ВЛИЯНИЕ МУТАЦИЙ ГЕНА LAWC/TRF2 НА ФОРМИРОВАНИЕ ХРОМОЦЕНТРА И РАСХОЖДЕНИЕ ХРОМОСОМ У DROSOPHILA MELANOGASTER

Ю.Е. Воронцова, Р.О. Черезов, О.Б. Симонова

Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, 119334 Москва

E-mail: osimonova@hotmail.com

 

У дрозофилы один из генов комплекса lawc/Trf2 (leg-arista-wing complex/TBP related factor 2) кодирует альтернативный фактор базовой транскрипции гомологичный белку TRF2 позвоночных животных и человека и принадлежит консервативному семейству генов Tbp (TATA box-binding protein). В данной работе изучали причины высокой частоты нерасхождения хромосом среди потомков мутантов 18 линий со сниженной экспрессией белка TRF2. Было установлено, что подавление экспрессии TRF2 нарушает формирование компактного хромоцентра и правильного сближения гомологичных хромосом, как в герминативных, так и в соматических клетках. Обсуждается возможность участия TRF2 в эволюционном генетически запрограммированном процессе нарушения соотношения полов, характерном ряду видов животных.

 

 

СТАТУС ДОМИНИРОВАНИЯ ФОРМЫ ПОЛОВЫХ ОРГАНОВ САМЦОВ В МЕЖВИДОВЫХ СКРЕЩИВАНИЯХ ДРОЗОФИЛ ГРУППЫ VIRILIS

А.М. Куликов, А.И. Мельников, Н.Г. Горностаев, О.Е.Лазебный

Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова РАН, Москва, 119334, oelazebny@gmail.com

 

Проведен анализ наследуемости формы основного видоспецифического морфологического признака у дрозофил группы virilis – полового органа самцов. Проанализированы гибридные самцы от скрещиваний D. virilis × D. lummei и D. virilis × D. novamexicana. Полученные результаты свидетельствуют о нарастании доли признаков с рецессивным статусом у эволюционно более молодых видов, роли половых хромосом в реализации доминантного или рецессивного статуса признака. Обсуждается роль аддитивной и эпистатической составляющих общей изменчивости в эволюции статуса доминирования, показанная в ряде известных теоретических моделей и подтверждаемая нашими данными. Обсуждаются литературные данные по стерилизации гибридных самцов в межвидовых скрещиваниях с позиции эволюции доминирования.

 

 

ВЛИЯНИЕ ДИЗРУПЦИИ ГЕНА YPS1 НА ЖИЗНЕСПОСОБНОСТЬ ШТАММА ДРОЖЖЕЙ PICHIA PASTORIS И НА УРОВЕНЬ ПРОДУКЦИИ ГЕТЕРОЛОГИЧНЫХ БЕЛКОВ

Е.А. Сазонова*, А.Е. Зобнина, М.В. Падкина

Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербург, 199034

e-mail: genetics@bio.pu.ru, jeniasaz@mail.ru

 

Получен штамм дрожжей Pichia pastoris PS111 с дизрупцией гена YPS1, кодирующего экстраклеточную аспарагиновую протеазу. Инактивация гена YPS1, не оказывает влияния на характер и скорость роста штамма в стандартных средах и условиях культивирования. На жизнеспособность штамма PS111, в отличие от yps1 мутантов дрожжей Saccharomyces cerevisiae, не влияет увеличение концентрации кальция, повышение температуры выращивания и изменение рН в интервале от 4,9 до 8,3. Детергент додецилсульфат натрия подавляет рост штамма PS111, как и yps1 мутантов дрожжей S. cerevisiae, но в десятикратной концентрации. Использование штамма PS111 в качестве продуцента гетерологичных белков незначительно уменьшает деградацию химерного белка Альбурона 16, состоящего из альбумина и альфа16-интерферона человека, и существенно снижает степень протеолиза альфа16-интерферона человека

 

 

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ ДЕГРАДАЦИИ НАФТАЛИНА И ФЕНАНТРЕНА У ШТАММОВ Burkholderia sp.

Т.Ю. Измалкова^1,*, О.И. Сазонова¹, И.А. Кошелева^1,2, А.М. Боронин^1,2.

