Аннотации статей. Том 50, 2014 г., № 1
ГИСТОН ДЕАЦЕТИЛАЗА SIN3 КОНТРОЛИРУЕТ УРОВЕНЬ СПОНТАННОГО И УФ-ИНДУЦИРОВАННОГО МУТАГЕНЕЗА В ДРОЖЖАХ SACCHAROMYCES CEREVISIAE
Петербургский институт ядерной физики им. Б.П. Константинова, Ленинградская обл., Гатчина 188300; e-mail: lge@omrb.pnpi.spb.ru
Продукт гена SIN3 функционирует в дрожжах Saccharomyces cerevisiae как репрессор большого числа генов. Этот крупный белок (около 175 кДа) входит в состав большого белкового комплекса RPD3 с оценочной массой более чем 2 миллиона дальтон. Ранее было показано, что мутанты по гену RPD3 влияют на рекомбинационный и репарационный процессы в дрожжах Saccharomyces cerevisiae. Мы изучили влияния мутации sin3 на чувствительность клеток к УФ лучам и УФ-индуцированный мутагенез в почкующихся дрожжах. Делеция гена SIN3 приводит к слабой УФ чувствительности почкующихся мутантных клеток по сравнению с клетками дикого типа. Полученные результаты показывают, что мутация sin3 снижает уровень как спонтанного, так и УФ–индуцированного мутагенеза. Это, возможно, связано с нарушением регуляции активности рибонуклеотидредуктазы, что приводит к снижению уровня дНТФ, ухудшению эффективности ошибочной ветви пострепликативной репарации и, как следствие, уменьшению частоты мутаций
МОЛЕКУЛЯРНО-ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РОДА ABIES (PINACEAE) НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ХЛОРОПЛАСТНОЙ ДНК
Институт экологии растений и животных Уральского отделения Российской академии наук, Екатеринбург 620144; e-mail: semerikov@ipae.uran.ru
Филогенетическое исследование пихт (Abies Mill.) было проведено с использованием нуклеотидных последовательностей нескольких регионов хлоропластной ДНК общей длиной 5580 п.н. и включало 37 таксонов, представляющих основные линии эволюции рода, а также Keteleeria davidiana. Согласно филогенетической реконструкции, виды Abies разделились на шесть основных групп, в целом соответствующих их географическому распространению. Дерево имеет три базальные клады, все они содержат американские виды и только одна – евроазиатские. Калибровки времени дивергенции, основанные на палеоботанических данных и на оценке скорости мутирования хлоропластной ДНК у Pinaceae, дали близкие результаты. Возраст диверсификации среди базальных клад современных Abies был оценен как конец олигоцена - начало миоцена. Возраст отделения средиземноморской ветви от азиатско-североамериканской соответствует миоцену. Возраст диверсификации внутри «молодых» групп: средиземноморских, азиатских и «бореальных» американских пихт (A. lasiocarpa, A. balsamea, A. fraseri) оценен как плиоцен-плейстоцен. На основе полученной филогенетической реконструкции предложены наиболее вероятные биогеографические сценарии. Существующие систематические классификации Abies находятся в серьезном противоречии с филогенетической реконструкцией и требуют ревизии
ГЕНЫ ЦЕЛЛЮЛОЗОСИНТАЗ, КОНТРОЛИРУЮЩИЕ ФОРМИРОВАНИЕ ВОЛОКНА ЛЬНА (LINUM USITATISSIMUM L.)
