ВЛИЯНИЕ МУТАЦИЙ ГЕНА LAWC/TRF2 НА ФОРМИРОВАНИЕ ХРОМОЦЕНТРА И РАСХОЖДЕНИЕ ХРОМОСОМ У DROSOPHILA MELANOGASTER
Ю.Е. Воронцова, Р.О. Черезов, О.Б. Симонова
Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, 119334 Москва
E-mail: osimonova@hotmail.com
У дрозофилы один из генов комплекса lawc/Trf2 (leg-arista-wing complex/TBP related factor 2) кодирует альтернативный фактор базовой транскрипции гомологичный белку TRF2 позвоночных животных и человека и принадлежит консервативному семейству генов Tbp (TATA box-binding protein). В данной работе изучали причины высокой частоты нерасхождения хромосом среди потомков мутантов 18 линий со сниженной экспрессией белка TRF2. Было установлено, что подавление экспрессии TRF2 нарушает формирование компактного хромоцентра и правильного сближения гомологичных хромосом, как в герминативных, так и в соматических клетках. Обсуждается возможность участия TRF2 в эволюционном генетически запрограммированном процессе нарушения соотношения полов, характерном ряду видов животных.
СТАТУС ДОМИНИРОВАНИЯ ФОРМЫ ПОЛОВЫХ ОРГАНОВ САМЦОВ В МЕЖВИДОВЫХ СКРЕЩИВАНИЯХ ДРОЗОФИЛ ГРУППЫ VIRILIS
А.М. Куликов, А.И. Мельников, Н.Г. Горностаев, О.Е.Лазебный
Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, Москва, 119334, oelazebny@gmail.com
Проведен анализ наследуемости формы основного видоспецифического морфологического признака у дрозофил группы virilis – полового органа самцов. Проанализированы гибридные самцы от скрещиваний D. virilis × D. lummei и D. virilis × D. novamexicana. Полученные результаты свидетельствуют о нарастании доли признаков с рецессивным статусом у эволюционно более молодых видов, роли половых хромосом в реализации доминантного или рецессивного статуса признака. Обсуждается роль аддитивной и эпистатической составляющих общей изменчивости в эволюции статуса доминирования, показанная в ряде известных теоретических моделей и подтверждаемая нашими данными. Обсуждаются литературные данные по стерилизации гибридных самцов в межвидовых скрещиваниях с позиции эволюции доминирования.
ВЛИЯНИЕ ДИЗРУПЦИИ ГЕНА YPS1 НА ЖИЗНЕСПОСОБНОСТЬ ШТАММА ДРОЖЖЕЙ PICHIA PASTORIS И НА УРОВЕНЬ ПРОДУКЦИИ ГЕТЕРОЛОГИЧНЫХ БЕЛКОВ
Е.А. Сазонова*, А.Е. Зобнина, М.В. Падкина
Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, 199034
e-mail: genetics@bio.pu.ru, jeniasaz@mail.ru
Получен штамм дрожжей Pichia pastoris PS111 с дизрупцией гена YPS1, кодирующего экстраклеточную аспарагиновую протеазу. Инактивация гена YPS1, не оказывает влияния на характер и скорость роста штамма в стандартных средах и условиях культивирования. На жизнеспособность штамма PS111, в отличие от yps1 мутантов дрожжей Saccharomyces cerevisiae, не влияет увеличение концентрации кальция, повышение температуры выращивания и изменение рН в интервале от 4,9 до 8,3. Детергент додецилсульфат натрия подавляет рост штамма PS111, как и yps1 мутантов дрожжей S. cerevisiae, но в десятикратной концентрации. Использование штамма PS111 в качестве продуцента гетерологичных белков незначительно уменьшает деградацию химерного белка Альбурона 16, состоящего из альбумина и альфа16-интерферона человека, и существенно снижает степень протеолиза альфа16-интерферона человека
ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ ДЕГРАДАЦИИ НАФТАЛИНА И ФЕНАНТРЕНА У ШТАММОВ Burkholderia sp.