¹Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина Российской академии наук, Московская область, Пущино 142290,

e-mail: tatiz@ibpm.pushchino.ru

²Пущинский государственный естественно-научный институт, Московская область, Пущино 142290

 

Проведен анализ генетических систем катаболизма нафталина и фенантрена пяти штаммов Burkholderia sp., изолированных из образцов почв Западной Сибири, загрязненных мазутом, а также штамма коллекции лаборатории Burkholderia sp. BS3702, изолированного из образцов почв коксогазового комбината г.Видное Московской области. Данные настоящей работы свидетельствуют о том, что деградацию нафталина и фенантрена у исследуемых штаммов кодируют последовательности негомологичные «классическим» nah-генам псевдомонад. В штамме Burkholderia sp. BS3702 начальные стадии деградации фенантрена и последующие стадии деградации салицилата контролируются последовательностями, имеющими различное эволюционное происхождение (phn и nag–генами).

 

 

ХРОМОСОМНАЯ ВАРИАБЕЛЬНОСТЬ КЛЕТОК ВИНОГРАДА VITIS AMURENSIS RUPR., ТРАНСФОРМИРОВАННЫХ РАСТИТЕЛЬНЫМ ОНКОГЕНОМ ROLB

К.В. Киселев^*, Л.С. Лауве, А.П. Тюнин

Биолого-почвенный институт Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток, 690022, e-mail: kiselev@biosoil.ru

 

В данной работе изучены хромосомные числа и число ядрышек в культурах клеток винограда амурского Vitis amurensis Rupr., трансформированных онкогеном rolB из A. rhizogenes. В целом основным эффектом интеграции гена rolB в состав ДНК клеток винограда является повышение уровня хромосомной изменчивости и числа ядрышек культивируемых клеток. Обсуждается возможное влияние наблюдаемых хромосомных изменений на продукционные характеристики используемых культур клеток винограда.

 

 

ФИЛОГЕНИЯ ЛОСОСЕВЫХ РЫБ (SALMONIFORMES: SALMONIDAE) И ЕЕ МОЛЕКУЛЯРНАЯ ДАТИРОВКА: АНАЛИЗ МТДНК-ДАННЫХ

С. В. Шедько, И. Л. Мирошниченко, Г. А. Немкова

Биолого-почвенный институт Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток, 690022, e-mail: shedko@biosoil.ru

 

На основе данных по митохондриальной ДНК, взятых из Genbank, и оригинальных материалов проанализированы филогенетические взаимоотношения 41 вида лососевых рыб, а также некоторые аспекты их диверсификации во времени. Положение корня филогенетического дерева Salmonidae оказалось неустойчивое. Среди возможных вариантов наиболее обоснованным выглядит тот, в котором хариусовые объединены в одну кладу с сиговыми, а линия лососевых занимает базальное относительно нее положение. Роды подсемейства Salmoninae составили две хорошо выраженные клады: (Brachymystax, Hucho) и (Salmo, Parahucho, (Salvelinus, (Parasalmo, Oncorhynchus))). При этом роды Parasalmo и Oncorhynchus оказались взаимно монофилетическими. Обсуждены вопросы конгруэнтности филогенетических деревьев Salmonidae, построенных по разным типам маркеров. Согласно байесовскому датированию, предковые линии лососевых и сестринских к ним щукообразных разошлись около 106 млн. лет назад. Некоторое время спустя – вероятно, 70–100 млн. лет назад – произошла специфическая для лососевых полногеномная дупликация. Разделение у лососевых рыб линий родового уровня происходило много позже – в интервале 42–20 млн. лет назад. Основная волна диверсификации лососевых на видовом уровне имела место в последние 12 млн. лет. Обсуждено возможное влияние геномной дупликации на характер диверсификации Salmonidae.

