла, структурные аномалии хромосом и анеуплоидию. В последние два десятилетия интенсивно ведутся исследования биологии центромерного района хромосом у растений, достигнуты значимые успехи. В данном обзоре собраны данные о структуре, организации и эпигенетической модификации центромерного хроматина, о структуре и функции кинетохора, о когезии сестринских хроматид, что в сумме дает представление о специфике архитектуры и функционировании центромеры во время деления и расхождения хромосом у растений
ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ РЕЛИКТОВОГО ВИДА АCANTHOPANAX SESSILIFLORUS (RUPR. ET MAXIM) SEEM. (ARALIACEAE) В ПРИМОРСКОМ КРАЕ
Биолого-почвенный институт ДВО РАН, Владивосток 690022; e-mail: kholina@biosoil.ru
На основе анализа 17 генов, кодирующих аллозимное разнообразие 12 ферментных систем, получены данные о генетической изменчивости реликта третичной флоры, ценного лекарственного растения Acanthopanax sessiliflorus (Rupr. et Maxim.) Seem. (Araliaceae) на российской части ареала. Показатели полиморфизма в среднем по популяциям имеют довольно высокие значения (P95 = 42.4%, A = 1.55, Ho = 0.211, He = 0.168), сопоставимые с известными данными для популяций A. sessiliflorus с п-ова Корея. Уровень генетического разнообразия и характер его распределения между популяциями отражает взаимодействие нескольких факторов, среди которых наиболее важными являются историческое прошлое вида, дрейф генов и пластичность системы размножения. Полученные данные могут служить основой для сохранения генетических ресурсов дальневосточных видов аралиевых
ПОЛИМОРФИЗМ ЛОКУСА PANI В ПОПУЛЯЦИИ СЕВЕРО-ВОСТОЧНОЙ АРКТИЧЕСКОЙ ТРЕСКИ GADUS MORHUA L. (GADIFORMES: GADIDAE) В БАРЕНЦЕВОМ МОРЕ И СМЕЖНЫХ ВОДАХ
1 Полярный научно-исследовательский институт морскогорыбного хозяйства и океанографии
им. Н.М. Книповича , Мурманск 183038; e-mail: makeenko@pinro.ru
2 Всероссийский научно-исследовательский институт рыбного хозяйства и океанографии, Москва 107140;
e-mail: dzel67@mail.ru
Исследован полиморфизм гена пантофизина (локуса PanI) у северо-восточной арктической трески Gadus morhua L. на акватории нагульного ареала в Баренцевом море и смежных водах. Изучены зависимости между частотой аллелей PanI и условиями обитания трески - глубиной и температурой. На большом материале (2210 особей) разновозрастной трески показано, что частота аллеля PanIA, считающегося генетическим маркером прибрежной трески, варьирует на изученной акватории Баренцева моря от 0 до 0.47. Частота аллелей не зависит от температуры воды в придонном слое, но коррелирует с глубиной в месте вылова. Выявлено значительное изменение частоты аллелей пантофизина на ранних этапах жизненного цикла при переходе пелагической молоди к придонному образужизни. Показано, что частота аллеля PanIA у пелагической молоди одинакова на всем исследованном ареале, а при оседании молоди на северных и глубоководных участках нагульных территорий частота этого аллеля падает, в то время как на более мелководных участках остается без изменений. Эти данные подтверждают селективный характер локуса PanI трески и позволяют предположить, что отбор, действующий на особей с различным генотипом по PanI, приводит к формированию устойчивого пространственного распределения частот аллелей по этому маркеру, наблюдаемого у трески старших возрастов
GENETIC DIVERSITY ANALYSIS OF EIGHT INDIGENOUS GOAT BREEDS (GROUPS) IN CHINA USING AFLP MARKERS
a Sichuan Key Laboratory of Conservation and Utilization of Animal Genetic Resources
in Tibetan Plateau, Southwest University for Nationalities, Chengdu , Sichuan 610041, China
b Key Laboratory of Animal Genetics & Breeding (Southwest University for Nationalities), State Ethnic
Affairs Commission and Ministry of Education, Chengdu, Sichuan 610041, China
c Tibetan Plateau Institute, Southwest University for Nationalities, Chengdu, Sichuan 610041, China
d College of Life Science and Technology, Southwest University for Nationalities, Chengdu, Sichuan
610041, China
e HYX Biotech LLC
Eight goat breeds from Chengdu, Lezhi, Jintang, Baiyu, Yingshan, Hejiang, Jiangan, and Jialing in Sichuan, China were analyzed for genetic diversity using AFLP markers. A total of 261 individuals were analyzed using eight selective AFLP primer combinations which generated 174 discernible fragments, of which 80 were polymorphic with an average of 27.15 bands per primer pair. Shannon’s gene diversity index among breeds ranged from 0.0888 to 0.2289, and the highest and the lowest gene diversity index among breeds were the Yingshan Black goat (0.2289) and the Baiyu Black goat (0.0888) respectively. The genetic distance (DR) among eight goat breeds were calculated by Rogers’genetic distance. Based on the analytical results, systematic trees were constructed by using the unweighted pair-group method with arithmetic average (UPGMA) and the neighbor joining (NJ) methods. Eight breeds were divided into two main clusters by using cluster analysis, one of which including two subclusters. The clustering results agreed well with the origin of the goats and geographic distribution. The results implied that AFLP markers were informative and could provide significant insights for genetic diversity research and genetic resource conservation of indigenous goats
ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ BGH, RORC И DGAT1 У МЯСНЫХ ПОРОД КРУПНОГО РОГАТОГО СКОТА РОССИИ
1 Поволжский научно-исследовательский институт производства и переработки мясомолочной
продукции Россельхозакадемии, Волгоград 400131; e-mail:niimmp@mail.ru
2 Волгоградский государственный технический университет, Волгоград 400131
3 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва 119991
4 Волгоградский государственный аграрный университет, Волгоград 400002
Изучен аллельный и генотипический полиморфизм генов С-рецептора ретиноевой кислоты (RORC), диацилглицерол-ацилтрансферазы-1 (DGAT1) и гормона роста (bGH) у мясных российских пород крупного рогатого скота: двух популяций казахской белоголовой (казахстанской и российской селекции) и калмыцкой пород, а также монгольской породы «Хогорого», родственной калмыцкой породе. Исследуемые гены ассоциированы с параметрами мясной продуктивности: мраморностью (гены bGH и RORC) и мягкостью мяса (ген DGAT1), а также с увеличением выхода мяса (ген bGH). Российская и казахстанская популяции казахской белоголовой породы характеризовались высоким содержанием АА генотипа гена RORC (0,713 и 0,608 соответственно) и АА-генотипа DGAT1 (0,913 и 0,975), предпочтительных для получения высококачественного мяса. Суммарные частоты сопряженных генотипов по генам bGH и RORC, более предпочтительных для качества и выхода мяса, в популяциях казахской белоголовой были (GG/AA и GC/AA - 68,8% и 57% для российской и казахстанской популяций) в 2 раза превышали соответствующие показатели у двух других изученных пород. Полученные совокупные данные указывают на высокий генетический потенциал казахской белоголовой породы крупного рогатого скота как породы мясного направления продуктивности. Результаты исследования могут быть использованы для повышения эффективности селекции по признакам мясной продуктивности
АССОЦИАЦИЯ ПОЛИМОРФНЫХ ВАРИАНТОВ ГЕНОВ ЦИТОКИНОВ С РИСКОМ РАЗВИТИЯ ЯЗВЕННОЙ БОЛЕЗНИ В рЕСПУБЛИКЕ бАШКОРТОСТАН
1 Башкирский Государственный Университет, Уфа 450076; e-mail: alfiyakh83@gmail.com
2 Башкирский Государственный Медицинский Университет Министерства здравоохранения, Уфа
Язвенная болезнь – это хроническое заболевание, в основе которого лежит рецидивирующая язва желудка или двенадцатиперстной кишки. Проведен анализ полиморфных локусов rs1143634 гена IL1B, rs71941886 гена IL1RN, rs4073 гена IL8, rs1800872 гена IL10 и rs1800629 гена TNFA у 254 больных язвенной болезнью желудка (ЯБЖ) и двенадцатиперстной кишки (ЯБДПК), а также у 277 неродственных здоровых индивидов, проживающих на территории республики Башкортостан. Обнаружены ассоциации аллеля C и генотипа C/C полиморфного варианта rs1143634 гена IL1B с риском развития ЯБ у представителей этнической группы башкир, с риском развития ЯБДПК. Выявлено, что гомозиготный генотип A/A полиморфного варианта rs4073 гена IL8 достоверно чаще встречался среди индивидов контрольной группы, чем среди пациентов с инфекцией H. pylori. Наши результаты подтверждают значительную роль полиморфного варианта rs1143634 гена IL1B в развитии язвенной болезни
ФАКТОРЫ ФОРМИРОВАНИЯ ПРОСТРАНСТВЕННОЙ ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ КУНДЖИ SALVELINUS LEUCOMAENIS (PALLAS)
1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва 119991;
e-mail: salm@vigg.ru
2 Институт биологии моря им. А.В. Жирмунского ДВО РАН, Владивосток 690041
С использованием собственных ранее полученных данных о пространственной популяционно-генетической структуре кунджи по 10 микросателлитным локусам выполнен анализ факторов формирования межпопуляционной дивергенции. Показана определяющая роль дрейфа генов в дифференциации популяций по ареалу, в сопоставлении с практически не проявляющейся ролью пошагового мутационного процесса; этот результат свидетельствует об общности происхождения и родственных связях южной и северной групп популяций. В подавляющем большинстве популяций не обнаружено эффекта «горлышка бутылки». Установлено наличие связи по типу изоляции расстоянием среди исследованных популяций после исключения из анализа генетически своеобразной выборки из популяции Приморья. Такая связь может определяться не только миграционным обменом среди соседних популяций, но и сложиться в ходе исторической постплейстоценовой колонизации ареала
МЕЖВИДОВОЙ ПОЛИМОРФИЗМ ГЛЮКОЗИЛТРАНСФЕРАЗНОГО ДОМЕНА ГЕНА САХАРОЗОСИНТАЗЫ У ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ РОДА MALUS И РОДСТВЕННЫХ ВИДОВ ROSACEAE
1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва 119991; e mail: docboris@mail.ru
2 Центр "Биоинженерия" Российской академии наук, Москва 117312
3 Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, кафедра биотехнологии, Москва 119234
Впервые идентифицированы последовательности, кодирующие основной функциональный глюкозилтрансферазный домен генов сахарозосинтазы у 14 представителей рода Malus и родственных видов семейства Rosaceae и изучен их полиморфизм. В изученных последовательностях были обнаружены единичные нуклеотидные замены, приводящие к аминокислотным заменам в последовательности белка, и в том числе в последовательности консервативного трансмембранного мотива, характерного для всех генов сахарозосинтазы высших растений