Т.Ю. Измалкова1,*, О.И. Сазонова1, И.А. Кошелева1,2, А.М. Боронин1,2.
1Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина Российской академии наук, Московская область, Пущино 142290,
e-mail: tatiz@ibpm.pushchino.ru
2Пущинский государственный естественно-научный институт, Московская область, Пущино 142290
Проведен анализ генетических систем катаболизма нафталина и фенантрена пяти штаммов Burkholderia sp., изолированных из образцов почв Западной Сибири, загрязненных мазутом, а также штамма коллекции лаборатории Burkholderia sp. BS3702, изолированного из образцов почв коксогазового комбината г.Видное Московской области. Данные настоящей работы свидетельствуют о том, что деградацию нафталина и фенантрена у исследуемых штаммов кодируют последовательности негомологичные «классическим» nah-генам псевдомонад. В штамме Burkholderia sp. BS3702 начальные стадии деградации фенантрена и последующие стадии деградации салицилата контролируются последовательностями, имеющими различное эволюционное происхождение (phn и nag–генами).
ХРОМОСОМНАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ КЛЕТОК ВИНОГРАДА VITIS AMURENSIS RUPR., ТРАНСФОРМИРОВАННЫХ РАСТИТЕЛЬНЫМ ОНКОГЕНОМ ROLB
К.В. Киселев*, Л.С. Лауве, А.П. Тюнин
Биолого-почвенный институт
Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток, 690022, e-mail: kiselev@biosoil.ru
В данной работе изучены хромосомные числа и число ядрышек в культурах клеток винограда амурского Vitis amurensis Rupr., трансформированных онкогеном rolB из A. rhizogenes. В целом основным эффектом интеграции гена rolB в состав ДНК клеток винограда является повышение уровня хромосомной изменчивости и числа ядрышек культивируемых клеток. Обсуждается возможное влияние наблюдаемых хромосомных изменений на продукционные характеристики используемых культур клеток винограда.
ФИЛОГЕНИЯ ЛОСОСЕВЫХ РЫБ (SALMONIFORMES: SALMONIDAE) И ЕЕ МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДАТИРОВКА: АНАЛИЗ МТДНК-ДАННЫХ
С. В. Шедько, И. Л. Мирошниченко, Г. А. Немкова
Биолого-почвенный институт Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток, 690022, e-mail: shedko@biosoil.ru
На основе данных по митохондриальной ДНК, взятых из Genbank, и оригинальных материалов проанализированы филогенетические взаимоотношения 41 вида лососевых рыб, а также некоторые аспекты их диверсификации во времени. Положение корня филогенетического дерева Salmonidae оказалось неустойчивое. Среди возможных вариантов наиболее обоснованным выглядит тот, в котором хариусовые объединены в одну кладу с сиговыми, а линия лососевых занимает базальное относительно нее положение. Роды подсемейства Salmoninae составили две хорошо выраженные клады: (Brachymystax, Hucho) и (Salmo, Parahucho, (Salvelinus, (Parasalmo, Oncorhynchus))). При этом роды Parasalmo и Oncorhynchus оказались взаимно монофилетическими. Обсуждены вопросы конгруэнтности филогенетических деревьев Salmonidae, построенных по разным типам маркеров. Согласно байесовскому датированию, предковые линии лососевых и сестринских к ним щукообразных разошлись около 106 млн. лет назад. Некоторое время спустя – вероятно, 70–100 млн. лет назад – произошла специфическая для лососевых полногеномная дупликация. Разделение у лососевых рыб линий родового уровня происходило много позже – в интервале 42–20 млн. лет назад. Основная волна диверсификации лососевых на видовом уровне имела место в последние 12 млн. лет. Обсуждено возможное влияние геномной дупликации на характер диверсификации Salmonidae.