 

 

ВНУТРИВИДОВАЯ ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ

СОЛОВЬЯ-КРАСНОШЕЙКИ (Luscinia сalliope): ДАННЫЕ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ГЕНА ЦИТОХРОМА B мтДНК

Л. Н. Спиридонова¹*, О.П. Вальчук¹, П.С. Белов², К.С. Масловский²

¹Биолого-почвенный институт Российской академии наук Дальневосточного отделения, , 690022 Владивосток

²Дальневосточный федеральный университет, e-mail: spiridonova@biosoil.ru

 

Впервые исследовано генетическое разнообразие и внутривидовая подразделенность Luscinia calliope по данным секвенирования гена цитохрома b мтДНК. Выявлена глубокая дифференциация гаплотипов соловья-красношейки на западную и восточную группы, включающие подвиды соответственно их географической привязанности. Для вида в целом показано высокое гаплотипическое (Hd = 0,986) и нуклеотидное (π = 0,00875) разнообразие. Между “западными” и “восточными” гаплотипами выявлены значительные генетические дистанции (D = 0,016), которые оказались в четыре раза больше внутривидовых дистанций по цитохрому b воробьиных (D = 0,004). Для трех птиц из Забайкалья обнаружена значительная генетическая дивергенция, что косвенно может указывать на существование в данной части ареала переходной зоны нескольких подвидов.

 

 

ГЕНЫ ГОРМОНА РОСТА РЫБ. ДИВЕРГЕНЦИЯ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ИНТРОНОВ У ГОЛЬЦОВ РОДА SALVELINUS

М.В. Панькова^1*, Вл.А. Брыков^1,2, В.В. Панькова², Д.М. Атопкин¹

¹Дальневосточный федеральный университет, Школа естественных наук, Академия экологии, морской биологии и биотехнологии, Владивосток, 690600, e-mail: pamarine@gmail.com

²Институт биологии моря им. А.В. Жирмунского Дальневосточного отделения Российской академии наук, Владивосток 690059, e-mail: vlbrykov@mail.ru

 

Сравнивались нуклеотидные последовательности двух больших интронов (C и D) в двух паралогичных генах гормона роста GH1 и GH2 у 8 видов гольцов рода Salvelinus (Osteichthes; Salmonidae). Показано, что скорости дивергенции интронов в двух генах существенно отличаются. Более консервативными оказались интроны в гене GH1, скорость изменений интронов в гене GH2 значимо выше. Эти данные свидетельствуют о влиянии факторов отбора на некодирующие последовательности в ядерных генах. Меньшая конгруэнтность филогенетической схемы, полученной на основе анализа интронов GH1 со схемой по GH2 и с общепринятыми представлениями об эволюции видов гольцов, также подтверждает существование разнонаправленных и отличающихся по силе факторов отбора по интронным некодирующим последовательностям.

 

 

АНАЛИЗ ИЗМЕНЧИВОСТИ МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ

У СЕЛЬДЕЙ (Clupea pallasii marisalbi) БЕЛОГО МОРЯ

А.В. Семенова¹, А.П. Андреева¹, А.К. Карпов¹, А.Н. Строганов¹, Г.А. Рубцова²,

К.И. Афанасьев².

¹Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова, кафедра ихтиологии, Москва 119991

e-mail: anna.semenova@mail.bio.msu.ru

²Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук. Москва 119991 e-mail: afanasiev@vigg.ru

 

Исследовано генетическое разнообразие нерестовых группировок сельдей из различных районов Белого моря на основании 10 микросателлитных локусов. Все локусы были полиморфны, оценки ожидаемой гетерозиготности варьировали от 12.7 до 94.1% (в среднем 59.5%). Степень генетической дифференциации беломорских сельдей была достоверно значима (θ = 2.03%). Уровень попарной генетической дифференциации F_ST варьировал от -0.001 до 0.085 и был достоверно значим во многих парах сравнения. Иерархический анализ (AMOVA) выявил достоверно значимую дифференциацию сельдей Белого моря. 96.59% генного разнообразия распределено в пределах выборок, а 3.41% приходится на межпопуляционные различия. Основная компонента межпопуляционного генного разнообразия (1.85 %) приходится на различия между двумя экологическими формами сельдей - весенне - и летненерестующими. В пределах весенненерестующей формы показано наличие локальных стад в Кандалакшском, Онежском и Двинском заливах.