1 Институт генетики и цитологии Национальной академии наук Беларуси, Минск 220072, Беларусь; e-mail: dimgal200@rambler.ru
2 Белорусский государственный технологический университет, Минск 220006, Беларусь
3 Центральный ботанический сад Национальной академии наук Беларуси, Минск 220012, Беларусь
На основании анализа класс-специфических областей идентифицированы четыре гена целлюлозосинтаз – LusCesA1, LusCesA4, LusCesA7 и LusCesA9, из которых на стадии быстрого роста растений льна LusCesA4, LusCesA7 и LusCesA9 экспрессируются в стебле, LusCesA1 и LusCesA4 – в апикальной части растений и LusCesA4 – в листьях. Показано, что экспрессия генов LusCesA7 и LusCesA9 является специфичной для стеблей льна-долгунца и, вероятно, влияет на качество льноволокна
ГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПОТЕНЦИАЛ МЕСТНЫХ ЭНДЕМИЧНЫХ ФОРМ ГОРОХА PISUM SATIVUM L. ПО ПРИЗНАКАМ АЗОТФИКСАЦИИ И ПРОДУКТИВНОСТИ
Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск 630090; e-mail: sidorova@bionet.nsc.ru
Изучены морфологические и симбиотические признаки у местных эндемичных форм гороха, происходящих из Египта, Сирии, Афганистана и Палестины. В полевом и тепличном опытах ряд эндемичных форм превзошли по продуктивности семян районированный сорт кормового гороха Дружная. Для улучшения нодуляции и азотфиксации эндемичные формы скрещивали с суперклубеньковым мутантом К301, маркированным геном nod4. Проведен рекуррентный отбор линий до поколения F6 включительно с оценкой продуктивности, нодуляции и азотфиксации. Наиболее перспективные рекуррентные линии с высокой продуктивностью, активной нодуляцией и высокой азотфиксацией получены при скрещивании эндемичных форм с рекуррентной линией, маркированной геном nod4. Линия была создана ранее при скрещивании сорта Дружная с суперклубеньковым мутантом К301, маркированным геном nod4
ПОЛУЧЕНИЕ ТРАНСГЕННЫХ РАСТЕНИЙ ТАБАКА, ЭКСПРЕССИРУЮЩИХ ФРАГМЕНТЫ ГЕНОВ ARGOS И NTEXPA4 В АНТИСМЫСЛОВОЙ ОРИЕНТАЦИИ
Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра Российской академии наук, Уфа 450054, e-mail: kuluev@bk.ru
Получены трансгенные растения табака, экспрессирующие фрагменты генов ARGOS и NtEXPA4 в антисмысловой ориентации. Пять линий трансгенных растений из 11 исследованных характеризовались уменьшением размеров листьев и цветков, по сравнению с контролем. Размеры стебля уменьшались лишь при использовании фрагмента гена NtEXPA4. Размеры органов у опытных растений уменьшались как за счет снижения уровня клеточного деления, так и клеточного растяжения. Две линии трансгенных растений табака, экспрессирующих участок гена ARGOS в антисмысловой ориентации характеризовались снижением уровня экспрессии генов NtEXPA1 и NtEXPA4.
ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ КУНДЖИ SALVELINUS LEUCOMAENIS (PALLAS) РОССИЙСКОГО ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА
1 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва 119991; e-mail: salm@vigg.ru
2 Институт биологии моря им. А.В. Жирмунского ДВО РАН, Владивосток 690041
Популяционно-генетическая структура гольца кунджи Salvelinus leucomaenis (cем. Salmonidae) исследована на основе анализа изменчивости 10 микросателлитных локусов ДНК в выборках из разных районов ареала на Дальнем Востоке России. В нескольких выборках исследовали также изменчивость 21 аллозимного локуса, из которых 5 оказались полиморфными. Общий уровень изменчивости по исследованным маркерам соизмерим с таковым у близкого вида мальмы. Оценки межпопуляционной генетической дифференциации высоко достоверны в большинстве попарных сравнений выборок. Общие оценки пространственной генетической дифференциации у кунджи в FST = 0.203 и RST = 0.202. Кластерный анализ и многомерное шкалирование на основе аллельных частот микросателлитных локусов показывают вероятное подразделение исследованных выборок на две основные группы: северную (представленную регионами: север Хабаровского края, Камчатка, Ямский залив) и южную (с регионами: Сахалин, Приморье, Курильские острова). Сходный характер дифференциации демонстрируют и аллозимные данные. Уровень внутри- и межпопуляционного генетического разнообразия в южной группе популяций выше, чем в северной. Тест на изоляцию расстоянием не выявляет значимой корреляции генетических и географических расстояний между выборками. Результаты исследования позволяют считать, что популяционно-генетическая структура кунджи сформировалась под воздействием исторических геолого-климатических преобразований ее ареала и генетического дрейфа, обусловленного относительно невысокой популяционной численностью и ограниченной по протяженности миграционной активностью ее проходной формы