ВНУТРИВИДОВАЯ ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ
СОЛОВЬЯ-КРАСНОШЕЙКИ (Luscinia сalliope): ДАННЫЕ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ГЕНА ЦИТОХРОМА B мтДНК
Л. Н. Спиридонова1*, О.П. Вальчук1, П.С. Белов2, К.С. Масловский2
1Биолого-почвенный институт Российской академии наук Дальневосточного отделения, , 690022 Владивосток
2Дальневосточный федеральный университет, e-mail: spiridonova@biosoil.ru
Впервые исследовано генетическое разнообразие и внутривидовая подразделенность Luscinia calliope по данным секвенирования гена цитохрома b мтДНК. Выявлена глубокая дифференциация гаплотипов соловья-красношейки на западную и восточную группы, включающие подвиды соответственно их географической привязанности. Для вида в целом показано высокое гаплотипическое (Hd = 0,986) и нуклеотидное (π = 0,00875) разнообразие. Между “западными” и “восточными” гаплотипами выявлены значительные генетические дистанции (D = 0,016), которые оказались в четыре раза больше внутривидовых дистанций по цитохрому b воробьиных (D = 0,004). Для трех птиц из Забайкалья обнаружена значительная генетическая дивергенция, что косвенно может указывать на существование в данной части ареала переходной зоны нескольких подвидов.
ГЕНЫ ГОРМОНА РОСТА РЫБ. ДИВЕРГЕНЦИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ИНТРОНОВ У ГОЛЬЦОВ РОДА SALVELINUS
М.В. Панькова1*, Вл.А. Брыков1,2, В.В. Панькова2, Д.М. Атопкин1
1Дальневосточный федеральный университет, Школа естественных наук, Академия экологии, морской биологии и биотехнологии, Владивосток, 690600, e-mail: pamarine@gmail.com
2Институт биологии моря им. А.В. Жирмунского Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток 690059, e-mail: vlbrykov@mail.ru
Сравнивались нуклеотидные последовательности двух больших интронов (C и D) в двух паралогичных генах гормона роста GH1 и GH2 у 8 видов гольцов рода Salvelinus (Osteichthes; Salmonidae). Показано, что скорости дивергенции интронов в двух генах существенно отличаются. Более консервативными оказались интроны в гене GH1, скорость изменений интронов в гене GH2 значимо выше. Эти данные свидетельствуют о влиянии факторов отбора на некодирующие последовательности в ядерных генах. Меньшая конгруэнтность филогенетической схемы, полученной на основе анализа интронов GH1 со схемой по GH2 и с общепринятыми представлениями об эволюции видов гольцов, также подтверждает существование разнонаправленных и отличающихся по силе факторов отбора по интронным некодирующим последовательностям.
АНАЛИЗ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ
У СЕЛЬДЕЙ (Clupea pallasii marisalbi) БЕЛОГО МОРЯ
А.В. Семенова1, А.П. Андреева1, А.К. Карпов1, А.Н. Строганов1, Г.А. Рубцова2,
К.И. Афанасьев2.
1Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, кафедра ихтиологии, Москва 119991
e-mail: anna.semenova@mail.bio.msu.ru
2Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук. Москва 119991 e-mail: afanasiev@vigg.ru
Исследовано генетическое разнообразие нерестовых группировок сельдей из различных районов Белого моря на основании 10 микросателлитных локусов. Все локусы были полиморфны, оценки ожидаемой гетерозиготности варьировали от 12.7 до 94.1% (в среднем 59.5%). Степень генетической дифференциации беломорских сельдей была достоверно значима (θ = 2.03%). Уровень попарной генетической дифференциации FST варьировал от -0.001 до 0.085 и был достоверно значим во многих парах сравнения. Иерархический анализ (AMOVA) выявил достоверно значимую дифференциацию сельдей Белого моря. 96.59% генного разнообразия распределено в пределах выборок, а 3.41% приходится на межпопуляционные различия. Основная компонента межпопуляционного генного разнообразия (1.85 %) приходится на различия между двумя экологическими формами сельдей - весенне - и летненерестующими. В пределах весенненерестующей формы показано наличие локальных стад в Кандалакшском, Онежском и Двинском заливах.
АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ ПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