 

 

АНАЛИЗ АССОЦИАЦИЙ ПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ ГЕНА YWHAE С СУИЦИДАЛЬНЫМ ПОВЕДЕНИЕМ

З.Л. Халилова¹*, А.Г. Зайнуллина¹, А.Р. Валиуллина², Г.Г. Захарова³, Р.Г. Валинуров³, Э.К. Хуснутдинова^1,2

¹Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН, Уфа, e-mail – khalilova.zulfiya@gmail.com

²Башкирский государственный университет, Уфа, кафедра генетики и фундаментальной медицины

³Республиканская психиатрическая больница № 1 МЗ РБ, Уфа.

 

Изучена роль полиморфных локусов rs1532976, rs3752826, rs9393 гена YWHAE в возникновении суицидального поведения в этнических группах русских и татар из Республики Башкортостан. Выявлено, что носительство аллеля YWHAE*С (OR = 1,91) полиморфного локуса rs3752826 гена YWHAE вне зависимости от этнической принадлежности индивида повышает риск суицидального поведения. Кроме того, в группе лиц русской этнической принадлежности генетическим маркером риска суицидального поведения являются аллель YWHAE*T (OR = 2,21) полиморфного локуса rs9393, генотип YWHAE*T/*T (OR=2,73) и аллель YWHAE*T (OR=1,33) полиморфного локуса rs1532976, гаплотип YWHAE*А*Т (OR=1,54) полиморфных локусов rs1532976 и rs9393.

 

 

НОВЫЕ МУТАЦИИ ГЕНА РЕЦЕПТОРА ЛИПОПРОТЕИНОВ НИЗКОЙ ПЛОТНОСТИ У ПАЦИЕНТОВ С СЕМЕЙНОЙ ГИПЕРХОЛЕСТЕРИНЕМИЕЙ ИЗ ПЕТРОЗАВОДСКА

Т.Ю. Комарова¹, А.С. Головина^1,5, Н.А. Грудинина¹, Ф.М. Захарова¹, В.А. Корнева², Б.М. Липовецкий³, М.П. Серебреницкая⁴, В.О. Константинов^1,4, В.Б. Васильев¹, М.Ю.Мандельштам^1,5*

¹ Научно-исследовательский институт экспериментальной медициныРАМН, Россия, 197376, Санкт-Петербург, e-mail: michail@MM13666.spb.edu;

² Петрозаводский государственный университет, кафедра факультетской терапии, Петрозаводск;

³ Институт мозга человека им. Н.П.Бехтеревой РАН, Санкт-Петербург;

⁴ Санкт-Петербургская государственная медицинская академия им. И.И. Мечникова, кафедра госпитальной терапии, Санкт-Петербург,

⁵ Санкт-Петербургский государственный университет, кафедра биохимии, Санкт-Петербург

 

Мы создали коллекцию ДНК от 80 пробандов с клиническим диагнозом семейной гиперхолестеринемии (СГ) из Петрозаводска. С помощью флуоресцентного автоматизированного анализа конформационного полиморфизма однонитевых фрагментов ДНК (SSCP-анализа) была изучена вся кодирующая область, промотор и зкзон-интронные стыки в гене рецептора липопротеинов низкой плотности (ЛНП) у этих больных. В результате у пяти пробандов были выявлены мутации, которые являются вероятной причиной развития СГ в их семьях, в том числе одна известная мутация FH-North Karelia (c.925-931del7) и четыре новых мутации.  Среди этих новых мутаций: трансверсия c.618T>G (p.S206R), инсерция  одного нуклеотида c.195_196insT (p.FsV66:D129X), сложная перестройка гена  c.192del10/ins8 (p. Fs S65:D129X) и однонуклеотидная делеция c.2191delG (p.FsV731:V736X). Три из четырех обнаруженных новых мутаций приводят к сдвигу рамки считывания и преждевременной терминации трансляции и, как предсказывает анализ последовательности, к образованию рецептора без трансмембранного домена, неспособного связывать и интернализовать лиганд. Проведенное исследование указывает на отсутствие сильного эффекта основателя в отношении СГ в Петрозаводской популяции.

 

 

ГЕНЕТИЧЕСКИЙ КОНТРОЛЬ СИНТЕЗА БЕЛКОВ

СЕМЯН БЕЛОГО ЛЮПИНА (Lupinus albus L.)