АНТИМУТАГЕННЫЙ ЭФФЕКТ ХЕМОСИГНАЛОВ САМОК-ОДИНОЧЕК НА ДЕЛЯЩИЕСЯ КЛЕТКИ КОСТНОГО МОЗГА САМЦОВ МЫШЕЙ ЛИНИИ СВА
Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра генетики и биотехнологии, Санкт-Петербург 199034; e-mail: mouse_gene@mail.ru
Изучали влияние хемосигналов половозрелых самок-одиночек на уровень радиоиндуцированных нарушений митоза в клетках костного мозга самцов у мышей линии СВА. Показано, что после 24-х-часовой экспозиции облученных самцов (4 Гр) на подстилке, содержащей хемосигналы самок-одиночек, частота хромосомных аберраций и других митотических нарушений была достоверно ниже, чем у облученных самцов на чистой подстилке. Обсуждаются механизмы и значение выявленного антимутагенного эффекта хемосигналов самок домовой мыши
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ КОМПОНЕНТЫ И НЕОПРЕДЕЛЁННОСТЬ ФЕНОТИПИЧЕСКОЙ РЕАЛИЗАЦИИ МАССЫ НОВОРОЖДЕННОЙ ОСОБИ У ДОМАШНЕЙ СВИНЬИ SUS SCROFA
1 Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, Новосибирск 630090; e-mail: nsv1956@mail.ru
2 Новосибирский государственный аграрный университет,кафедра разведения и кормления животных, Новосибирск 630039; e-mail: knyser@rambler.ru
В статье рассматриваются особенности генетической детерминации непрерывного количественного признака – массы новорожденной особи в популяциях домашних свиней. Проведено выделение таких компонент детерминации фенотипа, как материнский эффект, полное доминирование, взаимодействие аллелей родителей в генотипе потомка и неопределённость фенотипической реализации генотипа. Показано, что признак с высокой генетической детерминацией может иметь максимальную неопределённость фенотипической реализации, при которой каждому возможному для популяции генотипу доступен весь диапазон возможных в популяции фенотипов
ОТБОР ПО АНОМАЛИЯМ ЦВЕТОВОГО ЗРЕНИЯ В НЕКОТОРЫХ ГРУППАХ НАСЕЛЕНИЯ ЕВРАЗИИ
Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук, Москва 119991; e-mail: alexey.evsyukov@gmail.com
Получены коэффициенты приспособленности и другие количественные характеристики отбора по обобщенному гену цветовой слепоты CB+ для трех этно-географических групп народонаселения: белорусов Белоруссии, народов Волго-Уральского региона, народов Сибири и Дальнего Востока России. В качестве отклонений от нормального цветовосприятия учитывались все нарушения, кодируемые локусами OPN1LW и OPN1MW. Оценка коэффициентов проводилась путем аппроксимации наблюдаемого распределения частот CB+ теоретическим стационарным распределением для островной модели Райта, которое учитывает давление миграций, отбора и случайный дрейф, а показатели отбора содержит в виде параметров распределения. Для популяций Сибири и Дальнего Востока выявлен направленный отбор в пользу нормального цветового зрения и соответствующего ему «аллеля» CB–, у белорусов и у народов Волго-Уральского региона наблюдается стабилизирующий отбор. Интенсивность отбора составила для белорусов s=0.03, для коренных народов Волго-Уральского региона s=0.22, для народов Сибири и Дальнего Востока s=0.24
ОТЯГОЩЕННОСТЬ И РАЗНООБРАЗИЕ НАСЛЕДСТВЕННОЙ ПАТОЛОГИИ В ЧЕТЫРЕХ РАЙОНАХ РОСТОВСКОЙ ОБЛАСТИ
1 Научно-исследовательский институт биологии, Ростов-на-Дону 344090; e-mail: samelina60@mail.ru
2 Медико-генетический научный центр Российской академии медицинских наук, Москва 115478; e-mail: renazinchenko@mail.ru
3 Центральный научно-исследовательский институт им. Н.Н. Приорова МЗ РФ, Москва 127299; е-mail: cito-uchsovet@mail.ru
Впервые представлены результаты медико-генетического изучения населения 4 районов (176535 человек) Ростовской области (Дубовский, Зимовниковский, Мясниковский, Красносулинский район). Рассчитана отягощенность городского и сельского населения АД, АР и Х-сцепленной патологии, описано разнообразие моногенных наследственных болезней (МНБ). Нозологический спектр МНБ составил 117 заболеваний (63 с АД наследованием, 38 с АР наследованием и 16 с Х-сц.). Анализ показал, что встречаемость МНБ среди населения Ростовской области составляет 1:336. Выявлена дифференциация в значениях груза (АД, АР и Х-сц. патологии) между отдельными районами