В.П. Нецветаев¹, И.В. Князева², А.П. Огуля², О.А. Сорокопудова²

¹ Белгородский научно-исследовательский институт сельского хозяйства Россельхозакадемии, Белгород 308001, e-mail: v.netsvetaev@yandex.ru

² Белгородский государственный национальный исследовательский университет, кафедра анатомии и физиологии живых организмов, Белгород 308015

 

Выявляли варианты белков семян белого люпина с помощью электрофоретического разделения их в глицин-уксуснокислой системе полиакриламидного геля (рН 3,2). На основе исследования полиморфизма конглютина самоопыляющейся популяции этой культуры F_→∞ (сорт Дега) идентифицировано два локуса Con A и Con B, контролирующих синтез этих белков. Con A и Con B расположены в одной группе сцепления на расстоянии 11,48 + 3,40% рекомбинации между собой. Предполагается наличие естественного отбора в пользу генотипов, несущих аллели Con A1 Con B2. Установлено, что конглютины A и B (CON A и CON B) несут цистеиновые остатки, которые образуют межмолекулярные дисульфидные связи между пептидами.

 

 

ПРОФИЛЬ МЕТИЛИРОВАНИЯ ЛОКУСА INK4B-ARF-INK4A ПРИ АТЕРОСКЛЕРОЗЕ

М.С. Назаренко^1,3, А.В. Марков¹, Лебедев И.Н.^1,3, А.А. Слепцов¹, А.В. Фролов², О.Л. Барбараш², Л.С. Барбараш², В.П. Пузырев^1,3

¹ Научно - исследовательский институт медицинской генетики Сибирского отделения Российской академии медицинских наук, Томск 634050,

 e-mail: maria.nazarenko@medgenetics.ru

² Научно - исследовательский институт комплексных проблем сердечно-сосудистых заболеваний Сибирского отделения Российской академии медицинских наук, Кемерово 650002

³ Сибирский государственный медицинский университет Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации, Томск 634050

 

Недавно была показана надежная ассоциация однонуклеотидных полиморфных вариантов (SNPs) региона 9p21.3 с риском развития заболеваний, в основе развития которых лежит атеросклеротическое поражение сосудистой стенки. Однако патофизиология данного локуса изучена недостаточно. В настоящем исследовании впервые оценен профиль метилирования ближайших картированных генов ингибиторов циклин-зависимых киназ CDKN2A (p16^INK4a и p14^ARF) и CDKN2B (p15^INK4b) в тканях сонных артерий у больных атеросклерозом. В результате не выявлено аберрантного метилирования ДНК анализируемых участков генов в тканях из области атеросклеротических бляшек и предлежащей макроскопически неизмененной сосудистой стенки у тех же самых больных.

 

ПЕРЕНОС МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК В ЯДЕРНЫЙ ГЕНОМ КЛЕТОК ПЕРЕСЕВАЕМОЙ КЛЕТОЧНОЙ ЛИНИИ DROSOPHILA VIRILIS

Б.В. Андрианов^1*, Д.А. Романов¹, Т.В.Горелова¹, С.Ю. Сорокина², И.А. Захаров-Гезехус¹

¹ Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова, Российской академии наук, Москва 119991

e-mail: andrianovb@mail.ru

² Институт биологии развития им. Н.К. Кольцова, Российской академии наук, Москва 119334

 

Проведен анализ изменчивости фрагментов митохондриального гена atp6 интегрированных в ДНК хромосом в линиях мух Drosophila virilis различного географического происхождения и в пересеваемой клеточной культуре D. virilis. Мы не обнаружили нуклеотидной изменчивости по данному ДНК маркёру среди изученных линий мух. Данный результат согласуется с предположением о мономорфности вида D. virilis. В геноме пересеваемой клеточной культуры D. virilis выявлены новые фрагменты гена atp6, ассоциированные с инсерциями ретротранспозона Tv1, отсутствующие в геноме мух, что свидетельствует об активизации процесса переноса митохондриальной ДНК в ядерный геном клеток пересеваемой клеточной культуры.