РИСК ГЕНЕТИЧЕСКОЙ ТРАНСФОРМАЦИИ МУЛЬТИПОТЕНТНЫХ МЕЗЕНХИМАЛЬНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК IN VITRO
Медико-генетический научный центр Российской академии медицинских наук, Москва 115478; e-mail: nikitinava@yandex.ru
Подтверждение эффективности клеточной терапии многочисленными исследованиями и клиническими испытаниями неизбежно ставит вопрос о совершенствовании нормативной базы, регулирующей ее использование. Особое внимание необходимо обратить на контроль генетической безопасности клеточных препаратов. Иммунная, генная, фармакологическая модификация и экспансия клеток in vitro могут приводить к нежелательным побочным эффектам, не только снижающим лечебный, восстановительный, регуляторный потенциал клеточной терапии, но и повышающим риск накопления генетически аберрантных клеток и онкогенной трансформации клеточных препаратов. В статье проведена оценка параметров генетической стабильности культивируемых мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток (МСК), выделенных из костного мозга и жировой ткани. Исследование проводилось с использованием классических методов генотоксикологии: гель-электофорез отдельных клеток (ДНК комет) и микроядерный тест. Описан базовый уровень повреждений ДНК и частот микроядер, выявлены генетически нестабильные культуры, проведено сравнение генетической изменчивости МСК, выделенных из разных тканей
СРАВНИТЕЛЬНЫЙ ПАРНЫЙ АНАЛИЗ ТРАНСКРИПТОМА СПОНТАННО ТРАНСФОРМИРОВАННЫХ МУЛЬТИПОТЕНТНЫХ СТРОМАЛЬНЫХ КЛЕТОК ЖИРОВОЙ ТКАНИ ЧЕЛОВЕКА
Медико-генетический научный центр Российской академии медицинских наук, Москва 115478; e-mail: omdeno@gmail.com
Целью данной работы было определение потенциальных маркеров и механизма спонтанной трансформации мультипотентных стромальных клеток (МСК) периваскулярного иммунофенотипа.
Был проведен сравнительный анализ транскриптома 6-ти парных образцов нормальных и спонтанно трансформированных МСК периваскулярного иммунофенотипа, полученных на первых пассажах после выделения из жировой ткани 6-ти здоровых доноров. По данным, полученным с помощью микрочипа Illumina HT-12 v4, алгоритмом Significance Analysis of Microarrays (SAM) были выявлены дифференциально экспрессированные транскрипты и проведен статистический анализ по базам данных Gene Ontology (GO) и Molecular Signatures Database (MSigDB).
Полученные результаты позволяют предположить связь спонтанной трансформации изолированных МСК периваскулярного иммунофенотипа с известными путями онкогенной трансформации клеток (E2F, ATR/ATM, RAS, RHOA) и дают направление для более детальных исследований. Также представлена панель потенциальных маркеров трансформации, среди которых есть малоизученные, а также ранее не связанные с онкологией гены (HSPB6, PLAC9, FEZ1, DTWD1, APH1A, ATP5L)
ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF EIGHTEEN POLYMORPHIC MICROSATELLITE LOCI IN SCHIZOPYGOPSIS YOUNGHUSBANDI REGAN AND CROSS-AMPLIFICATION IN THREE OTHER SCHIZOTHORACINAE SPECIES
a Key Laboratory of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, College of Fisheries, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China; e-mail: kjwei@mail.hzau.edu.cn
b Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Wuhan 430070, P. R. China
c Key Laboratory of Freshwater Biodiversity Conservation, Ministry of Agriculture, Yangtze River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuhan 430223, P. R.
China
Eighteen polymorphic microsatellite loci were isolated from Schizopygopsis younghusbandi Regan and the characterization of these loci was assessed in 46 individuals collected from the Yarlung Tsangpo River in Tibet, China. The number of alleles per locus ranged from 2 to 14. The expected heterozygosity and Shannon-Wiener diversity index ranged from 0.022 to 0.879 and from 0.059 to 2.313, respectively. The cross-species amplification and applicability of these loci were tested in three other Schizothoracinae species belonging to Schizothorax and Oxygymnocypris. These loci will be useful for the evaluation of genetic diversity and population genetic structure in S. younghusbandi and other related species